Ll_transcript_18301

• Id Trinity: FTRINITY_DN54569_c0_g1_i8
• Name Transcript: Ll_transcript_18301
• Sequence: ATTTCCGCAGAGACAGAAAAAAGGTTGAGTCGAAGAGAAGAAAATATGGATGAGGAAGAGCACGAGGTTTACGGAGGAGAGATCCCCGACGTCGAAGGAG ATCACGACAATCCTGACATCGATATGTCCGCCGCCGATGATGACGCCGCCGTGAAGGAGCTCGACGAGATGAAGCGGCGCTTGAAGGAGATGGAAGAGGA AGCCGCCGCTCTCCGCGAGATGCAAGCTAAGGTTGAGAAAGAGATTGGCTCTGTTCAAGATCCTGCTGCTGCTGCTTCTCTGGCAAACAAGGAGGAGGCA GATACTCGATCTGTTTTTGTTGGCAATGTATGAATTACCCTATCCCATGTCATTTTGTTGTATGACTCGTTTGATTTTTTATGTCCTTATGTTTTACTTT GATTAAAAGTGTTTGTATACAATTGAGAGCCCTAAGTATATATTTTCTTATCTCTGTTTTGCCTATGCTATGTTGGAAGTCAGAAGGAAATATTTGAAGT TTTGGGGGATGTCTTATAAAACTCTTGGCAAACCTCCCTTTGTATCCTTCAATGTCTGCCTCTCTGCTTGGGTGGTTAAGCACATATATAAACCCTTCCT AGACCCCATGTGGTAGAAGCTTTTGTGCATTGGCTTGGGTCACCCCTTTTTGTCACACTACTCTTTATTTGACATTTGATAATTGAGTAATTCAGAAATT TGAAACTTCTTGAACTTGTTTATGACCTAGGGCAGACTTGTTCTCAATAAGGCTATCTGTTCATTTGCTATCTCCATTGTCTATTGATTTGGCCTGATTT TGAAGCATGTGATAATTTTATTCATTGGTTTCAATAAACTTCATGTTTGTATTGCATCCTCTTATTATAAAATATTTGAAGCTGTACATGTTCTATTCTG GAGTGAATACTGCTAGTCTTCGGAGATAGGGTTTGACTTTATGTCTCACTATGATCGCAGGGTTACTCTTATTACCCAGGTTGCATAATTAGCGCTGGGA TGCTTTCATTGAATTTTGTGGGTGGGCCAATGTAATTGGTGTTTTTTAATTCTACTAGAGGGGAAGGAGAACATGTATTGTTGTGCTTTTGAATTTTATT ATGATATAAAAAAATTAGAATGTCAAAAGATTGAGGAGAAAAAACATGGAAGTCTCCAAAAAGAAAAAAAGAAAAACAAATGAGAAAATATTTTACAAAA GGAAAAACAGAATGAAGTTGAAAAAGAAAAGAAAAAAAGAGAGAAAGAAATGACAAAAGAAAAAGGAAAATATAGAATATGTTGAGGAAACTGTGAAAGT CGTCTCTTGGGGATGGTTGAAACTGGTACAGCTGGTGGTAGAGTGTGTTAAAGATGCTTCAACTTCACTACTGCAAGAAACAGCATGTGGGTTCTTTTGG AAGAACATTCTGTAAGTGTTGGGAACACAATCTTAGTGACCCATTTTGTTGATTGCAATGAGGTCTATGGTGCCTCCGTTGTGTGTCATTTAGCTTTTCT AAGTCTTTTTTTATCAATTGAACATTGTTTTAATTAATGGCCGACAAATTAGGTGCTACAGTTTTGCTCCTTTGGGGTAACTTGTAGACTATAAGCCTAA TTAGAATGCATGAGAAAGTTTCTTTGTAGTTTGAGGAGCTGGTAAAATGGCAATAAATGTTAAGACTGTTAAAAGCAAACTTTTTTTGATGGGGTGGATT GATTGGTTTAGTTATGCGTTTGGGATCTGGGATATCATATGTTTTGATCAGAGTTGGTGGTTTTTGTAGTAATAAAAATGTTGGTTTCATATGATGTTCG AGGAGTTGGGAAACCACAAATTTCTGTTCATTTATTGGGTGGAATGGTTATGTTCAGAATTCTGAGGTGTCTAATTCCCTGTATTGGATGGGGTCCGTTT TAGAGACTGAAGTATTAATTTAATATATAGTTGAAGGAAAAGAGAAATTGTGCTCTGGAATTTTGTAAAAATTGTCCGAAATGATTATGCAATTCCCCAT TTAATACGTCATGAGCATGTGGTGCACTTTAAGTTAATAAGCTTTTACATTTTAATTTTTTGATTGTTTATATCTGATGATATTGGGTTAATATTATAAA ATGATATTTACCAGTGCAAGAGTCTTGTATATGCATGATGTGATCTATACTGTTGTAGTTCTGGAGTCTAGTTTGTCTTTATAAAATAATAACTAAATCA TATCTGAGCACCTGCTGGATTAAACATGATATGTTGATCATCATTGGCATCAAAATCCCTTTCATTGGTTCGTTGTACAGGTTGATTATGCATGTACACC AGAAGAAGTGCAGCAACACTTTCAATCTTGTGGTACAGTGAACAGAGTCACCATTCTGACAGACAAGTTTGGCCAGCCTAAAGGTTTTGCTTATGTGGAG TTTGTTGAAGTTGAAGCTGTTCAAGAGGCTCTCCTCTTGAATGAAACTGAATTGCATGGCCGTCAATTGAAGGTTTTACCCAAGAGAACTAATGTGCCTG GAATGAAACAATATCGTCCTGGCCGCTACAATCCATACATGGCTTATGGCTTCAGGAGGCCACATCCTCCTCCATACTTTTACCCCTCTTATGGATATGG GAAGGCTCCTAGGTTTACAAGGGCAACTCGGTACATGCCCTATTACTAGAAGTTTGCATGGAATGGTGTTGAAGATATGATGGTCGGTGCATCCTGGACC TGGAGCAATGATTTTTTTGATCTGGGAGCATTGGGTGACATCTACATTGCATACCTTTGATTATTGCCCATGTATCTTCGGCTATAATAGGTGTTGTATG TTTATTTCTTAGTTCTTGAAAGATGATTTACAATTGCCATTGGATATCATGTTAGTGACTGCAATCTGTACTGCGGCTACTATGGTTTACACATTTAAAT TAGTGAATTAAGTCAGAGTTATAATACTGCAAGATGAGTCTTTATAGTTTATACTTGACCTCAGATGTATGTTGTAGACTGCTGTAAACTCATCTGTCCT CTGTCCCTCTTCTGACATGAAAACATATTCATATCTATGTTTTTTGAAATTAATATGCCTGAATCTGATCTGAGTTTAAATGGAGTTTTGGTTTTGTGGG CTTTGATGTATGACATGTTAGTCTTTTGATAGTTTCTATCCTCATTCCTCATCTGTAATCCCTTTTCTGTTATAAGTTTTTATCCTCATTCCCCATCTTT TAGCCCTTGATTGGAGCAAGGAAGTATATGATTACTTGTTGGAGCTGGCCTTGGATTAAAAAAAAGGGGCATAATGTCCTTTTTTGAAGAATCACTATGT CATTTCTATTGTGGCTTTCTTGGTCATTCCATTTCCTTTCTGGAATCTCTGTACCCCATTGTCTGTCTTTTGAATAATAGATGCCAGTTATTCTCCTATT GTTTTGAACACAACGTGGCACTGGCCCTGGCACATGCGTCCTCTGCTTTCCCACTTCAGTTATGATTAAATTTGATGGTATCTTGGCTACCCACATGTGC ATCGCTGGCAGTACCAAAGTGGATGAAATGTTGACAACAATTTGAGATCGGGGGTCTATGACCTGACATTTGATCATGGTGTCACCAATCCTAGCTTGTG CCATAAATGTCTTGGGGGCATAAAGAAAGGTGTGTATTTGTGGAACAAATCATAATTTGTGCCAACATGGCATTAGTTTGTCTATTTGGCCATTAGTTGA CTCCTGGTTTTCCTTTGACCAGTAGCTTTTGACAATAATTGTGACACTTTTTAATGGTATGTAAAAAATAATACAAGTTACCTCTAATGTCCCCAGTTAT CAGTCATTTTTGG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_43771;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_18301

FPKM

• FPAB: 8.9
• FPNAB: 10.5
• LF1: 5.3
• LF2: 5.1
• LF3: 6.2
• LF4: 8
• UF1: 6.1
• UF2: 5.8
• UF3: 7.5
• UF4: 10.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_18301

• Blastp: Polyadenylate-binding protein 3 from Arabidopsis with 76.53% of identity
• Blastx: Polyadenylate-binding protein 2 from Arabidopsis with 81.6% of identity
• Eggnog: Polyadenylate-binding protein(ENOG4111PFV)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G10350)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019463812.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;