Ll_transcript_2780

• Id Trinity: FTRINITY_DN54627_c0_g1_i17
• Name Transcript: Ll_transcript_2780
• Sequence: GAAGAAAATAAACACTTTTATTTAAAGAAAATTTTAGCAGTTCCAATATAGTTTATTTTGTTATTTACAATCATGTGCGCTTATAATTGTATGACACAGA ATATGCTGTAATATAGAGGACATATTTCGTTTTCTATCTCTAATAGCAAACCTTTCTTTATGCAGGTGGGCAGACAAGTATCAGGTAAGCCTTCTGGTTT CACTCTTGCTTTTTGACTGACGGAGATGAGTAATCATTTTTCAATCTTTACTTTTATAAGATAAATAGTGAGCCCTTGGGATCAGATTTATGTTGTTAAG TGGCTAAGTATTTTATTTATAAGGTCTAAGGACACCTAGTGGGCATGGGTTAGTAGTGTCTAGTAAAGTCAAAATTGTAGTTTAGGAGTTGTGTTTTTGT TGCTTTTTTATAAGTTGTTCGGAGGAAGTTGTTCGATAATTGTAGTGGAGTTCCTAATCATAAGGTTCATGAAGTCTAATAGATCTTTAGCTTGTACTGT TAAAAGCAAACCTCTATTTCATGAGGTCTATAGGTCTTGGCTTGGACGAATGAGCAAATCTCTATCCTTGTTTGGCCGATTCATTATTTGAATATTAAAC CCAGAATTATGTGAAGTTTCTTCTTTTGTGGTTTCTTACACGTTACACCAGAAGAACCAGCTGTTGGCTGTGTTTGATTCATTCTTCTTAGTCCTTCTCT ACTACTTGATAGATTCCTATTTAATGTTTTGTACTCCTTTACCTAAACCAAATTATCTTTAATTAATTTGTTTATCAGGTTAAAAGTTTCACTTTTGTTG TTTGGCTTGACTCCAATGTGCTTCCCTGTGATTTTAACTTCGTAACTTTGCTCTTAAGGTTTTGTTATTACGTAGCCTGTATTTTTTCCCCATCCATTTC CACCACAAATGGATGGGATAAGCATGTGCAACCTAAAACTACATCATTTTAAGATGTTTCAATGTCCTAAAAAGGTGGATAAATTTCTTCTGTCATGTCA TTTCCATTATAATTGGACATAAAAAGTATATTTGGCTATCACGTGATAACAGAACAAACTACAGGGACAGAGTACAATCAAACTACTAAGTTTAAGTCAC TGTGAGTGTGTGGTGTATTGATATCAGTTGGGCCAAACCACAGTGGGATTCTAAATTTAACTTCAGTTTATATGTAGTTTCCGTTGCTTTCCCTCAACTT TTCTTTGGTGTGATTATTTTGGTTCTGTCCACAGGCCATATTGGAGGTGTTACTTTCCAAACACTCAAGCAATAATCTATGTTGTTGATTCAAGTGACAC CGATAGGCTTGTGATAGCTAAGGAAGAGTTCCATGCAATTCTGGAGGAGGAAGAACTAAAAGGAGCTGTTGTTCTCATTTTTGCAAACAAGCAGGACCTT CCTGGTGCCCTTGATGACGCTGCAGTTACTGAGGCTCTAGAATTACACAAGATTAAAAATCGTCAATGGTCTATCTTTAAAACATCTGCCATTAAAGGAG AAGGACTTTTTGAGGGCCTGGACTGGTTGAGCAATACACTCACATCTGGAGGTGGCTAAATGTGTCAGCTTCAACAAGCCATATACTTAGATCGGTTGAA TTCAGCAGAAAGGTTGACTTGGTACCTCGGTTTGACTTTTCATTGTGAATGATGTCATAATAGGATTATCATTGAATGCTCATACTCATGTATTGTGTTC CATTTTTCGTGTTTAAAGATTAAAAATATGAATGGCCATTATTGTATTTTGTACTGAATTTTTCCTCAGTCCTTTTTTTGTATCTCTAAGTCTTCCTCTT GATGTAGTAGGAGCTTCTAAAGAAAATTTCTTCTTCCCATCTGTTTGCACAATCAAGCTTCATGGGTTTATAGTGGCTATCAATTGAGATAGGTGGCTAA TGATGCAAATCTCAAAGGCTTCACCAAATAATAAAAAAGTCTTGAATTTAGATGAGATATTTGTGATGATTTCTAATAACTCTAGTCTTCTAGTGATGTG GATAATGATAAGGTGTCTCCCTCTGTGATGCTGAGTTTTACAGTTCATTTCCTTTTTCAATTTTCTTTAGGTTTTCCTTTGTTACTCTACTGAGGCTAAA ACAACCTATATGTTCATGCAGTGTTTGCAACACCTACTATCATTTTAGCTGGAGTTGAAATCTTTAACATTTTACTTTAGCTTTGATGCCATTTTGAAGC ATCAATGAGATGATAAAAATTTTGGTTTAAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_44384;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_2780

FPKM

• FPAB: 0.2
• FPNAB: 0.1
• LF1: 0.5
• LF2: 0.3
• LF3: 0.2
• LF4: 0.4
• UF1: 0.4
• UF2: 0.5
• UF3: 0.3
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_2780

• Blastp: -
• Blastx: ADP-ribosylation factor 1 from Brassica with 90.74% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (103842229)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_016200853.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;