Id Trinity | FTRINITY_DN54755_c4_g1_i1 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_159873 |
Sequence | AGATCATCAAGATATTACATTTTCCCCTAGAACAACCAACAAGAACAACCAATCTTTATTCCACTAGGTGCATTGGCTACATGAATTTATGAATGCCATT GGGCTGTATCAATAACCACATCTTTTTAAATGTTTTCCTTGCCCTTCCTCCTTTTTAAATTTAACTATCTTTTACATGCAAAAATTAAGTTTCTTAAGGC TTGGTTGTCGTCGTTGTTGCTGTTGCGCGTTTATTTATATGTAGGCACACACATATATTTATATATTTTAATTCTACTGATTTTGCTCACACATCATAGC CTTGGGAAAAACAAACCCTGACAGCTTCTTTCGCTGGTGTCTCTCGTACTAAACAAGATTAGTGGAAGCAACTATGTTGTGGATTTACATCATCTTCGTT CCAATAAAGGCTGTGGCATAGGAATAGTTTACATCTTACATAGACTCTATGTTTAATATTGCTTTTGTGGAATCGTTAAAAGATGTATTCTATTTTATGC CAATTAGCTTTGGCTTTTAGCTACCTCTGGCATGTTGCTTCAGTGTAGCTGAAACGAGATGACATAAGAGAGATTGAGTCAAACTGAAACAGTCATTTGA TACGGAGCCTTGACTCGATTCAGCATAGTTGCTGCTGCAACAACACAGTGACACACTAGTTTCTTAGTTTACTACCAAGAGAACACTCGATTTGAGCAAT TAAATAGAAAAGGCTGATTTTAGGTTTTGCAACACTTTAGCTCTTCTAAACATTTTGTTATGCTTTTAGAGAGAACATCTTGCTGTGCTTCCTCAGGCTC TTTTGGGACTTCCTCTGGATAAAAGACCGATATTGGAATAGGTATTATACTCTCAGCTTTTCGTCTAAAACGTTAGAAGAGGTTGAGAACTCTGAACTTG GCCACAACATCCTAGAGGGACCAGATAAAGACAATAGTCACAGTGTATACTCCAGTAATCAATTGTGCTCTTACCTTTGATGCCGCATGGTGGTGGGTCT TTGCTGGTTGCTTTAGAGCTGATGTGGGCTTAAGATCATCTTAGTTATGTTCTTTAACTGTCTACAGTTAAGGAAAAGCGACTTCTTTTTTTTTTTTTAA TTTCATTTGTGATATGGGGGCATTTGGATGAGCTTATAAAGAGTTTATTCAGGCTTATGAGAACAGCTTATAAAATAGCTTTGACCTTTTTATAAGCTCC TTTTAGCTTATTTCAATATGGTTTTCAAAGAAGCTTATGAAAATGATCTCTTTTTAGCTTATCTAAAAAACTCATTGAATAAGCACTTAATGAAGCTGTT TACCCAAGCATGTCCATAGTTTTTGTTTAATATCCTTTCTTTCTTTTCAGAGGTTGTTTTGCCTTCAGTTTCAGACTTAGGGAAGACTGGGCATGTTTTC AGGACCTTAACTTGATAAGCTTTCACCAATTGCTTGATAAACAGTATTTCAAGGCTGATAAAACTATCAATAGTTGTAAGTTGGTCAACATTCCTGGTTG ATGGGTGGGTCTGTTGATTGTTTTGAAAACCACAAAGATAATTAATGATAAGATTAGAGCACATCTGCTCATGCTTCAACATGCTAATGATGTTTCTATT TTCACCATATAATGCTGATTTTTTGGAGATCTAATGGACAGCGATGATTTTTAGAATGTGAGAACATTTATTCTGCTAGGTCCAGAACATTTACACTGCT AGATCCAACTACTACTGTTCAGTCTGAAATTGAAATTCCAAATAAAAAGGGCTGCTGAATGAATGTGGTACTGACCACTTCATTTGAATTTTGGAAATGG AAATTAAAATGGAGGGAAAGCATGCACCTGAAAGAGTAAAATTGTTTATCTGTGAAGCAAAGCTTTTAATCAAATTGCCGTTGCTTTTCCATTGCACTCT TTATTCTCAGAGACAATTAAACCCTCGTTTAATTTTAATGTTCCTTAAGAAGCACATGTTGCATTTAATTTAATTTTGTTACTGAATGATGATTGATGAC TTCTAAAGTTATTGCGGTGTTGTTCATGTTTCATATTCGAATTGATTTCTAGATACCCATACTAAATTTTATATATGAATTGGATGGTTATCGAGGTTGA GGATGCCTTGAAAGCAATTTCAGGGCCATTTACGGTCTCTCCTGTTTGTGATAATTCAAAATGGCTTTCTATCTTATTTTCCCTTGATTATTACCTCGCT GAATCAGGCATTTCCTTTTCATAACAGGTTTTATCTTTGTGAATAATAATGCCTCTTTTCCCTTTATTTGCAAGCTCTTGGAGAATCATGAGCTTTCAGT AAATGACTCATTTTCACGATGTTGACAGATTATGTGGATAGAATGAATTGCTGAATTTTTTTGCTATTATAACTGTTTTCTTTTACGTCTCTCTCTCACT GTCTCAATATCCCTTGTGATATGGTATCATTTGTCTGCAAATTTTCATTCTAACCATTTCCTCTCAGATTTTCTGGTAGTTTGTACCTGAATATTGCAAT CATATAATATATGCTTGAGTTCACATTTGAATTCCTGTTTACAGACTGGGCCATCTCAATACAGAGGCAGGGGTGGTAGAGCATTTAGAGGAGGTGGTCG AGGCAGGGGACGTAGACTGAATGGTGGTAAACACTTTCCCTCCCATGCACCTGCTGCTGCGGGAGCCACTTCAGTGATACACCCTTCATCTTCAGTCTCT GGGCAAACACCAGCTCCTGTTCCAGCTGCACCGTCTCAACCACCCTCACGTCATGTGCAGTGTGAAATTTGTAAGGTTGAGTGCAATACTCTAGAAATCT TGGAGCAGCATAAGAATGGAAAACGACATAAGAAGAATATGAAAGTGCATGAAGAGTTGCAGAGACGCAAAGGTGCAAATGGACAGCAGAGTGTACTGAT TCATAGCCCTCAAGAATCTGAGAAAAAAGGATTTCCCGCAGGATATATGGGTTCTGAACTTACAGCCATAAATGGACAACATAATTTACTTATTCCGAGC ACTCAATCAAATTACGCAGCTACTAAAGTTCAGGAAAATATGGGTTCTGAATTTGCAGCTGATAAAGAGCTTCAGAATAGCGAGGGACAGACATCTCAAG CTCCAGCTGAAGAGCTTGCAGGGAAAACCACAGATAACTCTGCTGTAAGGGGTCGTGGATTGAAGCGTAAGACAAAAGGAGGCAGGGGAGGTAAATCCAT GAGAGCTGATGATGGGTCAAGAAGGCGAGCGGAACCTCTAAAACCTCAGCAGGCGAAATCTTTTATATGTGAGGTTTGCAATGTTAAATGTGAGAGCCAA GTTGTTTATGACAGTCATCTGGTCGGGAAAAAGCACTTGGCACGTGTTAATCGTGTCCATGGCAGACAGCCTACAGTAGCAGGGTTTCAAGCACTTTACC CAACTACTGACATCAATGCTCTGGCAAATGCAATTAATGTCCAAATTCAACAAGGTGATAGTGATCCGCAAGTCCTTCTGGCTCAGCTCTTGGTGACTCT AATATCTCAAACACAACAACCAGCTACGACACCAACTTCAAGCTCTCTGGCTGCAACTCAGATACTGGCAGCCACATCTGTGGCTGGATCAAGCAATGAG CTGCAGTTGTCTCAGACACAAACATCAGAAACCACATCGAATGTTGAGATGGGAAATCCTACTGGGGAGGCCAATACTAAGCTCTCATCTACCCCACTTT TATCTGATCTGCCTGGTTCAATTAGTGCTCTGTCAAACTCAATTACTGCTCAAATCCAACAAGGTGTTAGTGATCCACAGGTCCTTTTGGCCAACCTCCT GACAACAATCCTATCTCAAGCACAAGTACCAGCAATAGCACCACCATCCGTGGCTACTCAGATACCAGCACCCTCATCTGTGACCACTCAGATACCACCA TCAGACCCTGTGACTGCCCAGATACCAGCACCCTCATCTTTGGCTGAATCAAATAATGGACTCGAGTTGTTGCCAGCACAAGCGTCAGAAATCACAGCAC ATGTTGGGATCGAAAATCCTGCTGCGGAAACAAAAAATCAGCCACCATCTGTCCCGCTTGAGTTGGATGCTCAGGCAGGTTTCAAGTAGTAGCACTCAAA TTCCAGCAAGGAGATCCGAAACTAAACCTGCGGGTGCTTATACATCCCAGGACAGTCCAGGTAGATTCCTTTAGAATGCAGAAGCTCTCACCTCACAGGA GGACCAAAGAAGATACAATCACATAGCACCTCCCCCTTCCCTCTTTTAATTTTTTGGGTGAATTTTTACTTCCTTTGTCTGAAGGTTTATTATGTTATTG GGACTATGCTGTATGAATGTTGGGTTGTGACATTATATTGCTGAAACTCCTTAATGTTGGTTAGAGGGACACATTAGTGAAGGGATGCATTTAAGGATGA TGCTTTTTAACATTTAAGAATTAAAAAGAGACAAAAATTGAGGAGTTGTTACTGTCTTTACTTATAAACATTTTGAGGTTACCGTGTTGCAGGAATACCC AAAGGAGCAATTTAACAGTGCAAAACTGTTAACAGTTTGTGTATGTACGGTTATTCAAATCCTAAAGCATGAAAAATTTTCTTTGTGAAAATGCTGAAGG CTTGAGGAAGGTATACTTTTTTATTGGTATGTTAGTATTTTTTTTGTTATAGTTAAGACTCGAACTCTTAACCTTCTTCCCTCTAAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_45388; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_159873
Blastp | - |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463333.1) |
Pfam | Zinc-finger of C2H2 type (PF12874.6) |
Rfam | - |
GO | - |