Id Trinity | FTRINITY_DN54824_c1_g2_i19 |
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Name Transcript | Ll_transcript_93261 |
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ATTTTTAAATCTTAGTTTTTAGTGCCTGTCATTTAATAACTTGAAGCTTTAAATTTTAGTGGTTATTTGTCATCCACAGTTTTGCAAGGATTATTTTTTT TTAATACCAACAGGCTTAAGCATAAGGGGATGAGCCTCGGCGCAATAGTAGTGTTGCTTACTTTGTGACCTGGATGCCATGGGTTCAAATCCTATAAACA ACATTGTCACTTACGAGGGTAAGACTATATACTTTTGTCCTCCCCATACCCCACTGAGTGGGAGTCTTGTGCATTAGGCAGTTCTTTTTTTCCTCCAACA GGCTTAAGCATGTGCTCTTTCTTTTAGTCAAGGTTCATAGCGAAAATGCTCACACATATATTCTGGTTTCTTTTCATTCCCTCACGTATTAGTTGCAAAC ACACCTCACGGACACTTGAACATGACAATAGACTGTTTTTGCATGAGAAATATAATTTCAAATCAGTTTTAAAGGCTATCATTGCATGTTTGATTGGGAG AAGTATATTTTAGCTTTGATATTTTTCTATGAATGAGGGGTTATTGCTTTATAGCAAGCATGTTTCTCTTGATCTTATTTAGGGCTTATCTATACTGGCG ATCAGTACGTTTTGAATGGAGAAAGGTCGGGAACTATTTACATTGAGATATTGGTTTATGGTGATATTTAAATATAAAAGTTCATTCATATTTAGTTGTT TAGTTGTTTACTATATTTTGATTGGCATCTTGTGTCTTTTATACTGTTGTGCCTTTGAGGATTCTTAACTTCCGTAGATATGATCCGACGCCTGGCAGAC ATAGCAAACACACAATTTATCACAACAACGTTCCGCCCAGAGCTTGTCAAAGTTGCTGATAAGATATATGGAGTGACTCATAAAAACAGGGTCAGCCGTG 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Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_46022; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_93261
Blastp | Structural maintenance of chromosomes protein 3 from Arabidopsis with 68.75% of identity |
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Blastx | Structural maintenance of chromosomes protein 3 from Arabidopsis with 69.88% of identity |
Eggnog | Required for chromosome condensation and partitioning (By similarity)(COG1196) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G27170) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019434196.1) |
Pfam | SMC proteins Flexible Hinge Domain (PF06470.12) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |