Ll_transcript_1583

• Id Trinity: FTRINITY_DN54630_c1_g3_i10
• Name Transcript: Ll_transcript_1583
• Sequence: CAAAGGTTCATGCACCTTTCCCATTTCCCATTCCTTCTTGCTTTCGTTTCAAAACAACCATAAAAGTTTTCCCACAAATGAAATAATATACTATAAATCT CACATTAATTTACTAATATAATTCTTAAAAGAGAACAAGGAAATTTATGATTTTTCTTTTTCCTAATAATTCGTTTTCTCCTCTCAATAAATGATACCAA TCTTGGGTTATTTTCATTTCTCAGCAATGATCATTAACAATAGTTTCTCTTCTTCTGCTTTGTCATATTCTTCAACCTCAACACTTTTCAGTGTCTTTGT GCTTTGCTGCATGCATATACTTGTTCAGGTATGTAGTGAAGACAATTCAGTTCAATTCAGACAATGATTTCCTTTGTCTTTTCAGACATGTTATACAAAT TCATAAAGTGTTAAAGATGTTTTTTTTGTTTATTTTAATGGGGATATTAGAGTACCCTTTGAACTAAAAGTGAGATTTTTATTTATTTTACATGTTATAG ATTCTTCTAGAATTGTTTTAGGGTTCAGAGTTAATTGCTTTTTTAGGTAAAGGGTTTAAATTGTTGCCCTATTGAGTATTGATAGGGTTCTGTTTTAAAG TAGCCAACTTTTACAGCTTTGGTTAAAAAGCTTATTTCTTTTGTGTACTTGATTTTATATCACTATTGCAAAATTGATCCGTCAATTAGATAATTTGATA TAAACTTCATGTGGTGTCTATGCACGAATGTTCATTAGTGGCTAATTGATTTCGAGTGTTGAGGACTTATTAGTGCCATGCTTGTAACCATCCATCCCCT ATAGAATTACCACAAATAAGGTATAGTAAACTTTTTTGGTGATGGGTATGTTACTTTTGTTGAAAATACATATGCATAAATGTTATAATTATGTTATACT TTGGTTGTTGATTCAGGTATCTTTGTCATTGTGAATTTTGTTGAATATTGTGATTGTTTAGAATGAGGAATATTGTGATACTTTAAACATTTATAGTACG AGGATTGAGGACTGAATTGGTTGTGTTTTTGTTCCGAGCTTATGTTGCAAATGATGTTGTCTTATTACGTGCATTAGGTCCTCAAACATATTTGTGATAC CCTCCACTATATACCTCTGATATTTGAAACAGTAGTTAGTCTTTCAGCCCATTCTTAATTAGGTATTTGTACCGTACCATAAATTCTATCGTTGATGGAT AAATTTTATCAAATCGATGGAATAACTGTCTTGTTTGATCTTTACACCATACAGTGAGCAGAGTTGGGATGTCTGAAGGAGTAGTTTGATACAACGATGC ATCTGCACTCTGCAGAGAAGTTTGAGTGAAGCTGTATGCTGTGATATAGACTCTTACTATGGAGATAAATGCAAGTTACGACATTGAACTTTCACGTTCT ACAGAAAGAATGCAGCATGAGCTGTGGCCCCTAGATCCAGTTGATCCAAAGAAGGCAAAGTTTCCATGTTGTTTAGTTTGGAATCCACTTCCTGTTGTCT CATGGTTAGCACCCTTCATTGGTCATGTTGGCCTTTGCCGGGAGGACGGAGTTGTTTTAGATTTTTCGGGATCCAATTTTGTGAACATAGATGAATTTGC GTTTGGTGCGGTAGCAAGATATGTGCAACTCGATCGTAGACAGGTACTGTTTCTCAAATTTACTATCGGTATTTAACAGTGCCTCTGCTTCATATTCTTC ACATTCATGAAAGCATGGCACTCATAAACACATGCATGTTTTGTTGTGAGATCCTGCTATGTTTCATTCAACTTTATCTTTGTCGGTGTTATGATTTTGA GGGACTAAAGAACTTTATGCATGAAACTTTTGAGGTCGAACATTGATGTATTACTCAGACACTCATAATTAATCACGATATTGATAATTATGGCACTGCC GGAAATGGGTTGCATTTGCTGCCAGAGGACTCTTTATAGTCAAAACCCTCGATTCATTACCCATATGACTCAAAAGGTGATACCATGAGATATTTAAATC AACTAGCAATAATAAAAAAATTCTCACCTGCTTTTCCTGTCCCAGTTATCAAGTTTGGATGAATAAGGAAAGTTTGTTATTTCATCTTTCTTTATTCCTT TTACAAGCTCACGCGTATATTTGAAATTAGCATTGCTACATTGGTAGATATCATAATATGCAGATCCAAATTAGCACAATAAGTTTGTAGTTGGTTGTTA AGCACAATTAGGTTATTAGTATTAGTGCTTGATTCCAGGATGGTGGTCGATAGTGTAATGATAGGGTAGCTATGGCAACCCCAGTTCTTAGAAGCCAACT TTTCACATTATTCTTTTTGAAGAAAATATGTATCCTTTAACTTGACCCCCTTAATGTATTGTTCTTCTTTAGCCATCTCAATGAAAGTCTTCTAGCTTCG CAACCTTCCAAATCGTAAACCTGTATGATGCTTACGAGTTATTTTTTATTCCACCCTTGAGATGATGTTTTGGTACAACTTCCACATTGTATGACTGCTT CCCATTGGAATAATAACTTCAGCTTTAGTGTTATGTCTCATGTAACCTTAGAATCAATTTTGAAAGCTCATCCCTTCCTTCTTCCCCTTAAAATTTTGGT TGAGGTCAACTTTAACTGTTTTGGAAGTGCTAACTATAATTTCAATTTTGGCATATGTGCAGTGTTGCTTCCCCCCTAACCTATCTGCACACACATGCAA GCATAGCTACCGGCATACCGAGAACGGGACTGCAATCACATGGGATGATGCCTTACAGTCAACCATGCGGTATTTCGACAACAAAACTTACAACCTTTTC ACTTGCAACTGCCACTCATTTGTTGCCAACTGTCTGAACCGTCTGTGTTACGGCGGATCGATGAGTTGGAACATGGTGAATGTAGGAGCCTTGATACTAT TCAAGGGGCACTGGGTTGACTTCAAGTCTGTTGTAAGGTCTTTTCTGCCTTTTGTTGTGGTTGTTTGCATTGGTATTTTCATGGTTGGGTGGCCCTTCTT GCTTGGTTTACTATCCTTCTCTCTACTCTTGATGGGGTGGTTTCTGATTGGTACTTATATAGTAAGGAACCTATTAGAGTGATAGATGCACCTCTTGAAT TGAAGGATGGTTGTGGTTTGTGTAAGAAAAAATTTCATCTTCACCAAATAATAGATGGAATATTGTCTTTATTGTTATTTTGGAACAATAACTAAGTTTA TGATGGAAAGTTCATGAAATTTCTGAAGGAAATGTTATGAGTTCTAAAGAATTTGTGATCTTTTTTTGGTCAATGGTAAATAGTTATGATGCGGC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_44399;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_1583

FPKM

• FPAB: 0.9
• FPNAB: 0.3
• LF1: 0.2
• LF2: 0.1
• LF3: 0.5
• LF4: 0.4
• UF1: 0.2
• UF2: 0.2
• UF3: 0.5
• UF4: 0.6

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_1583

• Blastp: Protein REVERSION-TO-ETHYLENE SENSITIVITY1 from Arabidopsis with 60.78% of identity
• Blastx: Protein REVERSION-TO-ETHYLENE SENSITIVITY1 from Arabidopsis with 62.94% of identity
• Eggnog: Transmembrane protein 222(ENOG4111G1S)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G26070)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019437741.1)
• Pfam: Protein of unknown function (DUF778) (PF05608.11)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;