Id Trinity | FTRINITY_DN54849_c1_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_92881 |
Sequence | AGGTCTTGTTCATCTTCAAGGTTGATTCTTAATGTGATTTTGTGTGGAAATTAAAACTTTTAACCAGCGCTCATAAAACCCTTTTATATGTATTAAGTGA AGGAATCCTATTACTGTATTTGTGCTACTCTAGCATGAATAGAACCAAAATTATTTACATGTAACTTCAATCCGATGATTTGGTCCATAATTCAGGTTTG ACCAAGTTGGAATCTCTCAATTTAAAGTGGTGTAATTGCGTAACAGATGGTGATATGAAGCCTCTATCAGGTCTGTTGCATCTTGCTTCCTTTATGCTGT TAGTCTGTTTTCTACCATGGATTAGGTCCTTCTCAGATTATTGGTATCCTCTGGCGAAGGGCTTCCACATTTTATTTTAATTTCTTAACTAATGAAATGA GATAGGTAGTTTCTACCCTGTGATGGCTCATTGCTTCATTGCACTATGACAAATGTTGGTTGGTTTTACGATGTTGTAGATAAAAAATTTATCCTCTTTC TTTTTTTAAATGTCGAGGACAACCAAGTACATATGAGACCAAGTAGAGACGAGACCAAGAGAAAAGACATTGGTAAATCTAAGACATGAGGTTGAGGCAG AGAGCATCGAGACTTTGGGTTTTTATGGAACACTAATTTCATATTGATCGAATGGGGTGTTTCTGTTTCTGATTATTAGTCATGAGACTTCAATTTAGGT GTTTTGGTCATGAAACAATGTTATTTAGGGTGTTTAGAGGATATAACTTAAGTGTGTGATGAAGTTGAAAACTCGGTGGTGAACTCATGAGTTTATGTGA ATTTATCCAACTTAATCTAGTCTAAGTTTCCATGTGAGTTGGTTTGATCCCACCACCCAAACTTGCCTAAACTCGTAATGGTTTTACTGGTTAATACTAG 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TGCTGATGCTTTCTGGGTATTTTTGACCTGAGATTTTAAGTGTGTTCTTCTATCTTTAGGCTTGTTCCACTTCATTAACAAAAAAAACATGAGTGTAGTA GGCATAACATGTTTCATTGAAGAACAACACTACAAAAACCCAACATTTTTACCCAAGTTTTGTTCTCTCCTAGTGCAGGACCATAGCTGTCTCTAGAGTC TATAGACAGATCCCTGTAGAGCTGTCAAAAAAATCAAATTTAATTACAAATTGAATAGATTTTAATTTAATTGACCAATCACAAGTGTTTGACATAGTAA GTATCACAGATTGTGGGAAAGTGATTATAATCATCTCTGTGCTGACATGTTTATGCACACAATTTCAGGGCTTTCTGGGTTGATTTCATTGAATGTGTCA AATTCTCGTATCACAAATGCTGGACTGCAACATTTGAAAACACTAAAGAATTTGAGGTCTCTGACATTGGAGTCATGTAAGGTGACAGCAAATGACATTA AGAAACTTCAATCAACATATCTCCCAAATTTGGTAAGCTTCAGACCAGAGTAGTTACTAAGGGAGAGATATTCTGATATGTATATGTATATAAATAAGAT ATACTAGCATATGTTAGAGAGACATGGGAATACAACCTCAAATTTGTACATAGGCTAATGGCTTCATGAAAGGGTTGATGCTATGATGATATGTATATAT ATAAGGGTAAGATGTAATGATATATGTTGTGGAGAAACATGGGATGACAATTTCATATTGTATATAGGCTATTTATTTTATGCATGAATATACTTAAGCA TTATGCTTGCTCAATCAACACTAAAAATTGTTGTTTTTATTTTGATTTTCAATGATTATTTTTTCTCAAAAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_46251; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_92881
Blastp | - |
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Blastx | F-box/LRR-repeat protein 14 from Mus with 36.72% of identity |
Eggnog | protein ubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process(ENOG410YK3H) |
Kegg | Link to kegg annotations (101358) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000802) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019456694.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |