Id Trinity | FTRINITY_DN54950_c1_g1_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_103672 |
Sequence | CAAATATAATTTTGATACACATTATGTAAGCAAGTGGTGAAACTGGCATGAGCCTCGTAGCTCCACTCGTATGACTCAGCACTTAGAGTATATCAAATTA AATTTATTGGCTCTGCTTAATGGATGAGAGGTGTAGCTTCAAAAATGGTTTTATCCACTCTCTCTACTTTTCCATTTCCTACTTCATCTGTAACAATTTC TTCCAACCATCTCAATTTTTTCTCCCCTTCACAACTTTGTACCACAATTGCTCCAAAATTTACTAAGAAACAAAAAGTAAATCTAAAAAAATTTAAAAAT GGCTTCTACTGTCTTAACTGGTTGCTTCTCTGAATCTACAGGTTATCAAGTTGGAAACTTTGCCCCTAAAAAATGGTGGGGTTACAAGAATTGGAGGAGT TACTGCTCCATTGGTACTCAGGAATCGGAAACTAACGCTTTGTTCTGTTTCCGAAGATGTCAGTGCCTCTACTGAGACTAATGTGCCTTTCCCTACTGAT TACACTGAGCTTCTGGAACAAGCAAGAGTAGCAGTGGAATTGGCTATGAAGGATAACAGACAGTTAATGGAGATTGAATTTCCCACAGCTGGACTTGCTT CTGTACCAGGAGATGGCGAAGGTGGAATAGAGATGACTGAGAGCATGCAATTAATTCGCGAATTTTGTGATCGCTTCATTAGCTCTGAGAAAACTACAAG AACAAGAATAGTAATCTTCTTGATTTAAAGCATCATTCTTCTTTATGTCTCACCTTGTTTTCTGGATGAAAGTCTTCTCTCTACATGTAAATTAATTATT TCTGTTCTCTGCTTTTCTTTCACTTGGCAGTTGATTAGTTGAGTATGTTCTTTTTTCAGATGTTTCTATTTTTAGCATACAATCTAAATAAGTTCAAAGT CAATTTCAAGTTTCTTTCAAACTCTGTCTCTCAGCTAAAACATCTGTTATGATCAACACACCCAAGATTTTATCCTTGGTGACTGGTCCGAATATAATCC TGGCTTGCTCATTTATGTGCAGGTGAAAGCTAAATATAATCCTATGGGTATTGTTTAAGGATTAAAAAATAGAGTTTTTGCATCAGAAACTGATGTATTT TATATCTTGAAAATCATTGTTATGATTTCCAATGCAAAGTTTCTATTTCTTGAATTCTCAAACGATGCATGTTGTGGTCACTCGTTAGTGGACCTTATAT ACATAGTCTCCCGTTTCTGCATACATGTTTATCTACTAATGTTTGTGTTCTGTAGAGATGCTCATATGAAAGTTTTTAGTTAATTTGTCATCCTTTAGCT TCACCACTTCCAGTTGAAATTGATGCATAATCTTGTGAAAATCAGTTTTTTCCGGAGGCTAGCGAAGTTGACTTCGCCAGACAATCAGTCTTTAGTGGAG CTTCTTTTAAGTTGGACTATCTGACAAAGCCATCATTTTTTCAAGATTTTGGTTTCGTTGAGAAAGTAAAAATGTCAGACAGAGTGAAAGCCGGAGATGA ACTTTTCTTGGTAGCATACCCATATTTTAACGTCAATGAAATGCTTGTTGTGGAAGAGCTTTACAAAGAGGCGGTCTTGAACACGGAAAGGAAACTTATA ATTTTCAATGGAGAACTTGATCGTATAAGATCTGGCTATTATCCATCATTCTTCTACCCAAAGCTTGCTGCACTTAATAAGACCTTCCTGCCTATGATGG AAACTGTGTATTACATTCATAATTTCAAAGGACGAAATGGAGGAACACTTTTCAGGTCTGCTAGCTACCTAATTAACTCCAGTCACTCTAACTCTAATAT GTCGGAAGGTCATGCTAAATATCGCAGTAATATGTGAAATATGCAATATCTTGCTTGGAAATCAAAGTAAACTTCTGTCGATAGCTAGACTTTTTTTCGG TTTAGACAATGTTTATGAAATTTATATTTTCTTGAGTACGTATATCACTTATATGTAGTTTGTTTATCATATTTTTCATAGGTGCTATCCAGGACCCTGG AAGGTACTCAGAAGAGTGGGAAATAAATATATTTCTTTACATCAACAGGTTACTATGCCATCCCTGAAGGAAGTTGCCCTTGAGATTCTTCCAACAAATT GAGATTTTGGGAACTAGTAATGGTAAGCAATTCATCCACTATGATAATTTTTCGGAGATTCACTAGTGCTTTAATATTTATGCCTTATAGATAAGAAACT GAAGATGGTTTGAATAAACAGATGTCCAAACTCCAGTGTATATCAGGCCACAAAACTCGTAAGAGACAAGAGTATGATAAAATGGAACATAATTGAAGAA AAAATAACATTGAATATAGAGATGAGATAGATTCAAACTATAACTAAATCCTACCATAAGAATATGCTTTATCACCCCTTCAAACTCGACGATCTTAAGC AAAGGCCAATTTTGGATCTTGAAAGATGGTAGGCCCAAAAGGTGAAAGACATTTTGGATTTTGGAGTGTTAATTGATCCTCGTGCAAGGTTTTTCTTTCC CTGTCTACGAAGCCTCTTCAAGAAGTTGATACTTAAGATTTGGTGTCTCCAAGTGCATCTCTATGGTTTACTCTGGGTGACGTAGCGCTTGTTTCACCGC CAATGGAGGTGGTGTAGCATGTAGTTGCAGTCCTTTGTCATTCTTGTGTTAAGATTGTCAGTCGTGATCAGATTTACCATTAAATTCAAGTTCGAGTCGG GATACAAAGTTTATTAAATAGACAGGTACTTAGAAAAAAAGATAAAATAACATAATTGAAGTTAAAATTGAGATAGACTTGAATTTTTCTCCAGTGGTAA GATTAATGGAAAGCAAATTTATGAAAATGGAGGCTATTTTATGTTGACATGATAATTTATGTTGATTTATTTTGTACTGATGAGGAACAGGTGTTGATCT CTATCTCCATTCTGCGGAAACTTAGGAAGAAGTAGACCTTGGAAAATGAATAACGAAGTCCTGAAGTTGTGGCTCAATGAAATGGCTTTTTTTTCTGAAT GGGGTAGTGCAGCAAGTTGTTGTTTGTTGTACAGTTTATGAATTCATGTTTTCTGCCTTTGGGCATGTACATACTGTGTACTATATAGATTAGTGCATAA TTGCATCAGCAATCACTGAGTTGATACAGTGGGTCAAATCACCTTGTTATTTTTTCAGCCACAAGACTTGAACCCGAAACCTTATTTAAGGGGATCAAAC ATGTATCATTTGAACCAACATCTGTTGATAATTCATACTTAATATGAAGATAATACAACCACTACTAATTCACCAG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_47220; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_103672
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000112) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019445242.1) |
Pfam | Domain of unknown function (DUF1995) (PF09353.9) |
Rfam | - |
GO | - |