| Id Trinity | FTRINITY_DN54849_c1_g1_i4 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_92878 |
| Sequence | AGGTCTTGTTCATCTTCAAGGTTGATTCTTAATGTGATTTTGTGTGGAAATTAAAACTTTTAACCAGCGCTCATAAAACCCTTTTATATGTATTAAGTGA AGGAATCCTATTACTGTATTTGTGCTACTCTAGCATGAATAGAACCAAAATTATTTACATGTAACTTCAATCCGATGATTTGGTCCATAATTCAGGTTTG ACCAAGTTGGAATCTCTCAATTTAAAGTGGTGTAATTGCGTAACAGATGGTGATATGAAGCCTCTATCAGGTCTGTTGCATCTTGCTTCCTTTATGCTGT TAGTCTGTTTTCTACCATGGATTAGGTCCTTCTCAGATTATTGGTATCCTCTGGCGAAGGGCTTCCACATTTTATTTTAATTTCTTAACTAATGAAATGA GATAGGTAGTTTCTACCCTGTGATGGCTCATTGCTTCATTGCACTATGACAAATGTTGGTTGGTTTTACGATGTTGTAGATAAAAAATTTATCCTCTTTC TTTTTTTAAATGTCGAGGACAACCAAGTACATATGAGACCAAGTAGAGACGAGACCAAGAGAAAAGACATTGGTAAATCTAAGACATGAGGTTGAGGCAG AGAGCATCGAGACTTTGGGTTTTTATGGAACACTAATTTCATATTGATCGAATGGGGTGTTTCTGTTTCTGATTATTAGTCATGAGACTTCAATTTAGGT GTTTTGGTCATGAAACAATGTTATTTAGGGTGTTTAGAGGATATAACTTAAGTGTGTGATGAAGTTGAAAACTCGGTGGTGAACTCATGAGTTTATGTGA ATTTATCCAACTTAATCTAGTCTAAGTTTCCATGTGAGTTGGTTTGATCCCACCACCCAAACTTGCCTAAACTCGTAATGGTTTTACTGGTTAATACTAG AGTTTAAGAACCGTGGGTCCATGGCCATGTGTAAATCAAAATTTACACTATTTCTAATTATTCAATCTATTTGGGTTAACTAACTATTCAAACTATTTCT AATTACCCGTGTTCTACCATTAACACACACACCCCTTTGGGTTTGAAGCGTGGACAATGCATGAGCTTATTGGTAAAATTCAATTTAATTATGAAGAACA GGGTGGCCAGGATCAAACTCTTGATCAGTTGGTATTAGAGGCTTTGATCCCATGTCAGAAACCAATTTTCCAAAAAGCTTGTGGAAGTCCATATCCATGA ATGGTTTTATATCTCTGGGAAAGGATTGTGTTGGAAAACCTGTGCGTCCTTGTTTATATAGAAGTGTAATCATTGTCTTCTCGGTAGATACATGGTTCCA TACTTAACACTACAACTTATTTAACTCAATTTGATTCCAGAGCTTGCAAGCTTGAAAAGTCTAGAGATTTCTTGCAGTAAAGTGACTGACTTTGGCATCA GTTTTCTGAAAGGATTGCAAAAGCTTGCCCTGTTAAATCTGGAAGGTTGCCTGGTGACCGCTGCATGTTTGGATTATCTTACAGGTTGAATTCCTTCGTA GACTTGTAGGCTTATTCGTTAATTTTGTTGTGATTATATTCATAGAGGGTGAGCCTCAACACAATGACAAGGTTGCTGCTTAGTGACCAATGAGGTCACG AGTTCAAATCCTGGAAACAACCTCTCCGGTTACAGGGCTAAGGATATGTACATCTACCTCCTCAGAACCCAGTTGTGCATTGGGTCTTCCTTCTTTTTTA TATATTTAGACATACTGGCACCAAGTCACCACCTAGTTGTTCGGATAATCTTTGGTTATTGGTCCATGAATGCTTTAAGCTTGTAGTTGAAACACTGTTT ATCAGGATACCTTCAGCATATCAATCCCAGCAGATTGTGATGTGAGCAAAGAAAGTCCCCTGACTGCGAAATTTTAGACAACAAAATATGGGGTAGAAGA ACATGATATGAACAATTAAATCATAAAATTTATATTGCTGAGTTTATTATTTATTTTAATCTTATTTTTCTCAGGGGTTCAGAGTTTAGACCTTGATATC TTTACAAAAAAAAACATGACTTTTGTTTCCATCAAGTCAAAAGTCAAAACATTATTCACCTTTTTGCTTTATTCAGTAGCTTTGAGGGTTTAATATCATG TGTCTGCTTGACCCATTTAAAAGTAAGAGGTTTCAACTGATCATTATTATTACATAAACACACCATTATTTGAACCAGCTGCTATTAGTTTTATTATTAT CAGTGAACTTCTTTTGTTGGATGTAAAGTTTAACTTTACTACATCTTTCTTGTGTGTAATAACTTACTAAGACCTGAATACTGATTCAAAGTTTTGATTT GACGTTGACATGTTTCCTGCCAGAGCTTTCTGCCCTATCAACCTTGAATCTTAATAGATGTAATCTTTCTGATGTTGGATGTGAAAAGTTTGCAAGTAAG TTGCTAAAACTTGTATAGCCACCTTTTTAAGGCCATAATTTTATATAGAGATACTAGATTAAGAGCACTGGTTAAGGAATCAAAGATAGAATGATTTTAT TGAAATTGGTATCACAACAATCAAATCTTAATCCCACTTGGTGGGGTCGGCTAATTTTGTTGAAATTGGTGTACTTAATTAATTAAAAGTTTAAAACTTG TAATTTCGAGCACAACGTTATACTTTTTGATACCTTAGCTAGTGCCCTAATTAGCAAGACCCTTTTACATTTTATAATATTCTTATTAGATTTTACATTT TAGCACAAGAGGATTATTGGGGGCTCTAATTTTGTAGCGTTACTTGTTACTTCTCTCTCTGTCTCTCTCACAGGACTGGAAAATTTGAAAGTACTAAACT TGGGATTTAATGACATAACGGATGCATGTTTAGCACACTTGAAAGGTGGTTTGAAACACTGGCCCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCACACAA TGCTTAATTATCCTGTATTGCATGCAATCGTTTCGTACACACTATTAATTTGTGTGCTAAGAAAAAATATTCATGTATAGTTAACGAATGTAATAGAAAA AAATAAAGTTGTTTGCAGGGGCAGAATAAAGATCATCCATTATATTTGAAAAGAATGGTTTACCTAATAAACTTATGTGTTCATTCAAGCAGGATTAACA AAATTGGAGAGCTTGAATCTTGATTCATGTAGGATTCGTGACGAAGGATTGATCAACTTGGCAGGCCATAGGAAATTGAGCTGCTTGGAATTGTCTGATA CAGAAGTTGGAAACAATGGGTTACACCATTTATCAGGTTAGATATGGCAGTTCCTAATTACTTTCAACGTTTGTGTGCTCGTATTTCATTATTATCTGTC TTTGATTATCTAAGCTATTTTGAGAAATACTTTCGCAGACTATAATTATCTCTGATCATTGTTCCTGTTGCATCTCATCTGATTTGGTAATTCATGATTG CTTCCCTTGATTGTTTGTTTTGGGTTGCTTTCCTTCTTGTTGAAGTTAGCTTTATCCCTTTGACATTGCTGACTGCTGAGTATTGAATAGAACTTGTCAG TGGGAGATATGAATATGACATTCTTTTAATTGTAGTGGTTGATTCATAATTCAGTAGGATTATTATTTCCATGTAATATTGTGTAGTTTTCTGCAGTTAT CTTTGTATTCGGCTCCAGTTTTTCTATTTTGATTAATTTGTAATACTATTTCTTTTAGGATTGTCTAGTCTGGAGAGGATAAACCTATCATTCACAGTGG TTAGTGATAGCGGTTTGAGGAAATTGTGTGGACTCTCATCTCTAAAGTCACTTAATTTGGATGCTCACCAAATTACTGATGCTGGGCTGGCAAACCTTAC AAGTTTGACTGGGCTTACTGAGCTGGATCTGTTTGGCGCTCGAATCACAGACTTTGGAACAGACTATTTGAAAAAACTTAAGAACCTGACATCCCTGGAA ATATGTGGTGGAGGATTGACTGATGCTGGTGTGAAAAATATCAAAGAGCTTTCTTCTCTAATGTGCTTAAATTTATCACAAAACTGCAACCTTACAGACA AAACCCTGGAGTTTATTTCTGGGCTTTCTGGGTTGATTTCATTGAATGTGTCAAATTCTCGTATCACAAATGCTGGACTGCAACATTTGAAAACACTAAA GAATTTGAGGTCTCTGACATTGGAGTCATGTAAGGTGACAGCAAATGACATTAAGAAACTTCAATCAACATATCTCCCAAATTTGGTAAGCTTCAGACCA GAGTAGTTACTAAGGGAGAGATATTCTGATATGTATATGTATATAAATAAGATATACTAGCATATGTTAGAGAGACATGGGAATACAACCTCAAATTTGT ACATAGGCTAATGGCTTCATGAAAGGGTTGATGCTATGATGATATGTATATATATAAGGGTAAGATGTAATGATATATGTTGTGGAGAAACATGGGATGA CAATTTCATATTGTATATAGGCTATTTATTTTATGCATGAATATACTTAAGCATTATGCTTGCTCAATCAACACTAAAAATTGTTGTTTTTATTTTGATT TTCAATGATTATTTTTTCTCAAAAAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_46251; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_92878
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | F-box/LRR-repeat protein 14 from Homo with 33.88% of identity |
| Eggnog | protein ubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process(ENOG410YK3H) |
| Kegg | Link to kegg annotations (144699) |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000802) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019456694.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |