Id Trinity | FTRINITY_DN54624_c3_g4_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_1164 |
Sequence | GGCTGTTGTTGCCAGTTACTCTTGACTGTCGACCCCAGTGATTAAGACTTGGTTGTTGTTGTTGCACATGGTCAATTTCAAGATATAAATATTTTACCCA GATGTGTGGTGGTTCATGTCTGAATGATGCTTAATTAAATCTGTTCAGCCATTTTGTGAGTAACCTTGGATTCAGTGTCTAGCTACGGTAACCTGATTGG CATCTTTAAAGCTGTTAACTAGTCCATATCAAAAGATATCTTACTTGCTCGCAATTTGGATGTGCCCCATTTCTGAGGGTTAACAATTTAACATAACACA CACAAAGGCTAAGTTAAAATGTGCTGCTCTGATGAGATTCCAAATGTTGAGCAATTGTTATTATACAATGTTACAATCTTGTGGCCTGATAATTATATAC CATGCTTCTCAGGGTTAGGAGGAGGAGCCATTACCTTGTAGAAATCTTATGTTAACTATTGAATTCACCTGTCTCCTTGAGCCATCTGGTTTTATTATCT ATTCATATGACCTCAAAGTTTCCAATTCCAACATATTATACATTTGACTGAAGATGAAAGACTGTTATTTTCTGAAGTGTGGTGCAGCATGGCTTATACT TCAATGCTGTTGTAGAATCTTTATGATCAAGATTGTTTGCTCAACTTATTTACCTTGCAGTCTTGGACTTCTATGAATGAGCTATAGTGAAAGAAATGAG CCACTTGACCTTATTTTTGTTAGATATCTTCATTATTGTAGACTTCAAAATGTCTAAAATCAACAGAGGGGGGTCTAGCCTCTGTCCACTGTCATCAATT GAAGCCATTTGAAAGGTAAGGAGAACGAAATATTTCTACCCGCCTATTAGTTGGAATGATGATATGAAATTTAATGCATGAAAGGAAAGGACATCATGCA TGGACATGGCATAAAAAGTTGAGGAAAATGAAATTGGAGCTATAGATGTAATTGCATTTATACTTCAAATAGCCTCTGTATACTGAGGCATGTTCTTCAT TCATTCCGTGGCAGAGTGTGGAAAAAATAGTTTCAAGTAGAATCAGCAAAAGTAGAAAGGCTAAAATCTACTTTGATCATGGTTATATAGCCACTAGTAA GAGAGGGTAATGTTATGGTAGGAAAAGAAATAAAATTAAAACTTATGGGTCTTAAATTAATAAAGTTGGCACACTATATAGTGGTCCTAAATTCACCCAT CTTGCTCCACTATAGGGGACCTGGGCAGTTGGCACATCCATTGAGATCTAACTTCTGAGCTGTTTTTGGTTGTTTTAGTTTCCTTTTCGGTCTTTAACTA ATTTTTTGATCTGGTTTATGTTTACTTTCAGTTTAACGGATTTACCTAAATAATGGGGCCTGAAACAAGTAAATATAAGAGCCAATATCTGCAAACTTCC TTCCTCCAAATTATGTATAACTCTTTCTACCTTTTTTACCTTTGTCATAAAATGTCAAAGTTAACAAAAATAGTGGCACATGGAGTTAACATCATATTTT CTTGGGTCCTGAATGGCCCTAAAAACACTTGTTCATGAATGCAAAGATAGAAAACCTTGAATATACCATTTCATTTTTCTGATGCAATATTTTTGGGTTT AAAAAAAACTCATGTGCAAAAACCCATATTGCAATTAAAGGTTTTTTTAACATCATATTGCAAAAACCCATATCGCAACTCTTTGTTTGATTCCTCTCAA TTTTGTCTATCTCCCTCTTAATCTTTCTTCATCTGTAAATTAGAGAGTGAAGTTTGAAACTTTTTTGAATTGGGTCAAAAAATCACGAGGAAAAGTCTGT AACTTTGTTGAGATAAGAGAAACTAGAAAGTTTTGATTTTAACTTTAAGAGAGAGAGAAAAGAAAGGATGAAGATTCAATGTAACGTGTGTGAAGCTGCA GAGGCTAAGGTCCTGTGCTGTGCAGATGAGGCAGCACTGTGCTGGGAATGTGATGAGAAGGTTCATGCAGCTAACAAGCTCGCTAGTAAGCACCAGAGAG TCCCTCTTTCTATTTCAGCTTCTCCGATGCCCAATTGTGACATATGTCAGGTACCTACCTTCGATATTCTTCAATGAATATGTGGATTGTGGAATCATAT ATTGGGCATGTATGTGTATCATTGCACTTTAGTGTATAGATTGTAGAATCAATTAACTTTGCTAAATTTTCGGAAATAGAACATGGGGTATGATCAGAAG ATGGTGTAATACACTGCAAGATACTTACAAGGTTACTATTGCTAGCTTGTAATCCTAATGCTGCTGATTTTGGTATTCAGTAATGTAGTACTAATATGGA TTTCTCTTATCTATTAGGATACCTAAAACTTCGACTGATCTGTTTAATAGTGCTTTTACTTTATAATCTCACTTTGCATTTAGTGAGAAATGCATCCTAT TTGATATTGTAAATTGTGTAAATTGCATCCACTTTAATTTTATTGGAGAAGATTCACACATATAACTTCAGTCTTTATGGAAGATATAATCTCACATTTG AATATCTTTTTGGAGCTTGAAAAATCCTTCTCTATCCAGTGTTCTTTTATGTTTGATTAATACTTGACATCTGCAGAATCTGACATAAACTTTATTCTGT TGTTATACAAAGACCAGTGCTCTTTTATTTAACCTCTGGGATTTATGTAGTGATATCATCATCGTCTTGACATCTCCATTTAATGTATTTGTAAATTTTG TCACGCCAATCTTCATGCGACTCGGATCCATTGTTGGCCTTGTTGTTGAGTATGAACCTTCTTGTTTTGTTATTTGCTATGGTTCTGTTATATATGTTTT GAGTATCTCCCATTTTAGATAGCTCGTGATGGTAAAGTCTGCTGCTACTTACAGGATACAGTTGGCTATTTCTTCTGTTTGGAGGATCGGGCTTTACTAT GCAGGAATTGTGATGTAGTAATACACACAGTAAATGCCCATGTCTCTGCACATCAAAGGTTTCTGCTTACTGGTGTAAGAGTAGGCCTTGAAGCTACCAA GCCTGGTTCTTCCACATCTCTTGCAAAATCACATTCTGAGGAGAAAATTTCAAACACTAAATCTTCTTCCATCTCAGGAAATGTTTCCCCAATGCCTCAG CCATTCAATCACAATGAAGTGTTACCCATTCAAGTTGGAAGAGTTGGGGAGTTTCCACCACCTAAAGTGTCCTATGGTGTTGATTCTACAGTTGGAAACG TCTCGCACTGGCCCGTTGATGAATTTCCGTGGTTGAGTGAGTTCGGTCAGAATTATAATTGCATGAGTGGATCATCCAAGGTTGACAGTGGTAAACTTTG GGATTCTGATTCTTCTCTTGTAAGAACGTGTGAAGCGGAAATGGACAATGATGATTTCTTGGGGAGTGTTCCAGATTCGTGCTGGACAGTTCCACAGATT CCTTCTCCTCCTACAGCATCGGGGTTGTATTGGCCGAAAGATTCTCAGTATACATCCGATGCTATGTTTGTTCCTGACATATGCTTTTCTCACATGCAAT AGCCAGACAATACTCGGAATAATCCTATTTCTTCAAAAAGGAGGCAACTGTAATTTGCTTAATATAAGATGTTGTGTTTTATTAATCTGGTATATGTGGG GGAACTTTTTAAGTTCTCTGCCCCTTCAGTGCAGTTTGAGTTAATTTGCCACATGGTTCATGGATGTCTCAGTTTCTTCTTCTTGGGAGTAAATTATAAA TATATAACTCTTTTTGTCATCTAAGTTTGATTCCAAGAATTCAATATATGCATTCATGCATTTATTTGGTTATCAAAGAGGTCTTGATCAATATTAGCTG GATAGGTTAGTTAAATGTTTTGCCC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_44349; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_1164
Blastp | B-box zinc finger protein 22 from Arabidopsis with 45.05% of identity |
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Blastx | B-box zinc finger protein 22 from Arabidopsis with 43.29% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G78600) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000728) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019449227.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |