Id Trinity | FTRINITY_DN54828_c5_g2_i9 |
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Name Transcript | Ll_transcript_92607 |
Sequence | AATTAACATACTAAAATAGCAGCGTCAAATTTCAAACGAAGACGAAGTGTTAATTAAATAATGTAGTTATTCATTTTCATATTTATCATTCATTATTTCC TATCCGATATACGAGTTTGCAACGTGGGTGGAGCTACCGTGTGTTCCGGTCACCGGTTTCCATCACAATCCATTTTCGCTTAGTTCCATTCCATTATTGC TTCATATCATTGCAGATATGATCTTTGGGGAATACTTCAATGCTGTCCATTTCTCGCTCGATTTGAGTAAAAGAAGGTCGGCCCAATACAGGAGGTTTCT GGGGAGGATAGATGTACGCAGCCTGCGAGTGGAGAGACTGTTTCTAGGATTTGAATCCGTGACCTCGTGGTCACTAAGCAACAACCTTACCATTGTTGTG ATTTGAGGGTATCCTGGATTAGAGTGTTTAGATATGATTTTAACATATTGCGGCATTTCAATCCGAATAACGTTAAGATGGACATTCATGATGACAATGT CGCGTAAAATAATCTTCGACAGTTTTGGGAGTTTCCCTGTGCATTGGTGTTTTCGTGTATGCTGGTGCGAGTATGCCGAGCTTCTATTTGTTTTATCATG TATCCGCCATTGGACCATGTATTTAGCAGTATGCAGAGCTCAAGCCAGTCCCACGCCTCGCATATTCGGAAATTCAAAGCTTGCAGGAGTAATGCATTAC CCCAATTCTAAACAAGTAAGTTCATGATATTAAGCAAATTAAAAGCAAGATGCTTAATACTTCATTTGTAATCTGTTTCTTAGAGCAATCTAGATTTAGT AATTTAAGAAAGGAGATAATGCAATGTGTATGCTTTATTTATCTATATCAAGGGTTTACCTTACCAATTCTGGAATTTCTTAGGTGAAAGGTATTTTGTT 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Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_46072; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_92607
Blastp | Cell division cycle-associated 7-like protein from Mus with 36.73% of identity |
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Blastx | Copia protein from Sophophora with 28.57% of identity |
Eggnog | Cell division cycle associated 7-like(ENOG410XQV7) |
Kegg | Link to kegg annotations (217946) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_020982505.1) |
Pfam | Zinc-finger domain of monoamine-oxidase A repressor R1 (PF10497.8) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |