Id Trinity | FTRINITY_DN54721_c1_g1_i7 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_159410 |
Sequence | TCTCAATTACAAACACTCTCCAAGATATTGTTCTTTTATAACTATGTTTACACCAATTCGAACTCAATATGTTATATAGGTTCAGTTATTGTGGTTTTTG TTTGGCTTATTTGTTACATATTTCTAAACTTTTTGAATTCTCAATTTATCCTTACAATTATTTAACTATCTCCATAAACTTAAACTTGAGACCTCTTAAT TAACTATTAAGTATGAGAAAACCATGCCAATTAATTTAGGTGCTTAAAGTAGATGTCAGTTAAATATAGTAAAGAAGTCTTATAATAGTGGGTAAAAAAA ATTTGAATTCAGTTGGTGGTGGTTTAGTTTAATATGGGGGTAGACACGTATTGTGGATTAGTTCTGATTTGTTTTAGGAGTTTTTTATTGGGCGTATCCC TTGTTTTTCTTATCATAAATTGTCTGGATGATATTTCTTGTAGTTACGTATCCCACATGAGAGTGTTCTCAAGTTCTTTATCTATTCAATAATTTCCTAT GTACTTTTAAAAGAAGTAGTATAAAAAATTAGTACTTGGCTGGGAGGGTCCTTATGTTAGAATGTCTTCATAGCATTATAAGAGGCTAAACTGTGTATTC CATCCGAAATGATGGACAAAGGCAATACAAATTTAAAGAAGAGCACAAATGTCTTTTATAATTTTATCCTCTAATATACTCGACATGTCCTGCATTAAAG TATGACATAGTGCTAAAAGGTTCCATCACCTACTGAATATGTGGAGGGTTAGATTTACACAATCTTATTCCTATAAAAGAGATTGTTTTTAGGATTTGAG CAGGAAGCAACCTCGTTGTCTTGTCATAGATTATAGTATAAAAAATGGCAGCAGCTTAGAGAAATGCAGACATTAACAATTCAATAACAAAAATAAAAAG ATAACCAAGGTCAACATATCTTTTGATGTTGTGATACTCTAGAAATATCTTATATATGTTTTCACCATACCTTTTCCCATACAGCTATCATCAATGGTAC TCTAGAAATATGCTTAAACAAATTAAAAACCTGATGATTCTTTTATATGACCAGCATGAAATCAGTGGTTGAGAGATATAACACATGCAAGGAGGAAAAT CAACAACTGATAAATCCAGAATCAGAAGTCAAGGTATGCTCTATGTTAACCACTCTTCTCTAATGTCTCATATTTCTGCCATAAATAGCAGCTACAAGTA TAGAGTAGTTGAGCTCCATCTATGTTTTTTAGTTTATTCATGAATTTATTGAAGAGTACCATTAAATGTGCATAATATGCTCAATATATAAGATATTTAG GACCTTATATCAAAACTGCACATAATTTGTTATTCTTATACATAATAAAAGCACAATCACTCCTTCTCCCCTAAATTAGCTAGTCATAATTTATGATTTA GAGAGAGAACAAAATATAGCTTTGGCTAATATGTTAACTGCCAGTAACTCTAGGAACAGTACTGTACTTATTTGATCTCACATGATTGTTAAAAATTTCA GGCATCATGTGTATCAAATTCAATTGAAGCCCAAGCACTACCAAGAATAACCATATTCTAACTTCATAATCAATCAGTACATCCTCCTTTTGATAAACAT AAAGAGAATAAGAATGCACAAATAGATTACATAAAAAACCTAAAAATCTAATGACTATAGCAATCTTCAGAAGTGATGATAATTAACAGGCATGTATACA ATCCCAAAAAACAAATGCAAAAGTTATGATCGAATACTAAACAAATTGTTCAAGCTCCTTGTATATATGATCACATAACTAGGAAGCTATGGATAATTTG GATCACATTTTGCATTTTGGCATCACACAAAATGCAAAATGTGAGATTAATCTGTATTCTAATGTCAGACCCAAAATTACTGGTACTTCTCGTGAAGTAA CTAGACATTGTAGAAGTAATAAACCAGTATAACCTCGTATAACTATTGTCTTCATAAAATCACAAAAATCCCATTATGAAACTGGGGCTCAAATGCATTC TTGTCCTTCAAAATTATCAAAAAAATTAATTGTTTTATTTCAATAGTGCTATTGATTCTTAAAAATTCAGAATTGCAAAAGATGAAAAGAATAGCAAAAG ATGAAAAGAATGCAACACAATTGCTTTTGCTAGACAAATGAACAAATGAAAGTCAGGATCAAGTATGACTCCTAAGGTCGAATTTCAATCATAGATATAA ATCACATGTATTCTATTTTGTCAAAACTTATATTCTAGAATCCTAATCAACCAAATCAAACGAACTATCTTTTAATAGAGTTATCTTTTAATAGAGTTAC TACTTATGACTTGCCATATGAGCATAACTCCATTAGAAAATAGTTTGTTTGTTTTGATCGAACAATATTACTAGAATATATTCAAACCATACAGCCAAAG TGCCAAACAGTGGTGCATTCTTTATACTATCAATGAGCAGAGATGGCTGATTTAGTACATCATGAGAACTTGGACTCTAAAATAAGCTGATAAATATTTA TGTTGATCAGTTCAGTCCAACATTGATTTTCGTTCAAGTTACTTTTTTAGTCATAATACTTGTAAATGGAGAAGAAAAATGAGAGATAAGAGAAACTGTT TTCTGTATATTTATATAATGATTTCATTACATGATCGCAAAGGGGAGTGGAGGATATATAGTACAAGTGTATAGCTGTAAATAGATGACAGCTGACACAT ATAGTATAACTACCTCTGTCTATACTTAACTAACTCTTTCACAGTCCTCCTGAACTTTTACATTTCTTCAGAACATTAGGAGCTTGGTTGACAGAAAGTT TTGCCTTAAATTCTATTTCCGACAAAATAGAGATCAAGTTTTATATGTTTAGTTTTGTTATGAAGAACTAGAATATGCGTCACTCCAACAGTTTTAATAT TATCACATAGAATAAGAGGAGTTTTGTAGGGAAATTTAAGTTCACTGGGTAGTTCAACCTATTATAATTCGTGACAAGTTAGGAGGGCCAAACTTCTGTA TTCTGCTTAGTACTAGACTTGGAAATTGTACTTTGATTCTTAGACCACTAAGTAATAAGATCAGGCCAGACAAATAGACAAGCTCATGAGATAAACTTTC TGTCATCTAAATCTCAGCCCAATCAGTATCACAAAATTCTTTGAGTGGTAGAGACAGGCTTAAGAAGGCCATAAGCAGCAGCTCCCTATAGGAATATGAA GATTCTTTTAAACCCTAAACTATGAATTTAAACCATATATGTTCGCTCAAGGGAGAAAAGGTTTAGAATGTAACCCCTTATTTGGGAGTCAGCATTCTAA CTTCTGAAACAAGTGGGGGAAAGAGGAAGTGAATATCACTAAAACAACATATAGGGAATTAAACAATGAACATATAGTGCTGGTGGAGAATAAGACTTCA AGTAAAAGTTTATCTTGGAGTTATGGTTTTCTGTAACTAGGATTGTTTATTTAGAGGACTTTAATAATGTAAAGTTATGCATTTAGTGTTTTGCCCGGAC TAGATGTTACTATCCCAATTTACTCTTTTTATGGGAAAAACTTTCTTTTTTGGGGATTTGAAGGGACTAAAAATGTCCCTCTTGTCACACTTTAATAGTT TTTATTGATATTTAATTAGTAAGGTTTTGTGAGTGTTATGTACAAGTTTCTATAGTGGTTCTATATTAGATGCCAAATGGAAAAGGCATATTGGCTTTAT ATATAGAAAAAACTTACACATGCTTATCATGGATCTGAGTATCAGTTTGTAAATTTACATCACAATCATGTAAGATTTCATTGTGTCATGTTGAAGCAAT TCTGCTAGGATCTAACTCAAAATGAAAAAAAAAATCATCTTTTTTCATTCCCCACTTTCAAATTAACATTTACATCATTTTGCTTGATAATTGATAGTTT TGGCAAAAGGAGGCAGGCATTTTAAGGCAGCAACTACAGAATCTACAAGAAAACCATCGGTACAAGTGCAACCTTTCTGTTAATTTATTTAGCAAAACAT TTTTCAATTCTACTAAGGAAATTAAACAGGTACAGTTATGGAAAAACTTCAATGCAGATCAAAAGGTATTATTGTGCTATAGTAGGTTGACTGTGTCATG GCATGCTGCATTGATCCAACAAAATGTCAATTACATATTATGATTAGGATTTGATTATCGCTGCAAACTCTACTTGGTCTCAAAATTATTACAAATAAAA GTCATAATATGCTGCTAGCAAAAATAACCTTCCAGTTTTATTTGCAGAAAGTTAAAAATTAAACAGACTTAAACAGAAAGTTGAAAGTTGAAACACTACG ATTTTACTCGTTCCATGTTTCAGCTGCTTTGAAAGTGCCCTTGGAGCTGGAATAAACAATGCAATTGTTAATGTCATCCACAACCATTAAATTTCCACTT GTGTTTGCTACCCTGCCAAAACAACCAAATTAAGATTTACAGCCATATCCACATAAATTTCTATATAGAAAAGATTGAATCGAATGAATTTGCATATCTC ATGAAGCTCTATGTATGATAACACTAACATTGTGAGGACACAGGCAAATGATGGGAGATCAGCTCTCAGGTTTGAGTGTCAGAAACCTACAAGATTTAGA GAATCAACTGGAAGTGAGTCTCCAAGGTGTCCGGATGAAAAAGGTCAACAACCTTTTAGATTCATCGTAGGAAGCTATGAAGATAAATGTGCTTGATTAT CTCATTAAGGACCATTTTAATCACTTTGAAAACAATTAACAAACATAATCAAATTCTGCAGGAACAAATTCTAACAGATGAAATCCGAGAGCTGAACCAA AAGGGCAACCTTATCCATCAGGAAAATGTCGAGCTTTATAAGAAAGCAAACCTCATTCAACAAGAAAACACGCAATTATGCAAAAAGGTCTATGGCACAA CCGATGTGGCTGTGAGAAGAAATGTATTTGTTCCAATTCCATTCGATGTTGATGCAGGGAGGGATCAACAAGCATTGATCCAACTTCAATTAAGCCAACC AGATCAAGAAACATGTGAGACATCAGGCAGTGGCAGTTCCACAAAATGAAGGTCTTCTTTGGTATGATATTTAGTACTAATCTGTTTAAGAATTATCAGC TTAAGAATCACATGTGGAGAAGTGAAGAGTATTTATCAATGAATGTTGCTCACTTCACTCAAAATAAGAATCCCAGCAGAGAAGAATATGCTTCCAGAAA TCAGATTGTTTATATAAATGCTAATCAGTACAATTATGTTTGCACAATGTAATATGGATGTGACTGCATGAGATCTGGAATACTATAGCATGGACATAAA AGTTTCTTTCTGTAAGTGTAACCATCATTTCCATGGAGATAACAAACTAAGAATTCTATGAGAAATCCACCATGAATTCTACTAGAGTTTAGATTCTTTG TCATTCTGCATAGATCTCAGCAAAAGGATAAACTTTTTGATTGCTCTCTTCCTCCCCCTCCCACTAAATAAGAACAGAGAGATTAGTACTTTTTTTTTGG TACAAAGAGAGATCAGTACTTGCTTATTTAGCTAGTTTATCTTCTTTTTCTCAAAAAGAAGAAAAAGGGTCTCTGAAGTTAATATAGAATTTATTGTGTC ATCTCTTAAACTCCTATTTTGGATGCATGCCTTTTGAGAACCAAACCTACTAGGTAGTAAAAACAACAAAGCCTTGGCACAATGTAACTAGCATCTTAAA AACTAAATTAGTTGCTTAGTGATCATAAGATCACTTGTTTAAATTCTAGGAACAACTTCTCCGTTTGCGGGGTAAGTTTATGTACATCTACTTTCCCTTA CCCTACTAAGTAAGAGACTCGTACCCTGGGTGACATTTTTTTATCTTAAAAACTATAAGAGAATCCTATAACAGCTTACATACAAATGGTGCTGCTACTG AAATGCAATCCTTTGTTGGCTGTGAATTTGACAAAGGAAATGAGCAACATCTGCATGAGTCGAAAAAGAGAAG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_45154; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_159410
Blastp | Agamous-like MADS-box protein AGL17 from Arabidopsis with 45.65% of identity |
---|---|
Blastx | MADS-box transcription factor 27 from Oryza sativa with 43.18% of identity |
Eggnog | Transcription factor(COG5068) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G22630) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002701) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019422741.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |