Ll_transcript_477

• Id Trinity: FTRINITY_DN54612_c4_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_477
• Sequence: TATAAATTAAAGAAAATTAATTGAGAATAACATATTATGTTTTCTTATTTAGAAAATTTGGAGGATTTTTTTGTATGAAATTTGAGAAAGTCAACTTTGA TATCTGAATTATCATCCTCTAATAACACCAAATCTTCAATCAATTGAGCAAAGTAGTGATGATGAAACTCTTCGATGCACACTGTCATTTACAGGACCCA AGAATCTTAAGCAAAACACCGAATCTTATTAAAACTGCTCAAAATTCAGGTGTTGTTCATTTCGTTGTTAATGGAGTTTGTGAACAAGATTGGCATTTAG TTAAGGATTTGGCTCAAACTTACCCTTCTATCATTCCTTCCTTCGGTCTTCATCCTTGGTATGTTGCAGATAGGAGTCCTAATTGGTTTAAGACATTGAA AGAGTATCTTGATTCTACTCCCTCTGCTGCTGTTGGAGAGATTGGAGTGGACAAAGGATCACATGGAAGGACTATTGATTTTTCCGAGCAGGTTGGCGTA TTGAAGCAGCAGCTTGAACTTGCAAAAGATTTAAACAAGCCAGCATCTGTACACTGTGTTCGTGCTTTTGGTGACCTTCTTGAGCTAATGAAGTATGAAT ATCTAATCTCCCTATTTTGTTTCAATTGTTACTTGAAGAATTGTTCATGAATAATGATCTGAATTTGTAAAAAAATTGAGATGTAAACATTTCTTTTGGA AATGTAGAACAAATATCGAGCATTCTTCCAACAACTTATGCTCTTAGAAGAGTTGGTGCTTGACATGGTAATATAGCAATATCCACCTTCGAGAGTTTGT CATTTCCCAATATTGAGTTCATCTTACTCATTTATACATTCCATCCTTAGTTTGTTCCATAAAACTCCTTCGTACTGGTGTCCTTTTCTCTCCTTAAAAT TATTTTGCCTATAGCTATGGTCTCTCCTATTTTCTTCGCGGAGACAAAACTTGATTGGCTATTAAGAAAATCTTGGCAATTGTGAAAAGGTCATATTTTA AACTGAGTTGCTATATCCTTATTTTTTGTCCTGATTTTTAGGGGACTAAGCATTTGTTTCTGTTGTTGGAATTCAAGCGTTGAGAGTGTGAATGAAAGTT GCATATTTAATAGGAATGGACACGGGGAGGACTAGGTATAGTGAAATGACCTATGAACCTAATGTCTAGAGGGTTTGGGTTGGACATATCATCACTGTTG GATCCACTGGTGTGGTTCCTTTGCAAAGTCCATTGAAATTGATCTCCATGGTATTGTTAGACTAACCCCTTACTGAGCAAGTAGTATTACAGCCGGTTGT TCAGATTGGTTGGATGAGTATTGGCAAAACACTGGTTGATAAATGGTGGTATGAGCAGGTGGTCAAACCTGATGACTAGCTGTAACACGTGGAGGCATGC CTCAGTGAATAGTCAATCGCATAAACGTATGACCTGGCTCTTGGAAAAAGGAAGGCCTGATTAGTGGCCTGGTTCATGTGACGGTCGTCGGTCTGTAACA CTGATCAAGATGTGGCCCAGTTTGTTGAAGAGTGGTAATCATTGGCATTGGAGATTCATTGCTTTTGGAAAACATGGGATTGGTGCGCTGGGATTCCCCC TGAACTTAATAGTCAGTGGCATGTTAAAAATATAAAACCAATCTTGAGATTTCTCTTAATGGCTTAAGCTCTTAGAATAGTTAGTCCTTCACACTTCCTG CAGTAGTGATGCTATGAAAAAAGGAAATACCTATTTATATGGATGTATTCCATATTTTACTGCCGGTTGTAACAATCTGTTTTCACTAGATCTGAATTTT TAAACTTGAGATTTGTTGAATGGAGCAGTCTAGAAGTATAAATATTTATTCAGCCAATTGTCCTTTCAACATTAGTTAAGTCAGGTCACGTGTCCCGTTT CTGTAAGCTTTTTCAAGTGTTCAAGTCTATTAAATGATAGAGGGAAGGCTTCCGTTCTTCCTTGCAAGAAATGGAATCATGATTTCTTTTAGTTGTTTAT TTGTTTCCATAAACTGTTTTGAATTGCTGTCAAATTTAGTTCCTACGCAGTATCGAGGACGAGTTTTTTCCGGCTATTGTAGAATTTGACATTAATTTAG TAATCCCTATTCGGCATCCTACACATTCCCTCCTACATTTATCTTATACTTAACTCATAACAAAAATGGTGAACTGCTTGTATTTTTATTAGGGAAATCA GTAATCTAAGACTTGGTCTCATCTTATAAAGAAATAAACCACATTTCAACTGCTTGTATTTTTTTCTCGTCATGAATGGTTTAAATTTGGAAAATATGAG TCTGTGTTCTTCGGTTTGTTTCAGATAATGTTATCGCCTCCGGAAGACATTGTGAAGTAGGGCAAGAGTCTAGATAGGGTTCTCCCAAGGGGTGGAGAAG GATTGAGAGAGACATGAATCAAACACAGCCAATAGAGTGGTTGTTTTGGTATGACAAACCTGGAAAGAAGAAAATTCTTACTGATCCTACTTATGGATTT AAGATTCAGGAAATTGGTCTGCTATACTACTGCTGAGGGTTTAGCCTATAATATGGTGCAAGCTAAGAACTTTCAAGTTAGACATGACTTGCAGACTACA TTTATTGCCAATTCTTAGTTACAATTATTATACTTAAACTTCCTCGGCACAACTTACTAGAAAGCAAGTTACAAGAAACTGCGAAAATGTACTCCTTGGC TCTTACCACTAACCCAAACCTATTAAGATTCCTTGGTACATAGAAATAACTAGAATTCTTAAAGCATAAACATGGCCTGAAATACTACCCATAACAAGAA GCTATGAAAGTTTTAGAAATTATAAAAAAAGAACCTGCTCATAAAATGTGTAGGATACCTTGGCTCCACGCAAGGTAAGGTTACGTACATCTACCCTTCC CAGACCCCACTAAGTAGAAGCCTCATACACTAACTTGCGAGAGTAGTTAGTAGTTACAATTTAGTTATATAGAAGAATAATTTGGCTCAGAGGCTTACTT CCTGATTATTTTCATAATTGGTCATTTTTGGTTAACATGCTTGGTTAGATTCTCATTATCCAATGGAATGCCATGGAATTAGTGTTATATTGATATTGAT GTTTTTATTGAGCAATCCGAAGTGGCATCTTCAAAATTGGCCGCCTTAAAATTTTCAACATATCCAGGTCTGTGGGACCTTTTCCTGCTGGTGTCATTCT TCATTCTTATTTGGGTTCTGCTGAGATGGTTCCTGAATTTTCCAAGCTTGGGGCTTATTTTTCCTTCTCAGGGTTTCTTATGTCACTAAAAGCAAGCAAG GCAAAGAGAATGCTGAAGATGGTCCCTTCTGATAGGATTTTGTTGGAGACTGATGCTCCTGATGCACTACCAACTTCAAACATAGATTCTCTTTTTTTTG TTGAAGGAGATACTTCTCTCCCCAAAGAGCTTCATGACCAAAGAACTTCATCCTCAACTTCTACTTCATTCAGTAATTCATCCCAAGTCGTGACAGATGC TTCGATGTTGTCAAAGGAAACTCTCAATCATCCGGCTAACATTCGTAGTGTATGTAGCTCATGCCTTTAATGTCACCTTGATTTTTCAAAATAAGCATCT GTCACTATATCATTCTCTTGGAGATATATGTTAATTTTTTGTATAGATAAATATTATTTTAGCTTGGTTTCTGGAGATAGTAATTAGGAATAAATTGCCC TGAACTCCCTTGAAGCTTTCAAAAGCTGCCTCTTAGCAGTCTGTAGTTACCAAAATTTCTCCAATATTAGTGTTATTTCATGCATAAGAAATGCTATATG GACGGTGTAGGTATAAGGAAATGAATTCAACCCGGGTATAGGTTTCTTAAACCTGAAGAACTTCAACTTAAGCGAAAGATCTGATCCAACTGAAATCCCG CATATCCAGTCGAAGGCTAGATCCCATTTGGTAGTTCAAGTAGAGATTTTAGGCTAGCCATCTTTCAGTGCAAAGGAATTACACTTAACTTCAGGGATTC AAATGCAATATTTTACTATATCAGTAAGGATGAAACATGGCAAAGCCTCAGATGAAACAAGTAGGGATATTTGTTAGGTATATTTAATTGAGAAGTCCCA AATTGGATATGAGGTGATGAGTGGGCTACTTTATAAGTGAAGAAGATCTACAAAACCATTTATTTAAGGTTTTGGTTCAAAGTGTGTTGTCTTACTTATG GGTGGCTCTTCGCTCTTCCCATGACCTGGTAAGTGGTAACAATAAGTCTCCCTTGTGGTTGTTCCGGGTCGCGCCTGGGTCCAACAAGTGTTATTTACAC TAATGGCTCGGTTGAGACATGGTAGACTTAAAGGGGGTAGACTAGTAAGTGTATTATACCCACACTTGAAGGAAGATTGCTGGGCATATTCAAGTGTGAA GATCCACATTGGATATGAGAAGATGAGTGAAGCACTTTATAAGTGGAAAAAACCTACGGATTATTGTCTTAAGGTTTTAGTTCAATGTGTGATGTGTCAC TTATGAGTAGCTCTTCACTCTTCTCATAGTCCGATAATAATGGGGCTCTTAGTGGTTGGAGTTTTTCCAGTCGTGGTCGAGTCCAAGAGCATTTGCTATC AGTATATACATCTAGAAGAAAATTCAGGAGGTGTTAACAACTGAACAAGTTGCCAACAGTGTATAGACAACTGTTTGGTTAAATTTATAGTCTTCAATTC ATTCCACTTACAGGTACTTGATTATGTTGCATCTATGCTGGAGATTACCAAAGAAGAACTTGCTGAATTAAGCTACCAGAATGCTGTTCGCTTATTCTCC TATGAAGGTTCCAAAGTACTTCAAAAGTAAACAAAATATCAGGTTCTTTCTTGTAAGAAATTATGATTCCTTACTAGGCAAAATTTATTTGGAAAGTAAC TTTCAGGATATTGAAGCAGATAGATTGGATGATAGTTTGCCTGTTTTCTAAAGTTAATTGTATCAATTGTTTCTGAGCATATAATGGTCATGTTATTTAT CATCAGTTTTATTAGGAAAGGAATATGATAGATATGATATTTGGTTATTTAGATTTAATTAAATAGTTGATAATATATTGATATTTCTACAATGTTCTAG AGTTGTAAGATTATGACACTTGTAGGGTCATCATCGTATCCTATTGTCTTCCTTCTATTTAAATATGGTATTCTTCATCCATAAGACAATCAATGAAAAA TGAAGAACTTTTATTATCTTTTTAAAAAAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_44222;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_477

FPKM

• FPAB: 0.6
• FPNAB: 0.3
• LF1: 0.2
• LF2: 0.2
• LF3: 0.3
• LF4: 0.2
• UF1: 0.1
• UF2: 0.2
• UF3: 0.1
• UF4: 0.3

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_477

• Blastp: Uncharacterized metal-dependent hydrolase YjjV from Escherichia with 29.63% of identity
• Blastx: Uncharacterized metal-dependent hydrolase YjjV from Escherichia with 29.63% of identity
• Eggnog: tatd family(COG0084)
• Kegg: Link to kegg annotations (JW4341)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0000065)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019442900.1)
• Pfam: TatD related DNase (PF01026.20)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;