Ll_transcript_93248

Id TrinityFTRINITY_DN54824_c1_g2_i14
Name TranscriptLl_transcript_93248
SequenceTAAACGTGACGAGGCTGAAGTTAACCCACATAGCGCACAGTTTATCCTTCGCACCCAAAAAACACGTATTTTAGCGTAAAACTTTTTTCAAATTGTTTTC TCCATTGTTACTGAATCTTCTTTGACTCTGAGGTCGGGTTATGAGCTTATAACCGTTTCAAGATGCACATTAAGCAGATTGTGATTGAAGGCTTTAAGAG TTACAAAGAACAAGTTGCAACAGAGCCTTTCAGTTCTAAAGTTAACTGTGTCGTTGGTGCTAATGGATCTGGGAAAACAAACTTCTTCCATGCCATTCGT TTTGTTTTAAGTGATCTATTTCAGAACCTACGCAGTGAGGATAGACATGCACTACTCCATGAAGGAGCTGGACACCAGGTTGTATCTGCATTTGTGGAGA TTGTGTTTGATAATTCAGACAACCGTATCCCGGTAATGATTTGATAATTTCTTTTTCCAGTAAGTTGCAGAAGGAGGATAATTTTCAATTTTTTAATTGT TTCTTAAACTTTGTTTAAACATCACTTAATGCATATTTTCTTTTAGGTCTAGATAAAATAATGATGCTATTTTTTTTGTAGTAAACAGTTTATAGCAAAA TCATGATTGCTATGGTGAGGAAAGTATAGCCTTATTTGACAGTTATTCTATTTCAATCACAGGATAAATTGTCTAGTGGCTGTTATGGAGCATATTCTCA TGGGTTTTGCTAATTAGTCACCTTTCTTTTTGCTATTTTTAATCTCTATCTTTCATGTTGTGATGATTGGTCGTATATTTATTTTCTTGTGTTGCGCTAA TGAGTGCATATTAGTGGCTATACTGCTCAACGTATATGGAGAAATGCTGTAGGCATAAGGGAAAGATTTTTAGTTTTGGGTTAATGAAGATTTTTGTGAT GACTGGATGAGTATTATGTTTTTTGCCCTTTAATTTTTTTGCCATATTTATCTAATTTTCTATATTGATTAATGTTCTTCTCAATTCCATTTTTGAAAGT CCTGGCGCCGATCTTATGGGTTTTGATGTTAAATACTTTCTGCTAGCCTTGACGTAATTTTATCAGTGATGAGATGTTCTTGTTTGGTCAGATATTTGAA TATTTTTATTTTGATGACAGATTCTTTTAGTACAGTCACATTTTCATATACTTGTTTTAGGTCAACTATCCTTTTTTAAGGTTGCAAGTGAAAACTCAGT GTCAGTCCTTGCTGATGTGATGTATACATTGCTTCAATTTCCCTTTCTCTGTTCAGATGAGTGGTTTATGTTCCATAACCACTTATTTGCAACATTTTGT TTCTTTGCATTATCTTAGTATCTGTCTGTGCCCCTGATTAGGTTGACAAGGAGGAAGTGCGCTTGCGAAGGACTATTGGTGCGAAAAAGGATGAGTATTT TCTAGATGGAAAACACATAACAAAAACTGAAGTGATGAATTTATTGGAGAGTGCTGGGTTCTCTCGCTCAAATCCTTACTATGTTGTACAACAAGGAAAG ATTGCTTCACTTACCTTAATGAAAGACTCTGAGCGATTGGATTTGCTGAAAGAAATTGGTGGTACCAGAGTTTATGAGGAGAGGCGCCGTGAAAGTTTGA AAATAATGCAGGAAACAGGTAACAAAAGAAAGCAAATAATTCAAGTTGTACAGTATTTGGATGAGAGGTTGAAGGAGCTAGATGAGGAAAAAGAGGAACT AAGAAAATATCAACAGCTTGACAAACAAAGAAAATCCTTGGAATATGCTATTTATAACAAGGAAGTTCAAGATGCTCAGCAGAAACTTACAGAGATAGAA GATGCTCGAGCCAAGATTTCTGAAACGTCGGCAAAGATGTATAATGACGTGCTTGATGCACATGAGAAATCCAAAGATTTAGAGAATACATTGAAAGATG TAACAAAAGAACTTAATAACTTTAACAAAGAGAAAGAAGTTATAGAAAAACGACGAACGGAGGCATTAAAGAAGCACACAGAGCTTGAGCTTGATGTCAA AGATCTAAAGGACAAGATCTCTGGAAATAAAAAAGCCAAAGAAGATGCTGTAAAACAACTTGGGACACTTGAGAAAGAAATTCAAGACTCGATGAATGAA CTGGACAAGATCAGTCCTTCATATGAGGATCAAATTAGAAAAGAAAATGCAATTGCCAAGCGAATAATGGAGCGTGAGAAGCAACTTAGTATACTTTACC AAAAGCAGGGGCGAGCAACCCAGTTTCCAAGCAAAGCTGCTCGTGATAAGTGGCTTCAAAAGGAGATTGACGATCTTAAAGGAGTGCTTTCTTCTAACAC AGGGCAGGAGCAAAAGCTTATGGAAGAAATTGACCGGCTTAATGGTCAGCTTCATGAGTGTGATGAGTGCATTAAGAGTCGTAGGTCAGAGATTACTACA TTGGAATCTCTCATTACAAAATCACGTGAAGGGTTTAATCATCATAAAGAACAAAGAGACATTTTGCATGACGAGAGGAAATCCCTATGGGCCAAAGAGA ATCAACTTACTGCTGAAATTGATAAGCTGAGAGCAGAAAAGGAGAAGGCTGAAAAGAGTCTTGATCATGCAATTCCTGGTGATGTCAGAAGAGGGTTGAA TTCAGTTCGGAAGATATGCAGGGAGTATAAGATTTCTGGAGTTCATGGTCCTATTATGGAGTTGCTGAACTGCGATGAGAAGTTTTTCACCGCAGTTGAA GTTACTGCTGGAAACAGCTTATTTCACGTGGTTGTTGATAATGATGAGACATCTACCCAGATAATTAGACATCTTAATTCACAGAAAGGCGGACGAGTTA CATTTATTCCCCTTAACAGAGTGAAGGCTCCACGCATTACTTATCCACAGAGTTCTGATGTCATACCTCTTTTAAAGAAGTTGAACTTTAAACATGAATA TACACCCGCATTTAGCCAGGTATTTGCTAGAACAGTGATCTGCAAGAATCTGGATGTGGCTTCAAGGGTTGCTCGTAATGATGGTCTGGACTGCATAACA TTGGAAGGTGATCAAGTAAGCAAGAAAGGTAGTATGACTGGAGGATTTTACGATCACAGACGATCAAAGTTGAAGTTTATGAATATCATCAAGCAGAATG AAGACAATATTTACGAGAGAGAGGTCCAGTTGAATGAAGTTAGATCCAATCTAAAAGATATCCTTTTACACTTGTTTTTATTAACATTCTTGTATTGTTT TTCCTTCTTTTAAATTATAATTTATTGAAGGCATAGAAAAAACAGAGGAACTAAAAGAAAATAAATCCAGAGTATGACCTGAATCAGCTGATCAAATATT TGAAAAAAAACTGACTGTGGAGAGAGGAAACAGTTTGGTAATGTGTCCCCAATCGCAATATCTCTTGTTTTGTTTTTTATTTACTCACATTATGTTAAAT GCATATTTTTGCCCAAGGAGGTCATATATAGGAAGGAGATAGTTCATAGCGTCAGACATGTGGAGGAAGGCTTATTCGGTGAATGACTGAGCAAGCGAGC TTTTGTGTACAACAGTGGTGCCATGGACAATAGTGGCTTGGCACTATAAATTTGGTTGGCGGTGTCGGGCTTAGTGAACACTTGGGTGGAAGTAGAGAAT AATGGCTATGACTTACTAAGCATCGGGATTTGAATTGAATAGATATGATTGTGAGAAGCAGAGATGGCCATGGCTAGTTGGGTATAGTTGCCCACACGAT AGATGAAGAGTTCAGAGTTTGATTTTTAATTACTTTAAAATTATTTCTTGGATAAATTATATCATGGAAACTGCCTCTTACCTTGCAATGGTAAGGCTGC ATATATATATACCTTCTATAGACTCCATTAGGTGAGAGCCTCATGCACTGAGCTGCCTTTTTTTAGAGAGTTTTAATTTTAAAATTGTTTTTAAAACAAC ATTATCAAACAATTTTTTATCCTTTGTTCTGGAAATACTTGTTCCTACTACAATGTGGCCTGTGGGAACCATTCTAGAATTACATTCACAAATATGGCAA ATGTCGCCGCTCGGATAATAATTTTTTTTCACCTAGTGGGATAAAGGCTTGGATGTTGTTTTTGTTCTGAAAATACTTGTGAACGGCTTCTCCACTTGCC CAATGTGTATATCTACCCTTCCCATACCCCACAAGGTGAGAGCCTCGTGCATTGAGCCCTCCCTAGACCCCATTAGGTGGGAGTATCGTGCATTGGGCCA CCCCATTTTATTTTGAAAATGGTTTTCAATTTTCTTTACAAAATTGTTTTGAAAACAAAAACACAAATCAATCAGAAACACAAAACAGTCAGGGCCTTAG AGAGGCTCTACCTGGGTTTTAATGTTTTATGCTGAGGGCAGTTGGATATAACTTGTATGTTACTGTAATTTGTTGGTTCCATAAGCCTTCATCGAAGTTC AGTGACTCTTTTGACTCTGTCGTCCGGGATACCTTTTGTTTATTTATCACATTCTTCATTTTGTTCATTTGTTGATGGTTTGGTTTTGCTTTAGGTGATT TATTCATCTTAACCTAAAAATGTTATAGTACATATATAGCATGTAGTGCCATAGGATTCATTAGTTTTGTGAATGACTTATCTAAAGCCTGTTTTATTCC TTGGCCTGAAACCATTTCCTCCAATAGTTTTGTTTTCACTGAACTAGTCTCACAGATAGATGATAAAATCACAAAAATTGTTACCGAGCAGCAGAAGATT GATGCCAAACGTGCTCATGACAAATCAGAAGTGGAACAGCTTAAGCAGGACATTGCTAATGCTAACAAGCAGAAGCAATTGGTTTCTAAAGCAATTGCAA ATAAGGAGAAGTCACTTGTAGATGTCCAGAATCAGATTGACCAGCTCAAGGCTAGTATGGCAGTGAAACAAGCTGAGATGGGCACAGAGCTCATTGACCA TTTAACACTAGAGGAAAAAAAGCTTTTGTCAGATTTGAATCCTGAAATCAAAGATCTTAAAGAGAAACTTGTTGCTTCAAAGGCCGAGCGTGTTGAGACT GAAACTCGGAAATCAGAGCTGGAAACTAATCTAACGACTAACCTTAGGAGAAGAAAGCAAGAGTTGGAGGTTGTAATATCATCTGTGGATGCTGATTTTT TGGATGATGATGCTGAATTGAAGGGTAAAGAAGAACTTAGTTCTGCTAAAAAATCGGTTGATGATGCAACAACGCAGCTTCGAGGAGTTTCTGAAAGTAT AAAGGATAGGACAAGCCAAATTAAAAAGATCAAAGATGAAATGAATAAATTGAAGTCTTTGGAGGATGATTATGAAAGAAGACTTCAGGAAGAAGCAAAA GAATTAGAGCAATTGCTGAGTAAAAAAAATATCTATTCTTCTAAAGAAGACGAGTATACCAAGAAAATAAGGGAATTGGGTCCATTGACATCAGATGCTT TTGAGGCGTACAAGCGGAGGAACATCAAAGATTTGCATAAAATGCTGCACAGGTGCAATGAGCAACTGCAGCAGTTCAGTCATGTAAACAAGAAAGCACT TGACCAATACATAAATTTTACAGAACAACGAGAAGAACTTCAGAAAAGGCAAGCTGAACTTGATGCAGGAGATGAGGTACTCTGGCTGGATTTCAGTTGG GAAAGTTCTTTTTAATTGTTTCCAACAACACAGAAGTCTCTGATGGCTAAATTGCCTGATATACATTGCTTCAATTTTATTATCTTAGAGGGTTTCGAGC AATTAATCTTTCATACCATATTAAGATTCTTGCTTCTTTGCTGCATCCCTCAAGTATATATTGTTAACAACCCACCTGTGTGTGGAAAATGTAATAACTT ATTTTCTTCATAGTATATTTGTCTTGCTGAATTTCCATTTTCTCGTCTGTGACTATTAGTCTAGGACTGTTGCAGTGGCAAATCTTGCAATTGGGAGAAT GTTGTATCCAAAATCACTAACTGTTTTGAATTCTGTCATTGGATAATTGCAGAAAATTAGAGAGCTAATATCAGTACTAGATCAACGGAAGGATGAATCA ATTGAACGGACTTTCAAAGGTGTTGCTAGGCATTTTCGAGAAGTATTTTCGGAACTTGTCCAGGGGGGCCATGGCCATCTGGTTATGATGAAGAAGAAGG ATAATGATAATGATGATGATCAAGATGAGGATGGTCCTCGTGAAGCAAATCCAGAGGGGAGAGTAGAGAAGTACATTGGAGTGAAAGTAAAGGTCTCTTT CACTGGACAAGGAGAGACACAGTCCATGAAGCAGTTGTCTGGGGGTCAAAAAACTGTCGTTGCCCTTACACTTATCTTTGCCATACAGCGATGTGATCCA GCTCCCTTTTATCTATTTGATGAGATTGATGCAGCACTGGATCCACAGTACCGAACTGCTGTTGGAAGTATCCATTTTATTATGTTATCTTCTTGTCATG CCAATTAACTCTTTTGTAATTCTTTAATTGATGTTTACTGCATACTGCATCTTACGTTGCTTATTCCATAAAATTATACTAGTGCATATTGAAGGTGGGG TTTTTTGATGCATGTGATGAGTCTTCAACCGTTGGAGATTTAAAAGTAGCTATCATACCAAGTGATCCAGACACCAAATCTCACTTTTCCCCCATTTATT TTTAAATCTTAGTTTTTAGTGCCTGTCATTTAATAACTTGAAGCTTTAAATTTTAGTGGTTATTTGTCATCCACAGTTTTGCAAGGATTATTTTTTTTTA ATACCAACAGGCTTAAGCATAAGGGGATGAGCCTCGGCGCAATAGTAGTGTTGCTTACTTTGTGACCTGGATGCCATGGGTTCAAATCCTATAAACAACA TTGTCACTTACGAGGGTAAGACTATATACTTTTGTCCTCCCCATACCCCACTGAGTGGGAGTCTTGTGCATTAGGCAGTTCTTTTTTTCCTCCAACAGGC TTAAGCATGTGCTCTTTCTTTTAGTCAAGGTTCATAGCGAAAATGCTCACACATATATTCTGGTTTCTTTTCATTCCCTCACGTATTAGTTGCAAACACA CCTCACGGACACTTGAACATGACAATAGACTGTTTTTGCATGAGAAATATAATTTCAAATCAGTTTTAAAGGCTATCATTGCATGTTTGATTGGGAGAAG TATATTTTAGCTTTGATATTTTTCTATGAATGAGGGGTTATTGCTTTATAGCAAGCATGTTTCTCTTGATCTTATTTAGGGCTTATCTATACTGGCGATC AGTACGTTTTGAATGGAGAAAGGTCGGGAACTATTTACATTGAGATATTGGTTTATGGTGATATTTAAATATAAAAGTTCATTCATATTTAGTTGTTTAG TTGTTTACTATATTTTGATTGGCATCTTGTGTCTTTTATACTGTTGTGCCTTTGAGGATTCTTAACTTCCGTAGATATGATCCGACGCCTGGCAGACATA GCAAACACACAATTTATCACAACAACGTTCCGCCCAGAGCTTGTCAAAGTTGCTGATAAGATATATGGAGTGACTCATAAAAACAGGGTCAGCCGTGTTA ATGTCGTGTCTAAGGAAGACGCACTAGAATTTATTGAGCACGATCAGACACACAATGCTGAATAAGGTCTTACTAATGCTAGGACATTTTGAGGAGTAAG GGGCGTGGCTGGTTGTGATGTTGTCCATCTGGGACATTCAAGAGTTAGGTGCTTCTGAATTCCATGTTGTCAACCACATAAAAGTAGATTGCAGACTCCA GTTTGTCTTAATTCTTCAATCTGTTCTTCCTAGATTTATATAACCCAGTATTGCTTCTCACCTGCTCTCTATTTGTGTAAATTCATTGGACTTTGTTAAC ATCAAAATGTTGTGCTTGTTGTGGTAAATTTGAGTTTGTTAACCTGCTCTCTCTATTTGCTAATACAATGTTTTAAATTCAGAGTTTCATATATGTATAA ATTTGCATGTTATCTGAAAGCTTACTCACATTTTTATACAAGTCTTTGATCCTTGTGCTTTTTCCTGATAGAACAATTGATATGTTTGTTGGTACATTTT AGTGTCAGAAAACATAATTCTGACTAATGTTGTTCTTATCGTGCATAATGGCCAAC BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_46022; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_93248

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_93248

BlastpStructural maintenance of chromosomes protein 3 from Arabidopsis with 68.75% of identity
BlastxStructural maintenance of chromosomes protein 3 from Arabidopsis with 69.88% of identity
EggnogRequired for chromosome condensation and partitioning (By similarity)(COG1196)
KeggLink to kegg annotations (AT2G27170)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019434196.1)
PfamSMC proteins Flexible Hinge Domain (PF06470.12)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;