Id Trinity | FTRINITY_DN54606_c0_g1_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_729 |
Sequence | CAAAAGAGGCCAAGTTCAAGAAAAAGCATGTCATTCTTGTGGGAAAGAGAAAATCTAAGGTTGCCATTTTTTTTCTTTTTATCTTTATTTCTGCTCTGAC ATAATATCTTTTTATGATAGAAGTTTAGAATGAATTAAGCTGGGGTTAACAACTTAACATAAGGATATTCACCTCCAAATCTGTTGAAGATAGTAGATAT GAAGAGTGAAAAATAAAGTGTGTGTGTGTGTGGAATAAGCATGGGAAGAGGGAGAGTTATTGTGGAGAGAATAGAGAACAAGATCAGTCGTCAGGTAACA TTCTCAAAGAGAAGGAGTGGTTTGTTGAAGAAAGCTTTTGAGCTATCTGTGCTATGCGATGCTGAAATTGCTCTTATCATCTTCTCTAGTCGTGGCAAGC TTTTCCAGTTCAGCACTTCTGACATTAACAAAATCATTGAGAAGTATCGTCAATGTTGCTTCAACATGTCACAGACTGGAGATTTAGTTGAACATCAATC ATCACAGAACCTATACGAGGAGGTTTTGAAATTAAGAGCCAAGCATGAATCTCTTGAGAAGACACAAAGGATTTTTGAAGGAGAAGATCTAGGGCCACTT AGCATGAAAGAATTGCAGAGTCTTGAGAAACAAATTGACAGAACGCTCTCACAAGCACGACAACACCATATGCAAAAGCTGACTGCACGAATTGATGAGT TACGCCAACAGGTATATATGCAACCATTAAAAACTAAAAATACTATGAAAGTGTTGTATGTACTGTTGGATTTTGATCCATGTGAAATTATAGGGTGAAA GAAAAATCTAACAAAGCCAAAACATAGAGAATTATATCCACTACTAGCACTCTTAAAATTTACCTTACTATAAGAAAAATGTACTTCGCTGGTTTGCTTA TTGAGAAATCATATGATGACTAGTGAATAATGATTATCAGTTCTCATTATCTACGTACATGACTAGATATATATTTTGGCAGGTTCAGAATCTGGAGGGG GTTAACAAACAATTGGAAGCCAAGGTTTTCCGATCCCTTTTAATTATTATATGTCAATATATGTATAGTTGAGGAATTAATGCTATAAAAACTTCAAATA ATTTACGGGCTCATACATAGTCTATCATTTATACTCATTTTCAAACATTTGCTCCAGGAAACGGATAAACTCACCCACACCATTGGGGAAGTTTCTAATA ACTCGACCACGTCGGTTTGCAGTTACAACGATATTAGGTTGCATGATGTACAACCCAAACACTTTGAATCTGGGACAGCCTTACAAACATGGTGTGCACT TTATTATAATTTTTAGTCTTTTTATTTTACTTTAATTTATAAATATGTAGATGCATTATTCTCCTGGCTAAATTTAACTTGGTTTCTGCAACACCACATA TAGTCCATTGCAATGTCTTGACTGCAGTTTTAAGTTTTGGCAATTGCATGTCTTGAAGAATATGTGTACATAGAGTATGCAGTCAACTATAAATAAATGT GTTATTGTCTATTTTTTGGTATAATATTATCTATTCAGATTGTTATTTTAATGACACAAATTTATTTCTTAATTATACCTAATAAGCTAGTGTCTATATA AGCTTTGTCATGTGACCTACCCGGTGCTGATGGCCATATTCACATGCATCTTGTTAATATGAATATGGTAATGGATTTTTTAAGCAGAAAACTATTTTAT TAATAAGAGAGAGACGTTTGATAACACTCATCTCAACTAAGTCAATCACCATATTTTGCAAAGAGTGGCCTAAGAAGAAAGAACTAATAGATAGCAGGTT AGTATTGTTGGAAAGTAAGTTTTACATCGCCTATCTCATCATTGTCTTGAGAATAGTTTAAATATCTGTTAAACTACTTCTTTCATTACCAATTGATTCT GAGAATAGAATACGATGATAGCACGTTTGGTAACATGCATCTATCTCAACTTGTTTGTTTGTTTTATTTAAATAAATTGTTGTTGCAGTTGGTTTGGGCA TAATCATCAGCAAGCTGGTTCAAATGTAAGCAGGAGTGACACAAGGAGCGAGCTAGGCCAAAGCAGTCATAACAATAACAATAACAATGGATGGCTGCTT TGAATAATATTCATGTTAATTACAAATAATCAAACAAAAAATGTTCATGTTATTATTGCTTGTTATGTGTATCAACTAAATTATAAACTTGTACCAGTAA GTCTCATAAAAATATCTATAATTGATGGATTCCATTGCAATGTAGCCAGCCCAAAATTAAATTATATGTTTATGTAGACAATATAGCAATTCCAAAAACA AAAACTATTGCCATGTACCCTTATAACTAATCATTTAAGTTTGATTTTACCACAGGGTTCTAAAATTGATTATTGATTGAACAATGGATAATTAATGTAT GATTTCAATTTGAATATTTAAAATGTATTTAAAATGGGGCATGCGGTGCAATGAGAGTTGAGAAATAGATAAGCTTTATAAGAGGGTGAAATTGATGATT AATGATTAATTAATTGGTGAATGGAATCTCTCTCCTTCCATGCCTGCATAGTAATAATAGTGATAAAGTAAAGATCTGATTTTGCATTACTCATCCTCTT TCTTTCAAACCAAATCCATCCTCCATGGCAAATATTACCCCCTCAGGTAAATATGATAATGGCACAAAAGGAGAAAGCAAAGAAACAAGCGCACTGGTTG TTTCCTTTGGTGAATTGTTAATAGACTTTGTGCCAACAGTGACCGGAATATCACTAATTGAAGCTCCCGCTTTCAAGAAAGCCCCCGGCGGCGCTCCTGC AAATGTGGCTGTTGCCATCTCTAGGCTAGGAGGTTCATCTGCTTTTGTAGGGAAGGTTGGAGCAGATGAATTTGGGTATATGTTGGCTGATATTTTGAAG CAGAACAATGTTGACACATCTGGCATGCGGTTTGACTCTAATGCAAGAACTGCATTAGCTTTTGTTACACTTAGAGCTGATGGTGAGCGCGAGTTCTTGT TTTTCCGAAATCCTAGTGCTGATATGCTTCTTCATGAATCAGAGCTCGATAAAAATCTCATAAAGCAGGCTAAAATATTACATTATGGTTCCATCAGCTT GATTGATGAGCCATGCAGATCAGCTCATCTTGCTGCTTTGAGAATTGCTAAAGACTCTGGTTGTATTCTCTCATATGATCCAAATTTGAGATTGGCACTA TGGCCATCAGCAGAGTCTGCCCGGGAAGGCATAATGAGTATATGGGATCAAGCTGATGTCATAAAGATAAACGAGGATGAGATTACATTTTTGACTGGTG GTGATGATCCTTATGATGATAATGTAGTACTAAAGAAGCTTTTTCACCCTAATCTCAAGCTTTTAATTGTTACTGAAGGATCAGAGGGTTGTAGATATTA CACCAAGGATTTTCGGGGCAGGGTTGCGGGCGTTAAAGTCAAACCTGTTGACACAACCGGTGCTGGTGATGCATTTGTTGGTGGCTTTATCTACAGCATA GCTTCTGACCAAAATGTTCTCAAGAATGAAAAGCGTCTCCGAGAAGCTCTACATTTTGCAAATGTATGTGGTGCCATCACAGTAACAGATAGAGGGGCTA TTCCTTCACTACCTACAAAAGAAGCTGTCCTTCAATTCATGTTAGAAGCCACTACAATATAAAAAAAATGTAACCATTTGTTGTTAAGCTTATATAGCTT AGTTCATGCTAAGCTTCTTGTATCTTCATGCTTGGTGTAATTTTGTGATATAACACTGAAGGTTCAATTTGCATTGCTCGCTCAGGTTATAGCAGTTGAG CATACATTTTCATGTTTTGTAATAAAGCAAAGGCATTGATTTTAAAGATCCCTCACAAGCTTTGTGAGTTATGATTGTTATTCACACTGACAGACAAAGC TTATTTCATGGCAGGGCATTAAAAATGAACTTGTAAAGTATTGTCTTTTATTGTTAAGAATGAACTTGTAAACCAACG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_44171; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_729
Blastp | Probable fructokinase-7 from Arabidopsis with 75.07% of identity |
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Blastx | Probable fructokinase-7 from Arabidopsis with 75.07% of identity |
Eggnog | pfkb domain protein(COG0524) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G51830) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442167.1) |
Pfam | pfkB family carbohydrate kinase (PF00294.23) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |