Ll_transcript_1872

• Id Trinity: FTRINITY_DN54649_c3_g2_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_1872
• Sequence: ATTAAGAGTTGACAAAAAGTTATTTCCTTTATGGCTAAGTTCATACTATTGAGCCAGTTTATAAAATCAGGGATTCTCTTTTTGCTTAACTCATCTTTTG TATTTCACTCTGATGCATAGTATTATTTTAAGCTCTTTTCTTTTTCATAGTATTATGAGTGAATTGCCAAGCATTTTATATAAATGTTTAAAAATAATCA ATATTTAACAGCTTATTCTGAGTACCATACTATAACAAAATATGGATACTATAAAGCTCCTTTTATCCTCCTCTTGTTCCACCTTGCTTTTACAGATACC ATTTCCTTATGCCCCCTCTAGTATTCATTTATTAAACTTTCTTTTGTCACTTTAAATTATTGGTCTCACTGATCTCATCATCCTTATAGTCATAAGTGGC ATTCTATTTGTCTTTTAACTTTGTCTATTTATGATGCAGCTTTTCTCCTATAGTAGAGCTGTATGGTGGAGTTTTAAAAAAAAAAAGGAATTTGGAATAA TTTATCTCCTCAAAATTCTACCTAGGATTTCAGCATCTAGGAATTACTGTAATGGAAAAAAGACAATAATTAAGCAATACCATACAGCCTAATATAATGT GCCACTTGCAATTTTTGGCTATGCAAAAGATTAGGATAGGTCTGTCCTAAATAACAATTAAAGTGAACCAATCAGTTATAAAAAAGAAGTTGAATTAAAA CATGTGGTCTGAACATGGTTGGATGAGGGAATCCAATTTTTGTTGTACTGTTGTGTTGATATCATTTTCAGCATCACAACTGGTTCTTTTATCCACAAAA TACATAAAGAATAAGCAAAATGGAACAATTTAGAGTGAGGCCTTGCAAGCACTATCACCAACTTAATTGTATCATGATGTGATTCTACCATACTTTCTAA AAACATATTTTCATCTTATGACCTCAACCCTAATGTTATATAATCTCTAATATGAAGAAAACAAAGATGAAGTCTTTATAACTTATTGGCAAAACATGCA GGTATATAAATAGTGATGACTATGAGGGGGGCTTTACAAACTCAGATATTGAGCAGTTATTGGTGAACATAAAGTCCAACTATGAAAACTGGGTTTCTGC CTTCTCCTTACTAGTAGTGGATCCAAATGATGGGCTTTCAGTGAAGAAATTCCAAGAGTGTTTGAATAGAATGGAAGTTGAAGTTGCAGTGTCCATAGCC AAGACTGTTTTCTGTAGTGACTATAGAGATATACTTGACAAAGTTGAAACTCCATGCATTATCATTCAGACCTCTAATGACATAGTGGTCCCAAACAATG TAGCACTTTACATGCAGAAGAATATTGCAGGCAAAGTTACATCCAAGGTTATAGATGCATATGGTCATTTCCCACAGCTAACAGCTCATCATAAGCTAGT TGAGGTGCTAACCGGAGTTCTCGGTTTATAAATCGAACCACACGGCAGGAACGAACTAGCCAGATTGATGGACTTCAGATGTGGTTGTTCCATGGATAAA AATGTAGTAGAAATCATTCAACTATTGGTGAGTCATAAAACATTTCACAACATTATGTAAAAATGTTTGGCATAGAATTTGTGGCTCTAGCAATTTCCAA TTTAGAAGCACATGGGTTTATTGGCCAATGGTGTGGAAGTAGTGTGTGGGATTTGTGTTAATTAATTATTGTTTGTAGTTTGTATTTTTGAATTAGTCAT GTTAACTAGATTTGTGGAAGTATAATTCCGAAACGTCTCTTCACTAAGGTAAAATGGGAAGTAAAGTAGGGAAACTGAAGCCTGGTTTGTTCTACTAAGT TGGCATGAATTTTATCATTTATCAAAGATTTTGCATGTTATATCTTTGAACATGTTTAATGTCCTATTGAGAGTTGAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_44573;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_1872

FPKM

• FPAB: 0
• FPNAB: 0
• LF1: 0.1
• LF2: 0.4
• LF3: 0.5
• LF4: 0.2
• UF1: 0.2
• UF2: 0.4
• UF3: 0.5
• UF4: 0.3

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_1872

• Blastp: -
• Blastx: Strigolactone esterase RMS3 from Pisum with 37.09% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019458673.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;