Ll_transcript_578

• Id Trinity: FTRINITY_DN54663_c3_g1_i17
• Name Transcript: Ll_transcript_578
• Sequence: GCTACACGCACCAATGTTCAGCACAACCACATTGTATGTACCATGTACTATGTACACACGCTTTATCAAGTAGAAACACTTATATATACACACGCATTAT CGTGTAGAAACACTTGTATGCACAAAAAGATGAGAGAGATGCACTGTGGTTAGTCTTATAGAAAATAGTGCACTACAGTTGAGTGAAGAGTCTGGTTTAA AGGATGAGAGAGAAATGACTTAAAGGGAAGTGCTTCTCATATCGTCCATTATTTTGAAGCTTCAGTTGGTGTGAGACATTGGAGAAGTGTATTTCAGTAA GTATAAGATGTAGTTTATTTGATTTAGATGTTTGTTATCTGCATTACATACACCACTTAACTAGTTAACCAGTTAATATTTCTGCTTAACAATACCACAT TGTACACATATTCCCGTATCAAGAAAACATCTCTGATTTTGCATGATTATATGCTGTATTTTGATTTATGTGTTAATTTATCAGTTATGCGTGATTAATC AAAAGGTTAGACTGAAGGACACACTATTCTCTTTTGGTTCAGGGAAATGCTTTTGACAAAATCTGAAAATATATTGTCTCCCATTATGTTCTTTAGCACT TGGCAGCATTCAGACCTAGGGTTAGGGTTATTTTTAAGAATACCTTTTCAATAATTTGGCCAACGCATATTACTTTCCTTGGCACTATCAAGTTTAAAAT TGTAATCCCTAAGTTAATAACATATTTTGCAGGGGAGGATTTAACCTATTTTTAGTAACTTTTTCTTCTCCTGTGAAATTAAGTTGGTCTTACAATTGAT ATTAGGTTTGACATGCCAGTACTCTAATTGAAATATATCTAAAATGATCCTGGTTATTTAAGCTTTAATAAATGTTGTAATTATCTTTGAGTAAAATCCC ATTTTGTTTATGTTTAGTTGGATTTTAGATCTGTTTAATAAATATTATAATGTTCTTGCTATCTAGGACAATCATTTTCAATTGATTTAATCTTGGTTTT GGATTAATGTTTAAGATGTGAAGTATGAAGAATAGTTTAAGAGAGCTTCCTTCAGCCCACTCATGGACGGATTAAGGGTTTGAGTTAGCTGCTGACTCAT TCATTCAAACACAATAGATCAAACATTATCAAATGCTATTGTGAATGTGTGAATGATGCAGGAGCTAAATTTCTTCCCTTTTTGTCTGTGCTTGGACTGA AGGGAGCTCCCTTTTACTGTTTATATATTCTTTTTTCTTCTGTTAATCATATTTTTTCCTCCCCACAATGAATTGTTTACAAAGTATACCTCCAATTCAG TGTATTCCCCACATATTCTAACCACTTTTTGTCCTAGAAGCATGCTCAAATCATTTTGAATCTATTTGTTTGCTGGAATTTAAACATTTTATGTAGTTTT AGTTCTAGTTTTATTTTGTCCTGTAAATTATTGTTGTTAGAGAGCTTATTCTTAGTGACTTCACTTCTTGTTTTATATGGGCTATTAGAGTTTAGGCCCC CCATAAAATTTATGGCATGTAACCCTATGTTTTATCTGAAATGTAGAGTTGAAAAATAATTACTGTTGCTGTTTTCCTACAATTTCCTTGTCACCATCTT GTGTGTAATTCCATCTGTGATGGCTGTTTGACAATGATTTTGCTGGTCATACAGTTTATGGTCTTACTGAATGGCATTGTTTTTTGTATGCTAATTTATT ATATGTTGCAAGTGTGTACCAACAAATTCAATGCATAGGTTTAATCTCTTGTAGGACGATGCTCACAAGTCCAGCAACTATAATTTTGCCTTATTGACAT AGACCGTAAATTACTCAGCATCATAATATGTTTGAATGGTTTATATGATATGAGTATCTAGGCTTAACTTCAAAACCTATCTTATGGGAAGGATTGCTCA AGTTATTATATGTATATTAGATTTATATAAGCAACAGGAGCAGGAGTTAACATATATAACACACTCAGTGGACTGGTTTGAGTTCATCTTTTGGGTTCTG TTGGGATTTTTATTTTATTGTCTTGAATTCTTGATCAATGGTCAGCGGGTTCATTTGTGGGGTATCAACTTGGGGATTTTTGTTGTTAAGAATGTGTTCT TTTGTCGTAATATCTCAGTCAAATTTGAAAAATGCTCCTGAGTTCTAAGATTTTTTTAAGCTGTAATAACATACACGGTAAAAAGGTTCTCGCCAACTCA ATATTTTATCGTAATTATCAATTGTTTTCTTCTCACATTTCCATCACACCCAAGCTGGCTTTTTTCTGATATTCTCGGGTTTAGTTCTCTGAAAACACTG TTATCTCCTTATTCTGACAATTGTGTCCTTGGTAAATAAGAAGAGATAAATGTGAAAAATAAAGATAATATGATTTGATGGCATAGAATTGAAGTAGTTA AATATATATAACATCAATGAGGTAATTTACATAGGATGATATACATGTGAACATGTTTTATGGGACTATGGTCTGTGAGAAATTATGTTCAAACAAGAGA TGGAGAGAATAACTAAAGTACATTCTTTTACATGTATATTGAATGGCTTGTTGACTATCAACATACTCAGGGTTACCTTAGAAATATGCTACCTTAGACA TAGGTTGTATCGTAGTGTAGTGTGTGTCAGTCACTTTATTCCAAGACAAAAGCAAACTTTGGTCTGATAAAGAAAACATAATAGCTAGCGTCCACCACAC ATCTCTACTATTCGATCGTGAGAAAATCCGGGTCGGTTAGATCTCAATTCAGAGTCTCTCGACATGCTCGTCCAGCATAATCCTGGCAGACTGAAGGCAA CTATTCCTACCCGGCGGCCCAAACTTTATACACGTTTGGTCGCCGAGTAGATCTCACGAAGAGCTTCATTAATTATCATTCTGGTTGGTCATTTTTGATA TGTCAACATCATCTACATGTTCATAAAGTTTAAAAATGAAGGAAGCAACTTTGGAAAATAGATAATATATAGATGATTAAAGCAATATTTTTGTAAAAAG GTGATTTTAGATTATAGAAAATGGTATATGGTGTATATAATCTTATTTTTACCTTTTCATTATGGCTTGAACTATTTTGTTGTTGGAGTAACGTTGTAGT AATAATTATTGATCAATCTTCTGGGATCTAACCAGTTTTGCAGTGCTTGAATTTTAAAAAACTATTAGACGTGCAATGGCTCCAGAATCTCTCCCTTTTT GTCTCATCACTCTGCTTCTGCTAGAGTCTACCTATGCGGTTGGAACTTGGAGCTATAACGTTCTAGTTTTTTGACATTCGTGACATCCATTAATTATTTG TCTTTAAAATATCGTGCATTTTATAATTACATTAGTACATACCCAAATACTGTCCCAAAATTTGTTCCAAACGAATAGCAACATGGCATATTAGTCAAAA AAAAGTTAACTATTAATGTTTTTATTTATATTTATTTATTCTGATTGACTTGATACATGATTGATGACATATTTGGGGACATAAGATCTTCATCCTACTT TAACCTTCTTTTTTTTTTAGGTATTTGAACTTATTCTCCTACGAACATATAAAAGCCATGAACACGTTATTTCTTATTTCATGCTGAACAACTTTTTTAC ATTAGAAAAATAGGGATATGAGAAACAAAGTACAGAACCTATTTCTTACACGTTATTTCTTATTTCTTATTTTTGTTGTATTTGTATTTTAGTGCATTTC ATTGCTTATAGAAAAAGAAGACATATACAAGGTTGTGTTAGAATATGACAGTTTTTGGTTTGATATTGCATGTGTAACTGAACTTAAATAAACTAAGCCA GTTACTTGATGAGTTCGAGATGCAAGTACAATTGAACTGGATTTCACTTTTTACAAATTATTTTATAAGTTGATAGATATTTCGATAAATGTGCATGTGA TTCGGCCATGTACATTTTAAAATCATAATCTCTTAAATCTGATGTGGATTATGCCCTAATCTCATTTGCTTATTTGTTACACATGTTATGTTTTTTTAAA CTTTTTTGCTCAGTGTTCATGTCATTCAAATGGAGGATCACTATTACTTCTGGTTTGTCTAATGTGTCATTTTCCATTTTTATATCCCTCTGCATGGCAC TATTGTCAGATCAGAATTAAGTTAGTTTAATTTGCTGCGAAAAAAATTAATTAGTCTGTAAAATATGCACTATAAATGTAAAAAATTATACGGTTAATAT ATTATCTATAATTCATTTGTAGTATTTTTTGAAGAGTTAACGATAATTAAATATAAATGATATAATGATAATATATAAAATTCATATACCATCTGTCAGG ATGAGAATATAATGTGCATGCCTATTGTATATTCCATTGATTCAAGCCTAATAGTTAATTATATAGATGAAAGCTGAATCTTCCACATGAATGCATGATG TGGTTGGGAAGAGAGATTTTATGCAACAAGTACAAATAAAAAGAATAAATAAAAAAAGAAGGCACATTGTGGAGGACACAGCATGTGGCTTTGACAGTAA TGTTTTTTGTTGCTGCCAAAAGGGTTTGAGCCAATGGAAAGCTTCACAATAGTGGCACTTGAGCTGGATAACTATTACATTTGGGAAATGACATTCCATA ATGTTCAAGTGCTTATTTCATCCTCATTATCTTTTATTGTTTTCTCTTTCATATCTAAAGTTTAGATTAAAACCTTGTATTCTACATTTAGGGCAGTGCA CTGAGAAATTTTGAAATAATAAAAAAAACTAACATGAAGTGTTACACTTTTTGTGGGATTTTCATCCTCTAACTTAAAAATGACCCTTCCATTATTTTTC TATCAAAAATCTGAAGGACACATTGGGATGAACAATCACGAACCCTGGTTGTTCTGGAAGCAATACTTGTTGGGATGAACAATCACGAACCCTGAAAGTG ATTAATTCCGTACTAACTGTTGTATGATACTCTTGGTAATATAAAAAAAAAAGTTTATCTGACACTGACTTTTTATTATAGTATATCATACTCATCATGA AC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_44707;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_578

FPKM

• FPAB: 0
• FPNAB: 2.8
• LF1: 0.1
• LF2: 0
• LF3: 0
• LF4: 0.1
• UF1: 0
• UF2: 0
• UF3: 0.1
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_578

• Blastp: -
• Blastx: -
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: gma-MIR319e (MI0017843)
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019464983.1)
• Pfam: -
• Rfam: MIR159 (RF00638)
• GO: -