Id Trinity | FTRINITY_DN54612_c4_g1_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_478 |
Sequence | TATAAATTAAAGAAAATTAATTGAGAATAACATATTATGTTTTCTTATTTAGAAAATTTGGAGGATTTTTTTGTATGAAATTTGAGAAAGTCAACTTTGA TATCTGAATTATCATCCTCTAATAACACCAAATCTTCAATCAATTGAGCAAAGTAGTGATGATGAAACTCTTCGATGCACACTGTCATTTACAGGACCCA AGAATCTTAAGCAAAACACCGAATCTTATTAAAACTGCTCAAAATTCAGGTGTTGTTCATTTCGTTGTTAATGGAGTTTGTGAACAAGATTGGCATTTAG TTAAGGATTTGGCTCAAACTTACCCTTCTATCATTCCTTCCTTCGGTCTTCATCCTTGGTCACTTTTCCCCTTTATTCTTATCCAACTTTTTCTTTGTTT ATGTAATTTTGTGAAAAAAATTAACTTATTTTAAGGTTTTGGGTTTTATGGAATTGCAGGTATGTTGCAGATAGGAGTCCTAATTGGTTTAAGACATTGA AAGAGTATCTTGATTCTACTCCCTCTGCTGCTGTTGGAGAGATTGGAGTGGACAAAGGATCACATGGAAGGACTATTGATTTTTCCGAGCAGGTTGGCGT ATTGAAGCAGCAGCTTGAACTTGCAAAAGATTTAAACAAGCCAGCATCTGTACACTGTGTTCGTGCTTTTGGTGACCTTCTTGAGCTAATGAAGTATGAA TATCTAATCTCCCTATTTTGTTTCAATTGTTACTTGAAGAATTGTTCATGAATAATGATCTGAATTTGTAAAAAAATTGAGATGTAAACATTTCTTTTGG AAATGTAGAACAAATATCGAGCATTCTTCCAACAACTTATGCTCTTAGAAGAGTTGGTGCTTGACATGGTAATATAGCAATATCCACCTTCGAGAGTTTG 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AGATCCACATTGGATATGAGAAGATGAGTGAAGCACTTTATAAGTGGAAAAAACCTACGGATTATTGTCTTAAGGTTTTAGTTCAATGTGTGATGTGTCA CTTATGAGTAGCTCTTCACTCTTCTCATAGTCCGATAATAATGGGGCTCTTAGTGGTTGGAGTTTTTCCAGTCGTGGTCGAGTCCAAGAGCATTTGCTAT CAGTATATACATCTAGAAGAAAATTCAGGAGGTGTTAACAACTGAACAAGTTGCCAACAGTGTATAGACAACTGTTTGGTTAAATTTATAGTCTTCAATT CATTCCACTTACAGGTACTTGATTATGTTGCATCTATGCTGGAGATTACCAAAGAAGAACTTGCTGAATTAAGCTACCAGAATGCTGTTCGCTTATTCTC CTATGAAGGTTCCAAAGTACTTCAAAAGTAAACAAAATATCAGGTTCTTTCTTGTAAGAAATTATGATTCCTTACTAGGCAAAATTTATTTGGAAAGTAA CTTTCAGGATATTGAAGCAGATAGATTGGATGATAGTTTGCCTGTTTTCTAAAGTTAATTGTATCAATTGTTTCTGAGCATATAATGGTCATGTTATTTA TCATCAGTTTTATTAGGAAAGGAATATGATAGATATGATATTTGGTTATTTAGATTTAATTAAATAGTTGATAATATATTGATATTTCTACAATGTTCTA GAGTTGTAAGATTATGACACTTGTAGGGTCATCATCGTATCCTATTGTCTTCCTTCTATTTAAATATGGTATTCTTCATCCATAAGACAATCAATGAAAA ATGAAGAACTTTTATTATCTTTTTAAAAAAAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_44222; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_478
Blastp | - |
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Blastx | Uncharacterized metal-dependent hydrolase YabD from Bacillus with 38.57% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000065) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442900.1) |
Pfam | TatD related DNase (PF01026.20) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |