Ll_transcript_17829

Id TrinityFTRINITY_DN54554_c1_g2_i16
Name TranscriptLl_transcript_17829
SequenceTGCCCTGTTTGTACCAATTCAATGTACCCTCCAATTCATCAGGTTGGTACTTTCAACAATTTTCATAATATTTTTTGGGTAATAATTTTCCATATATCTT ATGCCATGTGCAACTTATTCTGATGAATTTACTGCCAGAACAAAAAAAAACTTATTTTGATGAATTGAGTGGATTTGTTTAAGCAGATTTTGGATTTTAT TGTTTTTCTTTGGCCATGGGGTTGTGGGATGAGGACACTTTGCTAAATTGGATTTGGCTTTGAAGTTTGGGTTTTCATTACATGGGGAAAACATTGTAAG TCAGTTTGTAATTGTGTATCTGGATTCGGCTGGAATTGATTGTTCTTTAGTGATATTGTTATGGTATTATGACAATACTTGCAATTGTTGATAGCAAGGT GCCAAATCCAGGAATTAACTTTGTTGTCAAATGTTAGTCTCACTTTTTTGTATTTCGTAAGGGCTTGGCGCTGTTAAGTACTTCATTTGTGCTTACTAAT TACAAATTGATTGCTGTCTTAGTACCCAGTGTTTCCAGTTCCTGATATATCAATGCGTTTGAGGGAAGGTTGATTTTGTGATTATGTACATATCCCTTTA AGTATTGAGCCATGTATTTGTTTTTTATGTGTGTTAGTTAACAGTAGAGTTTTGATATCTGTAGCATGTTCACTTATTTCTCATGGTAGCAAGTGCCAAA ATTTGTGGTAAATATTTGTTTAACGCGTTTCAGAGTTGCAAGATTCCTGTGATAGTGTAATATCTTATAATATATGGCCATGCTAGTCTTGTGTCTACAT AATTTGTCTTGATTGAAAATTATTGATATTGTCAAAAGTGACAAATTCAATTCTGTTAGGAATTGTACCTGATTATGAGACTAAAGGCACATAAGTTTCA TTAGAAAACTACATGGGATAGGTATATAGTTACATGGACGATGGAAACTTTAATTGACAACTTGGTAAATGATGTGATCTGAGTGTTGAACAGTAACGAG GATTTTCTATGTTTGTATTGTCCATTTGGATGAGCAGAATGACCGGTGCATTAAGTTATAATTTCACCTTGGAGGTTGTAGTAAACTTGAAAGAACGTGT TCTAAATCTGACACAGGAGAAGTTTCCCTTTAGGACAGACAAGCTAGGTTTGGAGTCTGGACTACATATAAGCTCCCTTAGTGAACATTCACTGAAGTTT TGTTTTCAATTAATTATACTTTTTTACCCATATCTTTATCTAGTCTTTGATTCTGAAAATCTTGTCTTACATGTGCGATACTTTATCTTGTCACTGTTGA AGCTTTAAAATGCTTATGCTTGCCAAAAGAGGGATAATATGTAACACTTAGCTTCTTTGCAGTGTCATAATGGCCACACACTGTGCTCCACTTGTAAAAC AAGGGTGCACAACCGATGTCCAACTTGTCGGCAAGAGCTTGGAGATATTAGGTGTCTGGCACTGGAGAAGGTTGCTGAATCACTTGAGTTACCTTGCAAG TACTACTCCCTTGGATGTCCAGAAATCTCTCCATACTACAGCAAGCTTAAGCATGAGACATTATGCGATTTTAGGCCATATACTTGTCCTTATGCAGGAT CAGAGTGTTCTGTTGTTGGGGATATTCCCTTCCTTGTTGCACATTTGAGGGATGATCATAAGGTGGACATGCACACGGGATGCACATTCAACCATCGTTA TGTGAAGTCAAATCCCCGTGAAGTAGAGAATGCGACGTGGATGCTCACGGTATTCCATTGTTTTGGCCAATACTTCTGCCTTCATTTTGAAGCTTTCCAG ATTGGCACAGCCCCTGTTTACATGGGATTCCTTCGTTTCATGGGCGATGAGAATGA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_43681; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_17829

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_17829

Blastp-
BlastxE3 ubiquitin-protein ligase SINAT3 from Arabidopsis with 92.68% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_016162498.1)
Pfam-
Rfam-
GO-