Id Trinity | FTRINITY_DN54903_c3_g1_i9 |
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Name Transcript | Ll_transcript_101385 |
Sequence | CACAGTGGAGGTTGCGCCGGAAATTAAGCTCTGTTCACATGTTCTCTGGCAAGGCATTGGAGGATTTCACACACTTGCGACAGGTTAGTCTCCAACAATT ATTTTTTTTTATGGGTCACTTTTAGAATATAAATGTTAGTATGTTAGTATTTTTTTATGGGTGAGATACCATCAAACCTCCTTATAACTCCCTTTTTGTT GATAAAATAACTCGAACCCACGACCTTCTGCACTCCGGTCATAAATCCAACACGTTTGCCATCTCCAACAATTATTGTTAATTATTATTATAAACTTTTT TTACGCTTTTCAACATCTTCATAAGACCATAACTGGGGATGATTGATTTTGCGTACATCTTAATTTGGATAAAGATATTATTGTGTCTTCACGCTATTCA TTTTCATATCATATCTTATAATAACTTCTCTTGATACTACATAAAAATATAGTTTCATTACATTTATATGGACGTAATTGTGGTATCAGCACCATGTTTA TACAATGATATGAAAGACACCAAAATCACACACCTTCCATATATAATTTTCATTCTATGATATTTTTAAAAACAGATTATTACCAAATAGTTTTAGGGTT CACATAAAAAAGCTGATTTCATAGGCGAAAGATAAGACAATATAGTATATGATACTATAAGATTCTAATAAACTCACATATATTAAATTTAAAGTTCGAT TCACTTGTTGAAAATGACAAATATATGATTTGAAATGAGAAATCATATAGCTACCTACTAATAAAGTGGATGAATATCTTTAGTTATCTTAAAAAATATT AGACATATCATTATTTTATTCCTATCTACCATTGTATCATGATTATAAAAACATGTTTTTGTAAATTTACATGAAAAAATAAATCAGTAATCTAAAAAAA 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AAGGCGACTGTGTTAGAAGGATCTATATGGCGAGACATATTATTGAGAAGTACATAGTTGCAGGTGCAGCGATGGAGGTAAACATTTCTCATAGAAGCAG ACAAGAAATTCTGACAACTTCTGATCTTGCTCGCGCTGATCTCTTCCATAATGCACTTAATGAGATTATACAGCTCTTGAAAATGAACCTTGCAAAAGAT TACTGGTCATCAATGTTCTTCGTGAAGTTTCGCGAAGAATCCGAAATGAGACCTAATGACCATGATTTGGAGCAAATGACAGGATGGAATTATTCTCCAA GGTTGAGCTCTGTGCAAATTACAGATGATCCTTTTCAGCATGACCATCTTCTCAAGAACTCTGGTTGCAGTGATACTCACTCATGACTTGGTTAAGTCTA TGAACCGAGTTTTATGACTTAACCGGAATGGTATTCCTTGGTCGACAAGAAAGAATCAAACTTTAGTCTCACTAGATTGGTCGAGTACAAATGATGCCAT AGAACTTTATCGTATATCATGTCCGATCGGTTTTAATTTTAAAAAGGACTTTCCTAATATACTTTTTTCATATAACGTATATTGTTTGACAATTACAAGG CTAGGATCATGTACTTGTCTTAGGTCTAGCATTTAAAAACTTATATGAAATCAAGATGTTGTATCATTAAGCCCAACAAAGGAGAAATAATATCTGAAAC CAATGGTCTCGAATATATTATCATCATTCATTATTTATTTGTATTTATATATTTTTAACTCGGAAAAGTAATTGACGTTGATTATATTTCGGGATCAATG ATTTCAAACCACCTAGTAATTCTTAGTAACAAAGACAACCCTGAGGTGTCTTTGACTGAGAGAGAAATATGCTACTATCATTCATCATTATTATTATTTT TTGCTTTATTAACATTGATTCGATATGAGACATAATATGAGATAATAGATTTCGGTTCATGTATTATGCCTGCTTCCATTTCCGGATATGCATATAGGAA GAGGTATTTGTGAGTATGGGCAC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_46813; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_101385
Blastp | Regulator of G-protein signaling 1 from Arabidopsis with 63.22% of identity |
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Blastx | Regulator of G-protein signaling 1 from Arabidopsis with 63.07% of identity |
Eggnog | Regulator of G-protein signaling 1(ENOG4111T7B) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G26090) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019438332.1) |
Pfam | Regulator of G protein signaling domain (PF00615.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |