| Id Trinity | FTRINITY_DN54909_c0_g1_i22 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_101230 |
| Sequence | TATCTTAAAGATTGCTTTTTTATCTTAAAGATTGCTTTTTTATCTTAAAGATTGCTTTTTTATTCACTTTCTTCATGTTTATTCAGTCTTGCTTCAGATG GGTCATTTTATCTTTATTCATTTTAATCTAAATAATGCTCCCAATCAATGTAGAAAGCACCTTAAATTTTATGTTCCTCTTTAATTTTTCAGTTTTTAAT CCTTTGTTCTGGGTACCAGTGAGTAGTGTTTTACATTACTAGTTGACTAATGGAGTATTCCATATGTTAGTATATCATTTTTTTCAAGACTTGTTTTTCC TCCATGGTTTCTCATCAATCAATATTGATATTATGGTTTATTTAAGCATAATTTGTGTAGATGTAGCCATCCTCTGTGAACATTTTTACTATTGCTGGTC AGAGTTAGACTCTTGAGTGTTGTAATGTATCTGTTAGAGCTCTGGAGCAATTGTTTCTTTTGGATTGGAAACTATATTCTTATGATGTTATCTTCTTAGG GATTTAAGACAATCTGTTTGTTTCTGATTAATGATTTTCGGTTCATCTAGATGTAACTTAACAAGTTCAATCATAAAAGCAGGTCACATGCATAGGCCCT AGTGAACTTATGTTGTCCAATTTGGCTATAACTCCCTAGCTTGCCAGATTTTGTCTTGGAGTATATAAATGGCGATAACTCAATATACAGAAGGAGATGG TGCAGAGTGAATTGGATTCGGATAAGGTTGACTACACTGGTATCAATGATGTCAAAAGTGGAAGCCTAGGTTCTGGCCTTCGCAGAGAGCCTTCGTTTTC ACGTTGGTGTGATGATGGAGTTGTCCATTTGGATCAGGAATTAGGTAATGTGGAAGATACTAGTGTAGAAGAAGACTCTGATTTTGAATTACCTTTTATT CAGAAGTTTGAGCTACAAGGCGGATCTTTAGATAGGCTGAAGCTCTTTCACCTCAAGTTTCAGCAAAGAAGTTTGCATTTGAATGGTGTTAGTACCATGG ATGAAGATACTATTCATCACAGAGGTAATGGATCGGAGAAGTATGTAACTTTTGATATTGAAAATGAGTCCAATGGGGGAATTACTGGTGTTGAATCCTC CTTTTCTGTGGATGCTCACGACTCATTGGAAAAAAGTGTCACCAATCCTATTTCCATTGCCAATATTTTAAAGGCTTTGTTTTTCATAATTGTTTGGTAC ACTTTCAGTCTACTTTTGACCCTGTATAATAAAAGTCTGCTAGGAAATGATATGGGAAAGTTCCCTGCTCCTTTTATGATGAACACTATCCACTTTGCAA TGCAAGCTGTTCTATCAAACCTTATCACCTGGTTCTGGTCTCGTAGATTCCAAACCAGCGTTGTCATGTCTTGGAGTGATTACTTTTTGAAAGTTGTACC AACTGCTCTAGGAACAGCGATGGATGTTAACTTGAGCAACGCATCTTTGATTTCCATTTCTGTCACTTTTGCCACAATGTGTAAATCTGCGGCTCCAATT TTCCTCCTTCTGTTTGCCTTTGCATTCAGGTTGGAGACACCAAGCTATAAACTATCAGGCATCATCCTAGTCATCTCCATCGGGATATTACTAACAGTTG CAAAAGAGACGGAGTTTCAATTATGGGGTTTCATACTTGTTACGCTTGCTGCAGTTATGTCTGGATTTCGCTGGTGTATGACTCAGATTCTTTTGCAAAA AGAAGCCTATGGTCTTAAAAATCCATTTACCTTGATGAGCTATGTAGCTCCAGTTATGGCAGTGGTAACTGCTCTTCTCTCTCTCGCGCTGGATCCATGG GATGAATTCCGAGAAAACAAATACTTCGATAATTCACAGCATATAACTCAAACTTGCTTGCTATTGCTTTTGGGCGGGACACTTGCCTTTTTTATGGTAT TAACGGAATATGTTCTGGTCTCAGTAACTAGTGCAGTCACAATCACAATAGCAGGGGTTGTCAAGGAGGCTATCACCATACTGGTATCGATTTTTTTTAG ATGATTCCCATTTGTTGATATGAATATGCAGTGACTCCCTCTCTTAGTCTTAGATATTTCTAGAGTACCTAGCTCTGTGGTACAATTATGTCAAGAATAA GTTGATGCAGTGTATGCTTCCATGAGCAGCAATATGTACTATTTTCTGATAGATGATATGATTCTTGTTAAGTAAAACAAGAGCATTCATGGGAAAGTTA AACGCGGAATCAGATATACTAATATGCTTCTCTCTTTGTTTTTATATTTGCTGGATTTTATGTCCATCTATGATAGAGATATGTTTAAGGTGTTGTTTGA TCCATGTAGCCGATCCCACCTAGTCGGAGTAACGCTTGTTTGTTATTTTTGCATGATAGAGAGATGCACAGTAACAGACAGACCTATAAGTCTTAAAAAG GGCATCCCATTGCACAAGGTTCCCACCTAATGGAGTATGGGGATGGTAGATATATACAGCCTTCAACTCTTAAGATGATTTGACCAATCATAAAAATTGT TTATTTCAGAAAAGAAAGTTCATGTTACTCGTGGACATAGAATCACCTTTTCTTTTACTCTTAATGTGGAAATTGAAGTTACTTAAAATGTTGATCTAAA AAACTTGAGCTGATATTTTTCTTCCATGCGATGTTCTTTGGTAAACTCCAGTTCATGCATTTTCCTATCTGCATGAGTTCGTGAATTCTTATCGAATGAA TTTGCTAAATTTGTAATGGTTTTCTAACATGCATGTCTTTGGGGCACTAGGCATGTATTAATGTCTTTCCACTTATTTCTGTGTTTTTAAACGTCATGGT TTTCGATTGTACATTTACTTGCACCTAATCTTCCGATCTCATGTTGTATGTTTGTAGGCTGCAGTATTGTACTTCCATGATGAATTTACTTGGTTGAAAG GAGTTGGTCTCCTTGTTATTATGGTTGGCGTCAGTTTATTTAATTGGTACAAATATCTGAAGCTTCAGAAAGGCCATGCCAAGGAAAGTGATTTGGCAGG GCTTCACACAACGGATTCTGCTGCCAAATATGTTATTCTTGAGGAGATGGATGAGCAAGATGATACCATTTGAAGCCTTTTCTGGTGCATCATTTAAATT TAAAGTGAGTTTCTTAATTGGACTCTTGTTAAATGATGATTTGAAATCATAATCTAATAATTTATTTATCTACAGATGTATAAATATATTAGCCTTTTTT ATCCTGTTTTAGTGTCCCTTGGCTATAGTAACTTTACTATCTTGGCTCAGTAGTAACTTTACTGTCTTGTGAGTTAGAGGCCACTGGGTATAGTCATGAA ACCAGTCACTGCGTGAAAGGGTTGATCCCAAAGCCCTACCATGATGAGAGATTCATGCTCTGAGGCCTGAGTCTGAGCCACCCTTTTTACTAATATATTC AATTATTCATCCAGAGGCAGTGGATGCTACATGATATTAAAAACTATGTAAATGACAACCTTGGATCTTCCATTTTTATTAGATACAACAAAAGGGTGGA ATCATGAAAATCAAACTTATGTTATAACGAAATCCCCTATTTTTAAAGTAACGACGAAGTTAGCAATGCACTTGATCCAAAATGGTGTTACCATGATGAA AGTATATGCATCATACTGCTGAAGTTGGCCTTTTAGCTTTGATATCATGGTTGTTTGGTATGAATTGGTTTTCCACTTTACTGACTTATGATGAGAGTAT TAGTAGTAAAGTCTTGATAATCTCAAAGCTAGAAATGCTATTTGACTGTATTTAAAAGCAAGCACTTGCATCTCTTGTGAGTATAAGTACTTGACAAAGC CTTACTCAGTCATATATTATATTTGTAGCTCCCTGCAACTGCTTTTCTTTTCAGCAGCCTGGAAGTGATGAGCATTAAAGCCAATCATTCTTGAAGGTTT CATTGAAGTCTTGTAATTGTATGCATTGAATTTTGTAATAATATGTGCTAAATGCTAAATCAGTTACAGATTTTGACATTCCTGTAATTGTCAGAGATAG AATGTTCATTTCTGATCATGTTACTACTATTTGGCTAGTTAACATTCAATATCCATATCATGTCAAAATACATCTGACCCTCAACTTGGAAGGGTACAAT TAATAGGAATGCAGGGATTTATAACTACAATCAATAATACTAGCTCTCCATCAATATTGTTGGAACTTAGTTATAGGCAAAATATACAAGTTCATAATTA AATATCAACTAACATAACACTCATGACATAAACCATGTGATCTATACCAAG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_46873; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_101230
| Blastp | Probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470 from Arabidopsis with 68.31% of identity |
|---|---|
| Blastx | Probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470 from Arabidopsis with 68.31% of identity |
| Eggnog | membrane(COG0697) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G06470) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461155.1) |
| Pfam | Triose-phosphate Transporter family (PF03151.15) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |