| Id Trinity | FTRINITY_DN54797_c5_g1_i18 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_158779 |
| Sequence | GGGATTGTAACTGTGGTCGTAAATAGCTCAAAAAACATAGCCTTATTTCCTGAACAGATTAAAAACAAGGTTTTCATCGCAATCTATGATGATCATCACC ATGACAAGGCTTGAAGCAATATGATGATAAATAACATTTCTCCTTTCTCTTCACTCACAACATTAATCATATTTTTCCAAGTCCTTTTCTCTTTATCTTT CGTAATTTTTCATCACTTTCTTTCTTCACACGTGCATCAAACACACCTTTCTCACTCTTTATTCCTTGTGTTACAGAATGCATTCTGGGAACACTTCTCA TCACTTAGACCCTGATGTTATTGAAATCCCAACCCCAATTACTCACAACCCTGCTAAACAGAAAGAGGACATGTTTAATGAGACATTTCATCCGCATGTT ATGGAAAAATCTGAACCAGGTAGCGGGGTTGAGTCTTCCGATGATTATACTTCAGCAGCGCATAATTTAAACAGTGTTGATGACCATGGTTCTGACCAAT CATGTGATGAAGACGACTATAGTGATCTTTTTTCGGATGATTATATGGACGTAGATGATTATGCTTCATTACAGGCTCATTTTGATAATGTGGATATACC TCCTGGAATTGAGGCACCCATTCCTTGGTTGGCAGAGTATGATTTAGGTTCAAAGAAAACTGGAGGTAGCTCCTTGTATCCTTCGGGTCATATTCAGTCC GATCCTAAAAATTCTTGTTTAACAAACTTAGCACAGTCTCCATGGTCATTAGAACCTACTTACCCTGTTTCCCAAGGACCTTCAGTGGGTAGTTCTAGTT TACCAATCAAAATGGACTCTATTGACCATCCCTCCGAAATAGAGTTATCTTCTGCTCAGTTATTTTCTCAAACTGTCCCAAGTAGGAAGAAATTAGATGC CTATCAATGCAGGAGGCGTAAGTTTAAGTTTTCATTAGGAGAGTCTTCTAAATGTCATTTGCATTTGGGACCTTCTGAAGGTAAAAAGAAGCATAGTGTT TTGGATGCTTTAAATAGCCATGAGCTTATACACAATTCAGAGACTATGAAGCTATATGGAGGTGTAACTCCATATTGGGGACAATCTGCAAGTGCAAAGA AGGCAGGTGGAAGTAGTGGTTCACATAATTCAAATTTCGTTGGACCTGAAATTGGGTCATTGTATCCTCGAGCAATTGAAGTAACAAATCCTTGGTGGTT GAAGAGCCCCCCTTATGTTAAGTCATTTACTAATTCTAATTTTTTCTATCATGATAATACATGGGTTCACAATGGATCTACTACTGATAATACTGTTGTG ACAATCTCTGATGAGGCCAGAGATGAAATTTTGAGGAAATTCACAAATTTTAAACAGTTTGACACTGCTGAAGACACTTCAGACCATTACTTTGTTCATG TTGATTCTTCCGTGAAGCAGGTAACCTTTTTTTTAAAATTCATTTTTGTTTTAGCTTTAATCTTAACTATTTTGGTTTATCATCAATTCAATTCTTGAAC AGCATCCTAAGAATTGGGCTAAAAGAATCCAGGAAGAGTGGAAGTCATTGGAGAAGGATTTGCCTGGTCAGCTTGTTTGTTTAGTGCTCCTGTTACAAAT TAGCTTTAGTATTTTCCTTATCAAATGGCTTTCACAATGCTTACTATTTTTTTTTCCAGTGGTGACCAAATACTTGTTCTGTAACTTGAAGTTAGAAATA GTTGTAGATTTTGTTTTGAATATCATAATGTGCAACCTCCATTGGGTTTTTATATAATCTATAACTGTTTCTTTAACTGTCATTTATCTCCACCAGACTC AATATTTGTCCGAGTTTATGAATCGAGGATAGATCTTTTGCGGGCTGTGATTATTGGAGCTGAGGGAACTCCTTATCATGATGGTCTTTTCTTTTTTGAT GTTTTCTTCCCTAGTGGCTATCCTAATGTACCCCCACTTGTCCAGTACAACTCTGGTGGCCTTCGGCTCAACCCAAATTTATATAATTGTGGCAAAGTAT GCCTTAGTCTACTCAATACCTGGTCTGGCAGTAAGAATGAGAAGTGGCTTCCAGGTGTTTCAACAATTTTACAGGTTCTAGTCTCTATACAAGGTCTAAT CTTGAATGCAAAGCCTTACTTTAATGAGCCTGGATTTGCACGTTCGAATGGTTCAGCAAGTGGTGAAATGAAGTCCCTGCGGTATAATGAGGATATATTT ATCCTATCATTGAGAACAATGGTGTATATGATTAGGAATCCTCCAAAGGTTGGATTCTAGAACCCCCATATCTTGGTTCTTTTTTTTAATATCTCAAACA TGTTATATTGTTTTAAGAAGTGTGCAAAGCATGTTCATTCTTACCACCTCAAGGAAATGATGCATAGGCCTGTGCCAGTTCTTTTTGGCAAGCAATGGAG ACAAATGAGAGAAGTAATAAGCTATATCTAATTTAGGAAGAAAGTTTGTCATTTTAGAACAATAGTTATCAAATATATAGGCAAATAGTTTCGAGGATTT CTATTCAGTTATTTCTGAAGTACTAGTAGGGATGTAAGATATATTCACTTTCATTAGCCTAGAATTGACATCTTGCCATTGATAATTGTCTACATTTAGC TGCATTAATCAAGATACTTTACAAATTAGTTAAACATATTGACTCATCTTTGCAAAACATTTACTGACATGGTTTATTGCTTTCTCATCAAGTCTAAAGT GGTTTTTTTTTAATAAAGTGTCTCTATGCTTGCTATATTTAGCCTTTCCAAGGTCTTGGTTCTTTTATGTGTTGTGGATATTGAACCACTATTTACTATT TCAAATCATCAATAGTGAAGCATCCTTTGTTTGATAAACTCCTATGCTCATCAACTTAGACACACTTCCTACTACTGGAATGTATCAGCGCATAGTGAAA ATCCATACTACATGCATTCCATTAGTTTTATTATTGCACATGGTCTTTCGTCTTTGGGAAGACTTGGAACATCAATGGTTAAATGCATATTCGTCAACAA ATGTACATATCTAACAACAGCATACTCATAATCACTTAATCTTTGCCTTAAAACTACATGGAATTTGTTTCTTATCAATCTTCTATCGGTTGGCGTGTTC CCACTCCAGGTTATTGGATCTTTTAAACACCGATCCTCCTTGCAGAAAAGGGTTAAAGGGCTTGCTATAACTTAGATTTCGTCAAAGTACACTTGTTTAT CGCTTGATGACATTACTTCTTTCGTTTTACTTGTGATTTTCACACTTTCACCTTCTATCCCTGTAATTATGTTATAAAATATTTTCACCACAGTATGAAT GAAGTGTTAGTTTAGTGTGTTTTAGGCATTTGAATGAAGGACAAGACAAGTGCTAGAATGTGCAAGTAGCTTACAATTTTGTTATGTAATTATTGCTTAA AAAACTCGTAACTGCCTTCTATTTAAAAAATTGACTGTTCAGGTAATTTTTTGGTTTCAGAATTTTGAGGAATTTGTTGCTGGCCACTTCTGCAGCCGCG CACATGATATTCTGATAGCATGTAAAGCATATATGGATGGAGCTCAAGTTGGCTGTTTGGTCAAAGGCGAGGTTCAGGATGTTGATCCGGTCGACAGGAG CTGCTCGAAGTTGTTCAAGAATTCTTTAGCTGGGTGTGTGAATATGCTTGTCAGAGAGTTTACGAGAACCGGAGCTAAGGATTGTGACAAATTCTTGTCT CCTTTAACAACAGCCGAGAACAAGCCACCGGGTCAATTGCCTGAGGCTCCTGCTACATTTTCTTTATGAACCCAATTTTGAGACTTGATACAAAAGGCTC ATAACAATTAATTTATTACCGTTACAAGTAGGTTTATGTTTTATATTACATAGTTGAACTCTTATTATAGACTACCTTATTTTCGGGAACAATGCCTGCA CATAATTCTGGATAAAATATGTAGTTGCAGATGAATACATAATGCATTGTTAGGTTGAAATGAGATCCATAATGAAATTATCATGGTTGACATGATCATG ATTTGTCTGTTAGACTTTTAGAAAACCTTTGTGAGCTTTTAATGGTTCATGAGAACCCCTTTAATTTAGGACCTTAACATTATGACATTCACATGTAAAT AGGTTTAGGAATATCTGGTTTCATTTGCCTTTCCGGTTGTTTTATTCTCA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_45759; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_158779
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 25 from Arabidopsis with 75% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019413880.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |