Ll_transcript_484

• Id Trinity: FTRINITY_DN54612_c4_g1_i7
• Name Transcript: Ll_transcript_484
• Sequence: TATAAATTAAAGAAAATTAATTGAGAATAACATATTATGTTTTCTTATTTAGAAAATTTGGAGGATTTTTTTGTATGAAATTTGAGAAAGTCAACTTTGA TATCTGAATTATCATCCTCTAATAACACCAAATCTTCAATCAATTGAGCAAAGTAGTGATGATGAAACTCTTCGATGCACACTGTCATTTACAGGACCCA AGAATCTTAAGCAAAACACCGAATCTTATTAAAACTGCTCAAAATTCAGGTGTTGTTCATTTCGTTGTTAATGGAGTTTGTGAACAAGATTGGCATTTAG TTAAGGATTTGGCTCAAACTTACCCTTCTATCATTCCTTCCTTCGGTCTTCATCCTTGGTCACTTTTCCCCTTTATTCTTATCCAACTTTTTCTTTGTTT ATGTAATTTTGTGAAAAAAATTAACTTATTTTAAGGTTTTGGGTTTTATGGAATTGCAGGTATGTTGCAGATAGGAGTCCTAATTGGTTTAAGACATTGA AAGAGTATCTTGATTCTACTCCCTCTGCTGCTGTTGGAGAGATTGGAGTGGACAAAGGATCACATGGAAGGACTATTGATTTTTCCGAGCAGGTTGGCGT ATTGAAGCAGCAGCTTGAACTTGCAAAAGATTTAAACAAGCCAGCATCTGTACACTGTGTTCGTGCTTTTGGTGACCTTCTTGAGCTAATGAAGTATGAA TATCTAATCTCCCTATTTTGTTTCAATTGTTACTTGAAGAATTGTTCATGAATAATGATCTGAATTTGTAAAAAAATTGAGATGTAAACATTTCTTTTGG AAATGTAGAACAAATATCGAGCATTCTTCCAACAACTTATGCTCTTAGAAGAGTTGGTGCTTGACATGGTAATATAGCAATATCCACCTTCGAGAGTTTG TCATTTCCCAATATTGAGTTCATCTTACTCATTTATACATTCCATCCTTAGTTTGTTCCATAAAACTCCTTCGTACTGGTGTCCTTTTCTCTCCTTAAAA TTATTTTGCCTATAGCTATGGTCTCTCCTATTTTCTTCGCGGAGACAAAACTTGATTGGCTATTAAGAAAATCTTGGCAATTGTGAAAAGGTCATATTTT AAACTGAGTTGCTATATCCTTATTTTTTGTCCTGATTTTTAGGGGACTAAGCATTTGTTTCTGTTGTTGGAATTCAAGCGTTGAGAGTGTGAATGAAAGT TGCATATTTAATAGGAATGGACACGGGGAGGACTAGGTATAGTGAAATGACCTATGAACCTAATGTCTAGAGGGTTTGGGTTGGACATATCATCACTGTT GGATCCACTGGTGTGGTTCCTTTGCAAAGTCCATTGAAATTGATCTCCATGGTATTGTTAGACTAACCCCTTACTGAGCAAGTAGTATTACAGCCGGTTG TTCAGATTGGTTGGATGAGTATTGGCAAAACACTGGTTGATAAATGGTGGTATGAGCAGGTGGTCAAACCTGATGACTAGCTGTAACACGTGGAGGCATG CCTCAGTGAATAGTCAATCGCATAAACGTATGACCTGGCTCTTGGAAAAAGGAAGGCCTGATTAGTGGCCTGGTTCATGTGACGGTCGTCGGTCTGTAAC ACTGATCAAGATGTGGCCCAGTTTGTTGAAGAGTGGTAATCATTGGCATTGGAGATTCATTGCTTTTGGAAAACATGGGATTGGTGCGCTGGGATTCCCC CTGAACTTAATAGTCAGTGGCATGTTAAAAATATAAAACCAATCTTGAGATTTCTCTTAATGGCTTAAGCTCTTAGAATAGTTAGTCCTTCACACTTCCT GCAGTAGTGATGCTATGAAAAAAGGAAATACCTATTTATATGGATGTATTCCATATTTTACTGCCGGTTGTAACAATCTGTTTTCACTAGATCTGAATTT TTAAACTTGAGATTTGTTGAATGGAGCAGTCTAGAAGTATAAATATTTATTCAGCCAATTGTCCTTTCAACATTAGTTAAGTCAGGTCACGTGTCCCGTT TCTGTAAGCTTTTTCAAGTGTTCAAGTCTATTAAATGATAGAGGGAAGGCTTCCGTTCTTCCTTGCAAGAAATGGAATCATGATTTCTTTTAGTTGTTTA TTTGTTTCCATAAACTGTTTTGAATTGCTGTCAAATTTAGTTCCTACGCAGTATCGAGGACGAGTTTTTTCCGGCTATTGTAGAATTTGACATTAATTTA GTAATCCCTATTCGGCATCCTACACATTCCCTCCTACATTTATCTTATACTTAACTCATAACAAAAATGGTGAACTGCTTGTATTTTTATTAGGGAAATC AGTAATCTAAGACTTGGTCTCATCTTATAAAGAAATAAACCACATTTCAACTGCTTGTATTTTTTTCTCGTCATGAATGGTTTAAATTTGGAAAATATGA GTCTGTGTTCTTCGGTTTGTTTCAGATAATGTTATCGCCTCCGGAAGACATTGTGAAGTAGGGCAAGAGTCTAGATAGGGTTCTCCCAAGGGGTGGAGAA GGATTGAGAGAGACATGAATCAAACACAGCCAATAGAGTGGTTGTTTTGGTATGACAAACCTGGAAAGAAGAAAATTCTTACTGATCCTACTTATGGATT TAAGATTCAGGAAATTGGTCTGCTATACTACTGCTGAGGGTTTAGCCTATAATATGGTGCAAGCTAAGAACTTTCAAGTTAGACATGACTTGCAGACTAC ATTTATTGCCAATTCTTAGTTACAATTATTATACTTAAACTTCCTCGGCACAACTTACTAGAAAGCAAGTTACAAGAAACTGCGAAAATGTACTCCTTGG CTCTTACCACTAACCCAAACCTATTAAGATTCCTTGGTACATAGAAATAACTAGAATTCTTAAAGCATAAACATGGCCTGAAATACTACCCATAACAAGA AGCTATGAAAGTTTTAGAAATTATAAAAAAAGAACCTGCTCATAAAATGTGTAGGATACCTTGGCTCCACGCAAGGTAAGGTTACGTACATCTACCCTTC CCAGACCCCACTAAGTAGAAGCCTCATACACTAACTTGCGAGAGTAGTTAGTAGTTACAATTTAGTTATATAGAAGAATAATTTGGCTCAGAGGCTTACT TCCTGATTATTTTCATAATTGGTCATTTTTGGTTAACATGCTTGGTTAGATTCTCATTATCCAATGGAATGCCATGGAATTAGTGTTATATTGATATTGA TGTTTTTATTGAGCAATCCGAAGTGGCATCTTCAAAATTGGCCGCCTTAAAATTTTCAACATATCCAGGTCTGTGGGACCTTTTCCTGCTGGTGTCATTC TTCATTCTTATTTGGGTTCTGCTGAGATGGTTCCTGAATTTTCCAAGCTTGGGGCTTATTTTTCCTTCTCAGGGTTTCTTATGTCACTAAAAGCAAGCAA GGCAAAGAGAATGCTGAAGATGGTCCCTTCTGATAGGATTTTGTTGGAGACTGATGCTCCTGATGCACTACCAACTTCAAACATAGATTCTCTTTTTTTT GTTGAAGGAGATACTTCTCTCCCCAAAGAGCTTCATGACCAAAGAACTTCATCCTCAACTTCTACTTCATTCAGTAATTCATCCCAAGTCGTGACAGATG CTTCGATGTTGTCAAAGGAAACTCTCAATCATCCGGCTAACATTCGTAGTGTACTTGATTATGTTGCATCTATGCTGGAGATTACCAAAGAAGAACTTGC TGAATTAAGCTACCAGAATGCTGTTCGCTTATTCTCCTATGAAGGTTCCAAAGTACTTCAAAAGTAAACAAAATATCAGGTTCTTTCTTGTAAGAAATTA TGATTCCTTACTAGGCAAAATTTATTTGGAAAGTAACTTTCAGGATATTGAAGCAGATAGATTGGATGATAGTTTGCCTGTTTTCTAAAGTTAATTGTAT CAATTGTTTCTGAGCATATAATGGTCATGTTATTTATCATCAGTTTTATTAGGAAAGGAATATGATAGATATGATATTTGGTTATTTAGATTTAATTAAA TAGTTGATAATATATTGATATTTCTACAATGTTCTAGAGTTGTAAGATTATGACACTTGTAGGGTCATCATCGTATCCTATTGTCTTCCTTCTATTTAAA TATGGTATTCTTCATCCATAAGACAATCAATGAAAAATGAAGAACTTTTATTATCTTTTTAAAAAAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_44222;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_484

FPKM

• FPAB: 0
• FPNAB: 1.3
• LF1: 0.3
• LF2: 0.6
• LF3: 0.3
• LF4: 0.1
• UF1: 0.6
• UF2: 0.3
• UF3: 0.9
• UF4: 0.3

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_484

• Blastp: Uncharacterized metal-dependent hydrolase YcfH from Escherichia with 26.47% of identity
• Blastx: Uncharacterized metal-dependent hydrolase YabD from Bacillus with 27.33% of identity
• Eggnog: tatd family(COG0084)
• Kegg: Link to kegg annotations (JW1086)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0000065)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019442900.1)
• Pfam: TatD related DNase (PF01026.20)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;