Id Trinity | FTRINITY_DN54649_c3_g1_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_1871 |
Sequence | TATTTTTTAAAGCATTTTTTGTTGAGAGACTCTCAAATCGGTTAGATACTCGGTTCATGGTTGAACCGGTGAGATCGGTCGAAGCCAGAATACTAAACCT AATGATTGAATATGATATTATTAAGGTGTCCGTTTATATACACTTTTTAGTTTTTACAAATTGCTTCAATCCGAGACAAAGGAAAACCAAACCCTCTCAA TTCTCAATATGGCGGCCTCATCTTCATCTCTCTCTTCTTCCTCCACCGACAACTCCCCTTCTCACCGTCGCACCACGCGCCACCACCGCACGCGCCGAGA CCGTCATAACAAGGATTCCCTTAAGATTCGAAAGAAGTCAAAGTCCCACACCAAACGACGTTACAGGCATCGCCACTCTTCCGATTCCGATTCCTATTCC TCTTCCTCGCTCTCTGATTCCTCCAGTTCTATTATTAGGTTTATACCGGTGTTGTGAGAACCGGACCGAAATGGACAATCCGACCTGTTTGACTGCTGAC CAGACTTGAAAACGACTTTGGTTGAGGATTGTAGCACTTTGGACTGGGGAAATTCCGGTCTGAGTATGCTAAACTCGGTTAAACCGGATTAATTCAGGAA GTAAAGCGGACGGTTCCCTTAAAAATTAAAAAAATGGAATACCAATCTAATATTTTCTTTTACGCTGTGACAAAGTCACAAAGATGAGATATTACTTCAA TATAATTATACATAACTATTAATTATATAATATTTTACATTCACGTATAATTATGTATTTCTAGATAAAAAATTATTAATTATATGCAAAAAATCACGCC GTCAGACCGGACGGTTTAATCATTTAAATCGGTTAAACCTAAGGGGGGACTTCATTCAGTTTAAAGTCCGGCTTGGATTTCATAACATTGGTTTATACTT GGTTCCAAATTTTATGACTTTTATGCACATGTTTTGCTTAAATGCGATAGTTAATTGAAGGTTAAATTGTTGCTTTGAACTTTGTCTCTGTCTTAGAGTA TGTTTACTGCACAGAATTAGTTTTTAATTGGATTCGGAATTGAAATAATTATTTGGTTATCTTAGAAACGATTCATTATGTTGTTATGTTTGGCAGGTGT AGGGTAGCTTAGCGTTGTTTTATTTATTTAGGAGGTAAAGAAGGAGGAAAATTAATACCGATGTTGTCAGAACTGAATCTACATTTAACTGGAAAACCTT CCGTTTAAGGTTATAGCTTAGTTACATAATTTTCTCATTAGGTACCATATATCGGGTTTATCATGAAGAATGCCTCATAAAGTTAATGTAAAAAGAGAGG AACTACATATGAAATGAGTCACATACCTTTACCGCTTACTAGGTAACGATGGGTTAGAGCGGATTGTCGGAGAGTAAAAGATCTAAAGTGACTGGCATCC TTAGTTCCTTACATTCATTACACAACTTGGACAATTATTTTTCCCATGCAAAACTTGATTTTAGAATTTTTGAAGTAGCTACAGCTTTCTGATTTCAACA GCACATGAAGGATATTGAAGTATCCGTGATTCGTAGGTTATAACTGCTGAGCTCCCTTTCTCATTTACCATGTTCGATTTTCACAGTTCTAACTTCCATG CTGTTATCTTGTTTGTGACTTTGTGTTGTCTCCTTTTTATCATGGATCTGGAAAGATAATTTCTTGATGATGTTTTGTTTTGCAGTATAGCTGCATGTTG ATTATTTTATTGATATTAAAAACTTCTGGCGTAATGTTAATTTATTGAATGGAATAGTGGATTAATCTGGTTTGTATCGTAAGACTTTGTTTGTTTTGTT AAATTATGACAGAAGTGAGAGTTCTTCTGATAGCGAGCATGAAACAACTCATCGTTCAAAGAGGCACAAAAAGAGCGACAGATCAAAGAAGAACAAGGAA AAGGACCGAAGTAAAAGCCACCGCCATAAACGACAGAAGCATAAATTAAAGGAGGTAGGTCACTTTTTATACTTCAGATGTCTTTCATATGCTTGTTTAC AAAATATTTTGGGATCCCCTATCTATGAAGTTTCAAATTCGCATAGTGACCTTGAAATATCTACGTTGTTGGGGACCTCATATCATTTAGCCAATACTAC TAGGTTCGTCCCGTAAGTTATCTTATGTCTTCTAGTTGGTCACCTGGTCCTGTAAGTTTTTTATTTCAAATAAGTCCTCTACGTTATTTTCTATTTTCAA ATTGATCCTTTAAGTTAATTTTCTGTTTCAAATTGGTCTTAAAATTGTGTTTACATTAAATTTGTAGCCTAAAACCATTTTTTAATGGTGAAGTTTCACA AAAGTAATGGATGGATTGCATAGATATTTATCATTTGAACTCAATGATACTAAAATTGTGAATTTTAGTTGAGAACTGAGAGAGTTTTGAGGAACATCTA TCGATAGGACCAAAACATTGGTTCAATACATCTATCATTGTTCATTTCTGTTACGTTCTCCTGCCTCAAAACATTGGTTCAATACCACATGCTGCTGAAC TAAAAATGCAGAACAGTGAAGGGAAGATAATTATTGATTTTGTTGAAAAGTCGCAGACTTCTTTTCCCTAATATATAACTCCAGTACATGTCTGAGATGC TTATGATACTTTGTGCCTATTTTTATGTTTTTGCTCTTTGAAATTGGAGCTGGGGTCATGTCTGGATGCTTGATTGACTTGCTTGGATGTTTTTCTTGGT TGGGTTTGCCCTGGCAATGTGAGCTATATGTAGAAGCAGCATGGTGAGAGGACCAGCAGCCCCGTGCAGCTTTCCAAGTTTTTAGGGCGTGACAAAGATG ACAGTGTCCGTCGCAGCGCCGTATCGGGCAAGAAGATTCTTCTTAAACTTGATAAAACGAAGGAAGATAAGGCGGCTGAAAGCAAGAGAAATGACTTGCT GAACTTTTTAAATGCTAGTTTTGATTAGCATTGATAAGGTATGGATTTGTTAGGGGATACAACAAAGTCAGAAGTTGGTGCTGAAATTATTTTTCAATTA TAAAAACCAAGTATGGTTCTTCCCATTTGGCGGAGGTAGGGATACATTAAAATCATACTTTACCATTGAAAGTTTGAGTTTGAGTTTGAGTTTGTTCAAC ATGAATGAATGTTTCACCATCCGTGAATTGGTTATGAGCTTTTGTAGGATGATGATCTTTTGGCCCACCAGACTCTGCACATGGTGATTTATGATTAAGC AATCTTTGTTCTGTTTACCTGATTCTTTTTTGATTCATTTTTTATGTGGGCATAATATATGGCTGAATTGTTACAATTTGTTCCACTACTGTTTTTCGCG AGCCTACCAGACCACATCTTCTATCCCACAATATTGTACTACTACATGTGCCATAAGTTTTAATTGATCAGAAAAATATTTAATAATTAAACTTTGAACT TAAATATTTTTTTAATCAATCACAAGTCATGGTACATGGAGTGACACATAACATGGAAAAGTAGATGTGCTTTACCATGCACCACAATGAGTGTCACCTA ATGTGCCATAATCTGTGATTGGTTGAAAAAATACATTTAAATTAAAAAAATTATTAATTAAATATTTTTTGACCAATCAAAACAATGGTACATAGAGTGA TATACTTTTGTGGGACAGAAAATGTCTACCCCAAAGTACAATATGTG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_44572; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_1871
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001566) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019440594.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |