| Id Trinity | FTRINITY_DN54637_c0_g1_i6 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_891 |
| Sequence | GGAACATAATGGGGTTGAAAAGGGTAGACTAGACACATACAGTTTCAGAGAAAGAAAGAGAGAGGAAAGAGACTATCTCTGTCTCTGATTCTCGACGCAA ACCCAACATCAACTAAGAACATAACTTGTCCGATCTTCTTCTAGAACATTCTAGAACCCTCCCTAACCCTTCCAAATCACAAAAACCGCTTCCCCTGTAA CACTCTACTTCACAAAAACCGAACCGACACAAAAAACCCGGTTCATGGATTTGTACGGTCGAAACCCGATAAGAAATGGGTCTAACCCGGTGAATCAAAC CGAATGGCACTCATCAGGAACCGATACTGGTCTCGAAGAATCTATGTGGCAGTTAACACTTAGTAGCAGTGAATCGTATCCGGAGCGAACCGGAGCTCCG AATTGTGTTTATTATATGCGAACCGGGTTCTGTGGATATGGTGGAGGGTGTCGTTACAATCATCCTCGTGATCGTGCCGCGGTAGTAATTATTTCGTGCT CTTATAAGCAAAACATTTTGTGCATTAGGTTCAATTGAAGTGTTTCTTTGGGAGTGAGTGAGTGATAGTTGGAAGTGGAAATGAGAGATAGTCATAAAAG AGTGAGTATAAAGAAATTTGAGAGATGAATATAGAGCTTAAGTTTCACAATTTGTGATTATGATTGGGCCCGGGGTTTTAAATAATGGCTCCGGTCACGA ATTTGGATACTTCCAAAACCTTGAAATTAGGGACACAGCTGGTTTTGCCACAATTGCGGTCATGATGCGGTTTCGGCAACTTTTAAAATGTTAAAACTTT TGGAAACCTTAACATTTTGGCTTTGTCACGGACCCATATTTAATACCTTGGCTGGGCTCATTAAATAAATTTCCTTTTTTGTGTGGATCAACAAGTATGA AGATCCATTCTCACATATTGTTGTTGTTTCTGTATTTGTCTATCATTCTTGCTTATAATGACACTCTGGTTTTGTTTATTACTGAATGTCAAGGCATTGG GATTGTGTGCTAATAAAATGGTTAATGTTTGATTGTTCACTCATTATTTTGGTGAATATTTCTTCTATTTTTCAAATGAACGTTTTTTCCCCCATTTCTT TTAATAAATTATTACCAGTTGTAAGTTTTAAAAGAGGAATGCAATTAGATTTATTATTTTGTTACAATTTTTTAAATAAGAATGCAGTTGACTTTGAGTA ACTAAACTGTTTCATGTTGGGTAAGTCCAAGAGAATATAGATACTGGATGCTAATATTAATATTTGATTGCATCTCATTAAGAAAACAACATGATTTTGT AAGCATATAATTATGAATTAAGTCGAATATTTCTCAGGTTGCTGCTGCTGTAAGAGCTACAGGGGAGTACCCAGAACGAGTAGGGGAACCTCCATGTCAG TATTATTTAAAAACTGGAACATGTAAATTTGGTGCATCATGTAAATTCCACCATCCCAAACATGGAGGTGGATCTTTAAGCCAAGCTCCACTAAATATTT ATGGATGCCCGTTAAGGCCGGGTGAGAAGGAATGCTCCTACTATTTGAAAACAGGGCAGTGCAAATTTGGTATAACTTGTAAATTCCATCACCCTCAACC TGCTGACACATCTTTGTCAGCTTCTGCACCTCAATTTTATCAACAGGCGCAGTCTCCGACGGTTCCTCTGCCTGACCAGTATGGAGGAGCATCCACAAGC TTGAGGGTAGCTAGGCCTCCTATATTACCTGGTTCATATATACAAGGAGCTTATGGTCCTGTACTTCTTTCCCCAGGCGTTGTTCCATTTCCTGGATGGA GTCCTTATTCGGCACCTGTAAGTCCTGTCTTATCTCCTGGTGCTCAACCTGCTGTTGGGGCTACTTCTCTGTATGGAGTGACCCAGTTGAATTCATCCAC ATCAGCTTTTGCTAGACCATATACTCCACTGCCCTCTTCTTCTGGTCCATCAGGAAACAACCAGAAGGAGCAGGTATTTCCTGAAAGGCCAGGTGAACCT GAATGCCAATATTTTCTGAGAACAGGGGACTGTAAATTTGGATTAGCTTGTCGATTTCATCATCCTAGGGACCGGGTTGTAGCACGGCCACTTCTAAACC CCATTGGTCTCCCTCTTCGTCCGGGGGTACAACCTTGTGCATTTTATTTGCAAAACAATAATTGTAAGTTTGGCTCTGCATGCAAATTTGACCATCCTTG GGGGCCTGTGAGACACAGTGCATCAACATCTTCCTTGATTGATATGCCAGTTACACCTTATCCAGTTGCTTCTTTGCTCTCTACCCTGGCTCCTTCACTA ACATCTTCAGCGCTTCGACCCGAATCACTTTCAGGGTCCAAACTGGAATCCTTTACAACCAGAATATAAAGCCTTCTTGTGGAAGTAATTCCCCTACATC AGTTGAATTTTTTATCAAGGTGGATCTGTCTCACTATTTGTATCTGATGTGCAACTCTCAAGTCAGATTTCTTCCCCTCTAAGCAGTATCTGAAGCAGCA GAGAAAGTGGTGAGATACATTGATCTGGTTAATTAACTAGAAAATGTTCCTCCAAATCACCACTGGTTGTGATTTTATGTGCCACCTTTGTTTAGTAGTG AATATTTAGTAGCAACTGAGCCCCTTCCTCACTGTGTATAAATTCACCATCCTATATTGTTTAGAGTCTACACTAGTTCATTCTCATTATGCTCATATTG TCTAGTTATATATTACATTATCCAGAATAAGCTTCAATGGAAAACTGTATATGGTCTTTCCTTCTGTTTGACAGTATTATTTCTTGATTTATGGTCTTTT GGGAATAGGTTGGATTAACTTTCATGGTATCACTATTCATACATTATTTATGGATCAATATTTTTGTAAGATTTTTGAAGTCTTATGAGTGACGCTAATG ATTAGTGTAAAGAGATAATTGAGTGTTAAACTAACAAGTGTGGCTGTTAAAGATGAAACCTAGAGCTTTTAAGGCCAATTCGAAGAGGGTCCTTGTGGCT GTTAAGGCCATACAATCCGACATAGTATGGTATTTAGGAGTGCTTTTATTTTCAAAATTTGAAGATGAAGATGATACTGTAAGGAAATTTGTTTGAGTGC ATGGCATGTAATGGTGCTCTATAAATTATAC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_44463; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_891
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Zinc finger CCCH domain-containing protein 32 from Arabidopsis with 71.47% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421554.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |