Ll_transcript_92350

Id TrinityFTRINITY_DN54877_c5_g1_i2
Name TranscriptLl_transcript_92350
SequenceATCTTCAAATGAACTTTCTATGTCCCTATCCAGTGGTGTCGGCCAAAAATTGGTAGAATGAAACATAAGGTAAATGTAAGTCTAATATTCATACTCAAAC TATTGGAGGTAGAGGTATTATCCGAGATCATAATGGACATTAACTGGTAGGTTTCTCTACAATTTTTGTAATTGGGTCTCCACCTGGCAGAACTACTAAC TACAAAACATGATCTACAATGATATTAATTTGCAGAATATATCTCAAGTTATTCAGCTTTGATTAAAATAAGTTAGGATATTGAAATCCAACATATCTTG TATGAGAGAAATGGATAAATGGTATCCATTATTATTAGTATGAGGAAGCAGAGGCAAGTGCAAGTGGATGAGCGTGACGGTGTCCTTGACAGCGTTTAGA CAGAACATCGTCGCGAGAAAGAAAGCGACCACAAACGGAAACACTTTATGTCGTACACGTGTCCCTCCTCAGCGGACTCCAAACGTACGATTTCTAATCC TACAAACCCCGTGTGCCCAAAATATAAAAACCATTTGGATTCCGTCCAATACTAATAAAAACAACGCAACTTCCACTCTCTTCCGTTTCGTGTCACCTTT GGCGGTTTTTAACCTTTTTCGGTTTTCATCATTCATTCCTTGAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCAATTCAACAATACTTTGAGGTTAGAT CTTCGAACTAGTTTATGTTCTTAATTCTATTGTTTCTGATGTTAGATTAGATCAATTATACTTTGAGATTGGTTTTGCTTGATGAATGAATGAGGTTGAG GTTTGTCGTAATTTCATTTCTTCATTTTTTGTCACTCCGCACACGCTTTCTCAATCAACTCGTTTTTACTGTGAAAAATTACGGAGAAAATGGGAGCTTA ACTGAATTGGATTATGCTGTTTTCACTTGGTTTACTTCAAATCCGAATTGTGCTTGTAATTCTTAGCTATGTATGTTGTTTTGCTTTACGAATTGTTCTT GACCTATATATTTTTTAAAATATTTTAATTATCAATTATTGATATCAGTGACAGAAGTAGTTGTGTTAATGTAGGTCACTGTGACTGATTTTGTTGTTTT AAGATTAAGAAAAGTATTCGATGGAATTCGGAATGGACTAATTGATGATGGTGTGTAGTTTTTGCAGTGGCATGAGTGGTAGTTGTAGATTAGCTAGCAT AGTATGGTTTTTCCAATGAGATTTTTTCTTGGTGGAATTCTCCGCAATAGGACAGTTAATGTGGCTTCTCTGTGCTATTTGGCCTTTTGGTTTCTCCTAA GGATTTACGAAAGGGCTTACTTTTTCGTGTTGTGTTTATGGTTTTCTAGTCCGAGAGGTGTTTGGGAATTATTTGAGAAGTAAAATTGACAAGCTTTTGG ACTGGTTCTAACATATGGTCGTTCTGGTGATATGCAGTCTTAATCCGAAGAAATATGTTTGTGTTATCACTTTCACACTAGATTTTCTGCAAGAGTACAT ATAATTTGGAATTAATAAGAAAGAATTATTTTGTTCAAGATAACTACCGAGTCTGAACCTGTGTAATTACTGTGTTCGAGATTCAGACTAGATTTCTTGG TACATTGAACTTAGTTTTCATGTAATTTAACTTTACAGAAACAGTTGTACTGTTGTCGTACCACATGTTCTTTCGAAGAAGATCTTGCATTTACAATAAT GTACACATATGAATGCTGTACACATGCTCCTGTTCTTATGTTCACGAACATGCATTTATCATCTCTGTGTGGATATAAACAATGAAAAAAGTAAGCTGAT GCACATTGAAGTTGTAGGATAATAATCAAGAGAACTTGATTTGGATCGGAAAGAATATTTGCAGAGGCATTCCAATATGAAATGCAAACGGGTTCAGGTG GGTGAATCATTTGTACCTGTTCTTAAAGATGAAGAAATGGAAGTTGAGCATTCACTTGAAGAACATAGAAATGGTCATATTTCAATGGATGGTATGTTGC ATTTTAATCAGGAGAGTGTAGGGGAATGAATTGTGAAAATCTTTCATGTAGTTTTGAAATCAAGTACTATTACTCAAGTGACCTAAACTAAAGTTGTTTT CTCTGATTTATTACTTGAATTCCATATATCAGCTTATCAGGAAGTCGAGCCTTAATTTGAGTATTTGTTGGCTAGAAACCTTTTTCTTTAATCTTTACAT GTATTTTGAAATAAATGAGGAAGTAAAATTCTGTGGCGAAAGAATGGAAGATGATACCAAACTGTATGAGAACCTAAGTATCTTTGACGAACTTCGAATA GAAGTTTGGAATAAATGGTGCTTCTTCAATGTTCTTGGTTCCTTGCAGAGAGATTGACATGCTTTGCTGCATGTTTATTTCTCTCTCTGTATATATATAT GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATATTCTTATTTTATAGAAAAAATAAAATAGTGTTGCATCTTCGCTGATATGAAATCAAATTTTTAACTCTATATGAT ATATTATCTTGGATTAGATAATTTTTTGTTGTTATTTTCCTAGTTACTTGTCATGTTCTATCTGATATTAGTGTGCTTGCATTCAGCAGGCAGTTTGGAT TCTCATACAACTTTGAATGGCATGGATGATTTGGGACTGGAGGTATTGGTTTTGTCTATGTTCGGCACTTCCAGTTATTACTGGGATGATGTTGAAGCTA GAGTAGTTCACATATTTTTGTATTTAAAATGCTTGCTATTGATTGCTTGTTGCTTGAGTCTACCCTTCAGGTTTATATTGTCTCATCTAATGTCGATTGC TTGATATACCCTGTTACGTATTGCTAAAATTGTTTGAATTCTTATTTTGTGGGCATGAAAATTATCTTTAATAAACATATTGTTAGGTTCTTGATGGAAT CCTGGATGATGTTGAAATCAATGATCTTGATGGAATCGATGCTTTCTCTGGTGCATGTGACGAGTATTTTTTGGATTGTGACTTTGTCAACAATCCTGAG GTACTAGGCTATGGTCTTTCTAAAGGTTCACTTTTGCAAAATTCAAGTTCGGAAACTCATTCTTCAGGATTTAGTGGAAGTAGCATTGTTGGTGGGGGAT CAGAATCAACAAAAGTACCCTCTGCACAACCTGAATGCAAAAGTGACTCTCCAGATGGTACAACAACCTCTGAATCCTGTGATGCCTTAAGAAACAATCC AAGTCAACCATCAAATGGAGATTGCATGTACGCCATTTCACTTGACATGAAGCATCTGCATGAATTGAATAATGATCACCCTCTAGCTGGTGGTCTATTA TCTTTTGAGAATGAAAAGGATGCTGTTGAAGAATGGCAGCCTTCTGCGCTTAGAGAGAAGAGATTCCGCAAGCCTACAAAGAGGTATATTGAAGAGTCTT CAAATTTAAGGTCAAAGGAAAAGATACCGATTGCTGCTACAAAAAGTAAAAATTTGACTTTGTCATCATTTGATGAACTTAATGTGAGACCTAAAGCATT GGGAAAGATTCCAGGCGAGAAGTATAGGAATGAAAACAGTGATGTGACACTTCCTGCGTTAAAAGTTTGCAGGGGACGTCCAAAGAAAAAGAAACTTGAA AATGACAAGGAGCCGCTTACCTCAGAGTCTGAGGATGAACCGAAAAGGAAAGATCGGAGAAAGAATCAGAGAATGTGGACTCTCCCTGAAGTGAAGAAGT TAGTTGATGGCATATCTGAATATGGAATTGGTCGGTGGACTAATATAAAGAGGTTTTTCTTTTCTTCTTCAAGCTACCGAACACCCACAGATATCAGGGA CAAGTGGCGTAATCTTTTAAGAGCCAGTTCTGCACAAAAATCTTCCGACAAAGAGGCTGAGCAAAATGACGAGCTTGCCTTACGCCCCTTACCAGTTGAA TTGGTACAACGTGTGCGCGAATTGGCTAAAATTCACCCATACCCGAGGGCACGTGGCTCAAAGAAATCATGTGTTAGTAGTAGTCTTGGCAAAAGAAATT TAAAGAGGAAGAGGTGTTCTTAAAAGTATACCTCCATGCCATGTGTAACAGTCTCCAGTGAATCCATAGTCAGAAGAAACTTGTTGAAATTTCGGTATAG ATTGCCTTTGCCTAAATTTTATACTTCCAGTTTCAAGTAATTTATGCTTGTGTATCATCTACAAAGGCATAGAAATTTTGTGTAAACTTGAGGAGTAATT GTTTAGCGTACATTAATTTGTTATGCTTAATGCGTAACCTCTGCAATAATGACTTTGTTTAGAAGACTGCAACAAGACATGAAGCTTGACCATGTGTGAC AACTCTGCCCATAGCTCACTATTTCACATAGATGGCTGAGTGAAGAGAATTGGTAACCTAAGGTGAAACCATTGACACATTTAATTATCTATTTGCATTG ATACATTGACCACCTTGCCCAGTTAGCTCGATGCTCTTCCGTGCCGTGCAAAATCTGGTTAAACTGGGATAAATCGGAATTACCTCATCACTAGACTGGA CTATTCAAATGTCTTCAAAAGGAGGTCAATAAAGAGGTTAATCTCACCCAGAACGAAATATAGTAAGATAGATCTCACCCATATGAAATCGTACAGTAGA AATGAAACAAAAGTGAAAAACAGAAGTAACTGTCAATCCTCTGTTACCTGCTGTCCATTGCTCGTTCGTCGTCCACTATCAATAGCTAGAAGAATATCAA AAAAATCCTTATATTGGTAATGTAAAGCCTTAACCATTATTGTGTTTAGATTTTTGTTTTCATCTTAGTGTGAGAGATGATATAACAAATATTACTCAGA CATTAGGGATGACAATGAAACCGAATTCGTGAATATCCGTTCATATCTAACCCAAATTTAAAGGGTTAAACCCACTGTCAATGGGTTCAGATTCGGGTTT TATACTATGTTAATTTTCGGGTTCGGGTTTGGTACATGTGATACCTGATCCCGAACCCGACAAGAACCCGAAAATATAGTAGAAAGTGGAGTTGAGACTA GTATATTATTAATATGTTGAGAGTTTTACCTTGATCTTCTGTCTGTAATGATAATGAATATTGATATGTAATGATATAATGGTCTAGATATTATTTTTCT AAACTACTCTTAACCTATTTTAGATAGGAAAGTCATGAAGGTTTTCTTAGAAAAAGTTGTGAATCTTAGATATTTAATGTGATTGTGATATAGAAAGGAC AAAGAGCTTTGTATGGTTCAAGATTCCAGTGAATAATATTTCTTCTGTGTTGTCTTT BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_46598; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_92350

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_92350

BlastpTelomere repeat-binding protein 4 from Arabidopsis with 29.79% of identity
BlastxTelomere repeat-binding protein 4 from Arabidopsis with 29.79% of identity
EggnogTelomere repeat-binding protein(ENOG4111C5T)
KeggLink to kegg annotations (AT5G13820)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019460804.1)
PfamMyb-like DNA-binding domain (PF13921.5)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;