Ll_transcript_1320

Id TrinityFTRINITY_DN54617_c1_g2_i2
Name TranscriptLl_transcript_1320
SequenceTAAGATATCTTTCCCTAGCTATTGAAACAAGACTTGATTACTATTGTTTTCCCTAATCCAAATGAAATGACAAATGGCCTAAACAAACAAATTGGACATG TTTGGCTTGGAAAAAACATGAGTTAGATAAGCTTCTGTTGTTTGTACAGCTCTTAGATTTCACAATCACAAAACCAGGACCACAGTTGCATACTGATGAT GTCTATTCAAAAACATATTACTTGGTTTCAGAGTTCAAAAAAGTCCACTGGACCATTTACTATGATTTTAATGCACAAAATTGTACATTCATACTGCTTT GCTGTCTTGTTTGGCACACTGTACTTCAAGCTCAAGAAATTACAAGTATATATATATATATATAAGACATTGTTGGTGGTAAGAGAGTTAGTGGTAGCAG AAAGAGTGTGAGAAGAAATGGGTGGTGTTGCATGGACAGAAGAAGAAGATCATATGCTTAAGAAATGCATTGAACAATATGGAGAAGGAAAGTGGCATAG AGTTCCGCTTTTGGCTGGTAAATTGAACTCAATTCTTTTCTGTTATATATAGGAGGGGTATATGCTTTAATGGTTAAGAAAAATGGATCATTTATTAATG GTGCAGTGAGTTATATATGACTTGTAAGATTTATTTGGACACAGCATGAATGTAACTAGTCACTACATTTAAATCAAATGAATGCAAAATTTGAGAACAA CTATTCAACTGGACTTTTATATTCACAAGAGTAACAATAGTTGCATTCATTGTATGTGAAAATTATGATTGACTGATGAAGAAATCAGGAGAAGCATATT TTTTTGATAATAGCGTAATCGAAAATTGGGGCGTGACAGTTGACCCGATTTTCAGTTTTGCGTTAGTAATTTATATAATTGTCCATGGAATTTGATGATT TGTTGTTTAAACAGAAACATGACAAGTAAAACTTCTAAAGACATTATATTCCAATTCATGTAACATACTTTTTTTGTACTGATTAATTGTTCTTCAAATA TTGGTTGGTTTGTTGAAGGTCTAAACAGGTGCAGAAAGAGTTGCAGGCTAAGATGGCTGAACTATCTCCGTCCTAACATCAAAAGAGGAAGTTTTGCTGA GGAAGAAGTGGAAATGATTATTAAGCTCCATAAATTATTAGGCAACAGGTGGTCACTAATTGCAGGAAGACTACCAGGAAGAACTGCGAATGATGTAAAG AACTATTGGAATTGTCATCTGAGTAAGAAACTGAATGCTCTAGAAGCCAAGAACACACAGGTGAACAGAAACACCGAATCAATTAGGCCAAATCAACCAA GAATCATCATTGGTTCAAGCTCAGTAAAGAGAAGGAGCTTGCAAAGTGAGTCTTCAACTGACCAAGGAACTCAACAACAAGAAAGTGCCATTTCCTCTTT AACATTTGATCCTGAAAGAGAAAGCCATATTCTTGAACCACAACAAGAAAACATATATTCATGTTTGGACCAACATGGTGGTATTATTGATGAGTTACCA ATGGATTTCAAATATGAAGGTGTTGAGGCAATGATAAGTGGAGTAGGTAGTAGTAGTAGTACAAATCAATGGGATTGGGATGATTTGCTCTCAGATATGG ATTTGTATAATGGTTTTTCTTCTTAGATTGTTAATGTTCTTAGGGAAGACAATGTTGGTGTTATAGGTTAGTTGTGTATCAACATTAAAATTAGATGTTT TCTATGGATATGGTAGCTAATTGGTGTATTATATTCACCAATTGATATAGTTGCAACCAGTGTTTTAAATTGCAGTTATGGTCGTGATTGCAGTAACGAT TGCGATTGCAGTCATTGCGGACGTTACAGCGGACTGCAGTCATTGCGGTATGAATTATTTTGAATTCGATACGACCTAATGCGGTCCGATGCAGTTGAAT TGCGACTCGATGCAATTGCATTGCGGTCCAATGCGGTTAAGTTGCAGTCTAATGTGGTCACATCATTGTGATTTGGAATCACAGCACAACTGCGGTGCGA TGCGATTGCGTTGACTGTCACAACCACAATATTACGCATGCATCGCAATATTGGGCCGCAATTTAAATCACTGGTTGCAACTGATGCCAAGGATGGAACA TATGAGATAGGGAACAAATATTCCCAACCGTGTCTCACTCTCTGTCCTGGGGCTAATTAAATATTGTCATATAAATAAATAAAAAACTTTTAAAAATAAA ATGGAATATTTTTATATTACTTATTAAAATTTGATCGATCCATGATAAAGAATGAGATATCCTTAAAGATATGTGATCTGTTTCTAGAACATATGGCTAA AAGCTAGTACCAAATAACATGTTCTTTAGTAGCATGCATGTAATATAAATTACAACATTGTTTTTCACTTGCATGAATATAGGGGTTAACTAGGATACAT GGATAAAGAGGATATGCCAAATTTTAAAAATTATCAGATATGGTAACATTATGATACAGTACCAGAACATTTAAAGAACTTGGCCTAAACTTTGTCGTTT CATTGAAAATTTAATAATGATTTGGACTCATTTGCAAAAAATGAAAGGCAAAGACTATTTTATATTTGAAAAGGTGACCTAGTTTTTAGGTTACATGCGA GCTAAGATGTCATATATACTTTTAAGTGGCATTGAAAATAATAGTAGCTTTAGTCTATTTGATAAATTTGAAATAATAGTGCCATTTCCTCTTTGACATT TGATCCTGAAAGAGAGAGCCATATTCTTCAACCAATAATAATAGTGGATTTAATTGAGTTTAATAGTTGTCCAACTCATCTCACAAAATATCACTCATTT TTTCAGTTAACTTTGAGGGTCATTGGCTGAAGAAGATATTGGAAGATAAAAATAGCTTCATCATCAGCTATGAAAAACATAAATAGGAACGTAAGACTAT TTAGATTTTGTAGAAGTATTTATCCATTCAAGTAGATATTACATACTTCTTTACAAATTTTGAGAATATTTGTGAATTCTTTACCGTTCTAGTAAACTAG TTTTAGGTGGACATGTTTAATTTAACATATTTGTAAGTCTTTGTTAAATCTCAAC BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_44281; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_1320

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_1320
BlastpTranscription factor MYB113 from Arabidopsis with 67.86% of identity
BlastxTranscription factor MYB113 from Arabidopsis with 70.45% of identity
EggnogMyblike DNAbinding domain containing protein(COG5147)
KeggLink to kegg annotations (AT1G66370)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019465221.1)
PfamMyb-like DNA-binding domain (PF00249.30)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;