Id Trinity | FTRINITY_DN54606_c0_g1_i10 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_739 |
Sequence | CAAAAGAGGCCAAGTTCAAGAAAAAGCATGTCATTCTTGTGGGAAAGAGAAAATCTAAGGTTGCCATTTTTTTTCTTTTTATCTTTATTTCTGCTCTGAC ATAATATCTTTTTATGATAGAAGTTTAGAATGAATTAAGCTGGGGTTAACAACTTAACATAAGGATATTCACCTCCAAATCTGTTGAAGATAGTAGATAT GAAGAGTGAAAAATAAAGTGTGTGTGTGTGTGGAATAAGCATGGGAAGAGGGAGAGTTATTGTGGAGAGAATAGAGAACAAGATCAGTCGTCAGGTAACA TTCTCAAAGAGAAGGAGTGGTTTGTTGAAGAAAGCTTTTGAGCTATCTGTGCTATGCGATGCTGAAATTGCTCTTATCATCTTCTCTAGTCGTGGCAAGC TTTTCCAGTTCAGCACTTCTGACATTAACAAAATCATTGAGAAGTATCGTCAATGTTGCTTCAACATGTCACAGACTGGAGATTTAGTTGAACATCAATC ATCACAGAACCTATACGAGGAGGTTTTGAAATTAAGAGCCAAGCATGAATCTCTTGAGAAGACACAAAGGATTTTTGAAGGAGAAGATCTAGGGCCACTT AGCATGAAAGAATTGCAGAGTCTTGAGAAACAAATTGACAGAACGCTCTCACAAGCACGACAACACCATATGCAAAAGCTGACTGCACGAATTGATGAGT TACGCCAACAGGTTCAGAATCTGGAGGGGGTTAACAAACAATTGGAAGCCAAGGTTTTCCGATCCCTTTTAATTATTATATGTCAATATATGTATAGTTG AGGAATTAATGCTATAAAAACTTCAAATAATTTACGGGCTCATACATAGTCTATCATTTATACTCATTTTCAAACATTTGCTCCAGGAAACGGATAAACT CACCCACACCATTGGGGAAGTTTCTAATAACTCGACCACGTCGGTTTGCAGTTACAACGATATTAGGTTGCATGATGTACAACCCAAACACTTTGAATCT GGGACAGCCTTACAAACATGGTGTGCACTTTATTATAATTTTTAGTCTTTTTATTTTACTTTAATTTATAAATATGTAGATGCATTATTCTCCTGGCTAA ATTTAACTTGGTTTCTGCAACACCACATATAGTCCATTGCAATGTCTTGACTGCAGTTTTAAGTTTTGGCAATTGCATGTCTTGAAGAATATGTGTACAT AGAGTATGCAGTCAACTATAAATAAATGTGTTATTGTCTATTTTTTGGTATAATATTATCTATTCAGATTGTTATTTTAATGACACAAATTTATTTCTTA ATTATACCTAATAAGCTAGTGTCTATATAAGCTTTGTCATGTGACCTACCCGGTGCTGATGGCCATATTCACATGCATCTTGTTAATATGAATATGGTAA TGGATTTTTTAAGCAGAAAACTATTTTATTAATAAGAGAGAGACGTTTGATAACACTCATCTCAACTAAGTCAATCACCATATTTTGCAAAGAGTGGCCT AAGAAGAAAGAACTAATAGATAGCAGGTTAGTATTGTTGGAAAGTAAGTTTTACATCGCCTATCTCATCATTGTCTTGAGAATAGTTTAAATATCTGTTA AACTACTTCTTTCATTACCAATTGATTCTGAGAATAGAATACGATGATAGCACGTTTGGTAACATGCATCTATCTCAACTTGTTTGTTTGTTTTATTTAA ATAAATTGTTGTTGCAGTTGGTTTGGGCATAATCATCAGCAAGCTGGTTCAAATGTAAGCAGGAGTGACACAAGGAGCGAGCTAGGCCAAAGCAGTCATA ACAATAACAATAACAATGGATGGCTGCTTTGAATAATATTCATGTTAATTACAAATAATCAAACAAAAAATGTTCATGTTATTATTGCTTGTTATGTGTA TCAACTAAATTATAAACTTGTACCAGTAAGTCTCATAAAAATATCTATAATTGATGGATTCCATTGCAATGTAGCCAGCCCAAAATTAAATTATATGTTT ATGTAGACAATATAGCAATTCCAAAAACAAAAACTATTGCCATGTACCCTTATAACTAATCATTTAAGTTTGATTTTACCACAGGGTTCTAAAATTGATT ATTGATTGAACAATGGATAATTAATGTATGATTTCAATTTGAATATTTAAAATGTATTTAAAATGGGGCATGCGGTGCAATGAGAGTTGAGAAATAGATA AGCTTTATAAGAGGGTGAAATTGATGATTAATGATTAATTAATTGGTGAATGGAATCTCTCTCCTTCCATGCCTGCATAGTAATAATAGTGATAAAGTAA AGATCTGATTTTGCATTACTCATCCTCTTTCTTTCAAACCAAATCCATCCTCCATGGCAAATATTACCCCCTCAGGTAAATATGATAATGGCACAAAAGG AGAAAGCAAAGAAACAAGCGCACTGGTTGTTTCCTTTGGTGAATTGTTAATAGACTTTGTGCCAACAGTGACCGGAATATCACTAATTGAAGCTCCCGCT TTCAAGAAAGCCCCCGGCGGCGCTCCTGCAAATGTGGCTGTTGCCATCTCTAGGCTAGGAGGTTCATCTGCTTTTGTAGGGAAGGTTGGAGCAGATGAAT TTGGGTATATGTTGGCTGATATTTTGAAGCAGAACAATGTTGACACATCTGGCATGCGGTTTGACTCTAATGCAAGAACTGCATTAGCTTTTGTTACACT TAGAGCTGATGGTGAGCGCGAGTTCTTGTTTTTCCGAAATCCTAGTGCTGATATGCTTCTTCATGAATCAGAGCTCGATAAAAATCTCATAAAGCAGGCT AAAATATTACATTATGGTTCCATCAGCTTGATTGATGAGCCATGCAGATCAGCTCATCTTGCTGCTTTGAGAATTGCTAAAGACTCTGGTTGTATTCTCT CATATGATCCAAATTTGAGATTGGCACTATGGCCATCAGCAGAGTCTGCCCGGGAAGGCATAATGAGTATATGGGATCAAGCTGATGTCATAAAGATAAA CGAGGATGAGATTACATTTTTGACTGGTGGTGATGATCCTTATGATGATAATGTAGTACTAAAGAAGCTTTTTCACCCTAATCTCAAGCTTTTAATTGTT ACTGAAGGATCAGAGGGTTGTAGATATTACACCAAGGATTTTCGGGGCAGGGTTGCGGGCGTTAAAGTCAAACCTGTTGACACAACCGGTGCTGGTGATG CATTTGTTGGTGGCTTTATCTACAGCATAGCTTCTGACCAAAATGTTCTCAAGAATGAAAAGCGTCTCCGAGAAGCTCTACATTTTGCAAATGTATGTGG TGCCATCACAGTAACAGATAGAGGGGCTATTCCTTCACTACCTACAAAAGAAGCTGTCCTTCAATTCATGTTAGAAGCCACTACAATATAAAAAAAATGT AACCATTTGTTGTTAAGCTTATATAGCTTAGTTCATGCTAAGCTTCTTGTATCTTCATGCTTGGTGTAATTTTGTGATATAACACTGAAGGTTCAATTTG CATTGCTCGCTCAGGTTATAGCAGTTGAGCATACATTTTCATGTTTTGTAATAAAGCAAAGGCATTGATTTTAAAGATCCCTCACAAGCTTTGTGAGTTA TGATTGTTATTCACACTGACAGACAAAGCTTATTTCATGGCAGGGCATTAAAAATGAACTTGTAAAGTATTGTCTTTTATTGTTAAGAATGAACTTGTAA ACCAACGâBLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_44171; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_739
Blastp | Probable fructokinase-7 from Arabidopsis with 75.07% of identity |
---|---|
Blastx | Probable fructokinase-7 from Arabidopsis with 75.07% of identity |
Eggnog | pfkb domain protein(COG0524) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G51830) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442167.1) |
Pfam | pfkB family carbohydrate kinase (PF00294.23) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |