Ll_transcript_92192

• Id Trinity: FTRINITY_DN54833_c1_g2_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_92192
• Sequence: CTCTTCTTCTGTCACTTTTTTCCATTTCATTTCAATTCGATTCATTCCCTTTTTTTTATCTCACGCGCCGCCGAACCATGCCGTATTGTGATATCGGAAC GCTGGAATCACCGTCACCGTCGTTTTCTGCTGCCAGTGTTGTTTCTGATGATTCTCAACTCAACAATGATTTGAAGATTTTTTATAGAACTTATGGACGT GGTCCTACTAAAGTTCTTCTCATCATAGGTCCTTTTTTGATTCATTCTTATTTTGTTACGCAATTAGTGAATATAAGTCAAAATAGTCTATCCGATAAAA TGTCGGAACATGATTTTAATTTTTTCGGGAGCAAATTGGTATGATGATTTTGTTAGGTTATGTTTGGGAGTTGAGGTTTGGACGGAAAAGAACAGATGAC TTAAAAGTCATCTCAGAGAGAAAGTTGTCTGACAAATATATTTTATGGCTCTAAACTTTTTCCGTCAGTTTCCTCTCTGAAACTCGACTCGCAGAATTGT TAAGGAATTTTTTACTTTGTGTTTTCTGGGTTAGGAAGATTTTTGTTACCGTTGCTGATTTTACATGGAATTAACGGTCAGGATTGGCGGCAACGCACGA TTCGTGGGGCCCACAGGTGATAGGTTTGACCGGAACCGATGTCCCGAACAACGACACATGTAGTGGTGATGGTGATGATGATAATGAGTGCGGTGGTGGG ATCCAGGCATGCGCGTTTGATAATAGGGGCGTGGGTCGGAGCTCTGCACCCGTTAATAAATCTGACTATTCGTGAGTTTTTTATTGTTAGGGAATTCTCC AATTTTCATTCATTGTTAATTTAATATCAATGATCCACCCACTTTTATTATCTATTAAGCATTTATACGTAACTATTACATCACCCACCATTCGTTTAGA TTACTTTTTCCGTCAACATGATTAAATATTAAATATGAATGGTAGAGTAGATGCAATGATAGTATATAAGAATCATACACTGTTACTGTATATATCTTTT TCTCTAGAAGTAATACACATAAATATGAATGATATAAGTTGAACACAAATCTGCTCTCTCAAAAGATTAACTTGTAGTAAATTGGTTTTTGAAGATTTTA AGAATACAAATTAGTCCTCAGATTTCAAGTTGAGATTAGTCCTTTTTAGCCTAATTTTTTTTGGGATTAATTGATCCAACTTCAGATATTTAATGACAAA TTTGGAATCTTTGGCCACCATTTTGGATTTGTAGTTCTTCAGGAACCAAGTTGGTATACATGAGCGTCAAATTGGGTGTTTGTTGTAATTTAAAATTTAC TGACATACAGTAGAAAAGTTCTTAATTTAAATATTTATGCATTCATTCCGAAGGGATTTGAATAAGTGAATGTATGGTGGAACAATAAACATTGAAGTGA AATTTCAACCATTGAAGTGAAATTTTATTCGCCGAGTAATTTGAAATTGATAATTTTTGGCTGCAGAACCCAGATCATGGCAAAGGATGCCATTGCTTTA TTAGATCATCTAGGTTGGAAAAAAGCTCATGTTTTTGGGCACTCAATGGGAGCGATGATAGCTTGTAAAGTAGCAGCTATGGTTCCTGATAGAGTCCTGT CCTTGGCCTTGCTCAATGTAACAGGTGGAGGCTTTGAATGTTTTCCAAAGTTGGATCGACAAACAGTCTCCGTTGCTTACCGTTTCTTGAAAGCAAAGAC TCCTGAACAAAGAGCTGCTGTTGATTTGGACACTCACTACTCTCAAGAATATCTTGAGGAATATGTTGGAACTGATAAGAGAAGAACAATCTTATACCAG CAATATGTTAAAGGTATATCAGCGAGTGGTATGCAATCTAACTATGGTTTTGAAGGTCAACTTAATGCATGTTGGACGCATAAAATATCTCAAACAGAGA TTGAGGTGATCCAATCTGCAGGTTTCCTCATTTCAGTTATTCATGGCAGACATGACATAATTGCTCAGATATATTATGCAAAAAAATTTGCTGAGAGGCT TCAACCTATGGCGAGAATGGTAAATCTTCATGGAGGTCATTTAGTGAGTCATGAGCGGCCAGAAGAGGTATTAAGTTTGCATATAAAACATAATAAATCT CCGGAAACTTAGCGTTTTGTACTTTGCCTCTCTAGATTGACATTCCCATCATTCGTAAAGGTTGACATTGGATACATTTCAAAATTCAGGTTAATCAAGC ACTTTTTGACTTGATAAAGGCATCAGAAGTGAAGATGAGTCCACATGAATGGACTAATTTGCCAACGAAACAGTCTTGTAAGTATTCCACACAGAGGAAA ATATTTTTTCTTGCACTTCATAATTCAGCACGAGCTCACACATGACACATGCAATGACTGTTTTCTGTAGCTTGGTGGCTTGTCAACGTGTGGTAGTCTA AGCTTCAAGCCGAGACGGACCCACGTTGGTGGGTGTTCGGGCTCATGTCCCCACTTAAAATTTTCTACTATGTAACATTTTTGTCCCCGCAACTTAGTAA GGTTTGCCCCAAATACAAGGTGATAGGGTAAATTCCAATTTTAACTAACCACAGCCCATTCCTCTCTTTTGGTTTCGGACTTCTCTTAATTCCTCTCTTC TCAGCTGCAAACCCAATTTCGTTCACCCGGTGTTAACTTTCCATGGCTTCCTACTTGGTTGGATGATTCATTTAGCACCTAGCAGCCAAGTTTCCAAAGA CACTAAGTCCAATTTTAACTAACCACAGCCAATTTCTCTCTTTCGGTTTTCCGGCTTCTCTTAATTCCTCTCTTCTCACAGCAAACCCAATTTTATTCAC CCCATGTTAAACTTTCCGTGGCTTCCTACTTGGTTATATGATTTAATTAGCACCCAACAGCCAAGTTTCCACAGACACAGAGCCATGTTTCAGTGCATAC GTGGTCCCGGATGGATTCACAGGGTGGAAAGAGAAAAGGATGTTATTTGTGAGAACAGATATTCAGGGTGGAAGCAATGTCTCCATGAAGTTTTGCTTAT TACAAAAACTACATCACTGCTTAATATACTTCTTTGGTCTCCTCATCTTAGCATTTGAATATGCAAGAAAGCTTCTAAAAAATTTAAAGCCTGTAAGGGT TGGAAATTCATCCTCATAAGTTGAATATCAATAACCCTTTCTTATTTAAGAGTTGCACGTGGTTCGTAAACCCACGTCGAATTGAAGCCCGTGTTCAGCA AGGTGCGGAGCATG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_46087;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_92192

FPKM

• FPAB: 0.7
• FPNAB: 0.5
• LF1: 0
• LF2: 0
• LF3: 0
• LF4: 0
• UF1: 0
• UF2: 0.2
• UF3: 0
• UF4: 0

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_92192

• Blastp: Putative aminoacrylate hydrolase RutD from Methylobacterium with 25.62% of identity
• Blastx: Putative aminoacrylate hydrolase RutD from Methylobacterium with 26.03% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (Mchl_2054)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001750)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019434641.1)
• Pfam: alpha/beta hydrolase fold (PF00561.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;