Id Trinity | FTRINITY_DN54828_c5_g2_i3 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_92599 |
Sequence | TTTTATTTTATGTGATTCACTTTCATATTCATTACTATTGTTATTAACCATTTATTCATTTATTTATGCATTTCATTTTAGAATCTAATATTCACGTAAA TATTTATATACAGTCAATACATCATCCACCGTTTTTTATAGACAGTTGACTGTAAAACTTACACATTATACTGTCAGTGCATACATTTTATATGATTGCG GGGCCGTGATAGTCTCGGCGGACCCAGATTTAAAACCTTGATAAGGGTTTTAGCTTTGAGATTTTAATTATTTTGGGCAAAATTTATTATTAGGGTTACT GAGCTTTTGAAGATGTATTTCAGAGCTTCTGTTTCTTATGTTGGCCTTTTTTGTTTCAAATATACAGATATGATCTTTGGGGAATACTTCAATGCTGTCC ATTTCTCGCTCGATTTGAGTAAAAGAAGGTCGGCCCAATACAGGAGGTTTCTGGGGAGGATAGATGTACGCAGCCTGCGAGTGGAGAGACTGTTTCTAGG ATTTGAATCCGTGACCTCGTGGTCACTAAGCAACAACCTTACCATTGTTGTGATTTGAGGGTATCCTGGATTAGAGTGTTTAGATATGATTTTAACATAT TGCGGCATTTCAATCCGAATAACGTTAAGATGGACATTCATGATGACAATGTCGCGTAAAATAATCTTCGACAGTTTTGGGAGTTTCCCTGTGCATTGGT GTTTTCGTGTATGCTGGTGCGAGTATGCCGAGCTTCTATTTGTTTTATCATGTATCCGCCATTGGACCATGTATTTAGCAGTATGCAGAGCTCAAGCCAG TCCCACGCCTCGCATATTCGGAAATTCAAAGCTTGCAGGAGTAATGCATTACCCCAATTCTAAACAAGTAAGTTCATGATATTAAGCAAATTAAAAGCAA GATGCTTAATACTTCATTTGTAATCTGTTTCTTAGAGCAATCTAGATTTAGTAATTTAAGAAAGGAGATAATGCAATGTGTATGCTTTATTTATCTATAT CAAGGGTTTACCTTACCAATTCTGGAATTTCTTAGGTGAAAGGTATTTTGTTAGTGTAAATTCCAAAAGCGTCATGGTTCATGAAAAGGATAAATTGCTT AACATATATAGCCCATCCTATTTATACACAATTACGTAGATGGATAAATTGTCGATCAGGTTTACGTTAGGGAGGTTTTAACCGAGATTCAACTCGTTTA TTAATTGTGCCTGTTAGGTTGGTTCAATTTTTTTTACAGAAACACCAGAGAGACAACCAAAATCTAGGGCCATTCTACGAAACAGTCACTTTTAAGCATT CAGGATAGAATCCCTCCACGATTTCCAAAATAAGTATTTTAATTATGTTGTACTATTTCCGTGGTGTTTTACTATTAAAGAAAGAATAAATAAACAGTGT TCTCATAAATTGGCATTAGATGCAATCTTTTCTCTAATTATTGATACCCACTCACTGCTAGCATATCTTAATCTGGATGGTTTTGAAAATTACTTTAACG TGTGAATTGGACATTCAATCGAAAAATTTAAGTTAGAGCCTTCTAGGAAGGGTTCTCTTACATAAAGCTTCAAAACATTCAGGTTGGAAATAACTAATAC ATCACGAGCATTACTAACAGTCTAATACTTTGTAAAAAAAATCCGTGGACTATTGCTTAGGTTTTTTTGGATAAACCCATTTAATCTTTTCCTCGGAAGG TTCTGCTTTGCTTCTTACAAAATGATTACTGGACTTCTTGATGTGCCTCTGAAAATTCTGAGATTTCTTTCAATTCAGGTGTAGTACATGACTACCATTA TGCATACATATAGTGTTTGCCTTTTGAGTTTACTGTATCTGAACTCTTGTATAGCGACGTTAATTCATCTGTCTGATCTGGTTGGAAAATGTTTTGCATC CTATCCACTGAATTAACATGCCAATCAAGGTGCTGGGTCGCAATTGAAGAAAGTATAATGACGGTTTTCATTCTCACATCTCAGTATCACATAATGGACA GGAACTCCAAACTATTTTTGACTAGTCTACAGGAGCATTACCTATTAGCCAATGGTAAGCTGATTCTATAGTAAAGGATCCATCTTTGCAACACGTCATT TGTTATTGGCAAAACCTTGTTCTAATTTGTCTCTGATTTTTATATTTTTCTTTCAATGCCAACTAACATCTTGCTTTGGAGAATAGTCCCAAAAGTTAGT ATCCTTTAGGTAGACTTCATTTATCCACTTTACCTGTGTGAATCTGTTTTGGTTACCAAGTATTGCATTTTCCCATATATTCAATTCAGTTTGAACTTCC CCACAGCTGCTTGGTTCTATGCTCCACAGTTCCTAAGTAGTCTTATTTAAGACTCTTAAGTTAAAACATGCTAAGCAGAATCAACTTGTGTTGAATCAGA CAGACCTTTGTTAAATAAATCTTGGTATACTCTACTCTATCTGAACATAATCTGATAAAGTCTTAACCTGACAAAAAGTTTATTTGTGTTTGCACAAATC AGTTCCCCTTGTCGTGCCGTATGATTATTTTGTTCGTAAGTCCTAGTGGAGGCTGCCATTTGCTTTCCATTCCTGCATAAATTGAAGTCATGCCTGTGTC ATCCTCATCCTGAACATATATCAGGGAGCAATTCATAAACCACACCTTGTTCTTTTAGAGTGCCTTCCTCATTTTCAAACAATGATAGTCTCTGGAGTTA GTCCATTTATTTGCATTGCAATGAGAACTCGAGCAACACTGGTTTTTCTTCACTTACTCTTAATTGATCTGCTAGTGTTGGTATCCCAACCAGACCAGCT TAGATTGGGAAATCCTGTCCAGATTGGCATTTCAATTGCCCTTTTTCATGTATTGACCAGGGTCTCACAATTATAAAGGCTTTGTATCAAAATGATAATT CCCATTTCCATTGTTTCATTCTTAGCTGTAAGGCTTGCAAATTTCATGGTAAATATGTCATTGCTCATTCAGTCATTTGTAGAATTTTTTCAATTTCCAT TTTACTTCATCTCTTTAGAAAGCCTTGCATAGATGGGTATTCCCCAAGAACAATGCACACTATTGCATTTTCCCATATATTCAATTCAGTTTGAACTTCC TCACTAGCAACTTTCCCAATTTTATGGTCTCCATTTTCAACAGGTTTAACAAATTGCAACTTACCTTCTCACCATGAATCTCAAACCTATCGAGACGCTT CCATAGATCCTAACTGACAGCAGGCTATGCAAGGAAAACTATAGGGTTTGGAGATCAACACATGGTAACTGGTTGATCATGCTTATGGCAATAACCTAAT AGGTTTGAAAGTTAAAACTTAAAACTCATTGTGGTGGTTCTGTTTAGGGCTACAAGGTGCATTTGGTGGCAAAAGGCTTTACACTTGAATATGGCATTGA TTTTGAGGAGACTTTTGTTCCTATGGCTCATGTCAATTTCATTGTCCTCTTCTTGCAATTCCTGCCACAAAAAAATGCTCTGTAAGTAAGATAGATGTCA AGAATGCATTTCTAAACGATGATTTAAATGCAAAAGCTTACATGCGATCTCTTCCTAGTTATACCTGACCTCCTCACAAAGTATGCAATCTCCTCAAGGC TCTTTATTGCCTTAAACATGCTTCTTATTCTTGGCTTGCTAAGTTTCATGATGCCATTGCTCGACTAGTGTTCTCTTCTAGTCCTTATGATCATGCACTC TTTCACCGCAAGACAAGTCATGGTACTATTATGCTTCTTTTATATGTTGAGGACATTGTTATTACAGGGGATGCTTATGATGGTATCCATGAGCTTACTC AATTTTTGACTCAACACTTTAAGATGAAGGATCTTGGTCCTCTCATTTACTTTTTGGGCAATGGGATCCTGTCCACTGATAATGGGTTGATCCTCTCACA GGCTAAATATGCCTATGATGTCATTTCCTAAGTAGGATTCAAAGATTGTAAAAGTGATTCCACACCTCTCGAGACCAATGTTTGCTTCTCTCCACTAGAC AAGGCTCTTCTTGATGACTTGACACTTTATTGACAGTTAGCTAGGAGCTTAATTTATTTCATTTTACTTGATCTGATTTCACATTTGCTATGCACCTAGT CTGTCAACTCATGTATACACCTCAGACCACCCATTGTGTTCTTGTTCTTGGCGTTTGATATATATATTAAGGGTACTCTTTTTCATACTCTTCATTTCTC AATGAATTCTCCTTTGATCCTTCATGTTTACTTCGATGCTGATTAGGATGGCGGTTCCACTGGTCGCCACCCTATTACTAGTTTTTGTATCTTTCCTATT TCCTCTCCTTGAAAACTCAATAATTTATTGGCGTAGTAAGATACAACAACTTGCTTTCTAGCATTGAGGCAAAATATTGATCCATGGCTGATACCACCTC TGAGGTCATATGAATTCACCAGTTTCTTGGTGATCTCGATTTTTCTCAACAATCCCTATTGATCTTTATTACGACAATCGTAGTGTATTTCAAATTGTTC ACAATGAAGTTTTCATAAGCGCACCAAGCATATTGAGATTGATTGCCATATCACTTGTCAACAAGTTGTTCGTGGAACCAATCATCTTATCCCTATTTGC ACTTTTGAGAAGATGACTTACTGGATCACGAAAGCCGGTCACCCTAGTCGTTTTTGAACTTCAGTTTCGAAACTCAAGTTGGTTTCTTATTTATGCACTC AAATTTAGGGGATGTTGCAATATATATTTATGTGCATTTTAGTCTTATTGTTAGGGCTAGTTTTGTCTTTTTCCTTTTTCATATATATATATATGCTTGT TATCCCTTTGTAAAAATACAACACAAATATATACACTTTTCATTTTTCCTCTCTTCTCTCTCTTATGCTAAAGACTCTCCTCTTATCAATTCTAGATTTT TAGATCTCACTCCATTCTCTTTAGCTATCTTTATCTAACATCACGCTCGAGCGACTCGATGGTAGAGTTAGCTTATTGTTTGGGTGCTCATCCTTAATCA TTCAAATTCTTCACTACTTCTGAGTGGTAGATCAAGACCGTAGCTCCTTATAGATTTGAAAGGCTTGCTACATAAATTCAGGACATTATTGGCTGGTTCT TCAGTGTCCACCAACAACATGATATTCAATGATTCTGCAAGGGGTAAAACATGCCACCAGTGCCGGCATAAAATTACATGTTTGGCAGCTTCTTGTAAGA ACCTGAAAGAGAATGGGAAGGCTTGTCCCCTGAACTTTTGCCAGAAATGCCTCCTTAACAGATATGAGGGAGAAGCACAAACGGTGGAACCGTTGAGTAG ATGGATCTGTCCAAAGTGCAGAGGCAAATGCAGTTGCAGTTGTTGCATGGGAAAACAAGGCCTTAAACCTATTGGTAGATTGGTGAAGAAAGGCAAGGCA TTAGGTTCTAATAGTGTGGAAGACATGGCATTAGGTTCTAAGACTGTGGAAAACATGGCATTAGGTTCTAATAGTGTGGAAGACATGGCATTAGG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_46072; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_92599
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Copia protein from Sophophora with 28.57% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_020982505.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |