Id Trinity | FTRINITY_DN54995_c1_g1_i7 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_102582 |
Sequence | TATATCTTGGAAATAACAATTAGATCTGAAAAGTTTCACTCTTTCAAATGTGCTGTTATAAATAAAATAAAATAATAGTAACAATAACAACACATAAGAA ACTATTGCAATGGAACGTGGCGGTGGTGACCGTGGCCGCGGTGGTGTACGGCGTTCTTCTCCGATGACAATGAAATGGTGTCCTCGTCCTCAATCTTCCA TTCAAACCCCTCCTCCTGTTACAGTTGTTGCAGATCAAAACTCAGCATCACTTTACAACAACAATGACCATAATAATAATAATAATAGTTATATTTCACC TAAACCTAACACTGTTGCTAATTTTTCATCGTCATCATTGTCTAATGATGTTTCGAACAAGTTAACAATTTCTGAAACTGAAACTGAAACAAGAACAGAA ACAGAGCCATTTGTGTTTGATTTATGTCCACCTAAGTCAACTACTGTTGTTTTAAAACCACCTTTGTTTACCAAGAACAGAGAAAATCGAAGATTTCAAC AGCGTAAAGATAATGTGGGCTCAGTTAATAGTGTGGTGTTAAGGCCCGGTATGGTAATCTTGAAGGGTTACCTTTCTTTACCTGATCAGGTTCCTATTTT TTTTGCTTCTTCATTAAATTAACTGTGTATAATACTATAATACTTGAGTCATGTTTGTTCTAAGTTAGAGATCATGCTTTGTCAAGAACATTGTGGTGTC GTTTAATCTATGTAGCTGACCATGCTTGATGAGATAAAAGTTTGGTTGTTGTTGTTGTTTGTTATAATGCCTTTTATAAAGCAAAATATGCGTAATTAGG GTTACAATAGTCGAAATTGTCTGTAAGGGAGTGTTTGGCTTGCAGAATGTGAGATCGGGGGTTGAATTGCCCCGGCTTATCTCCTTGTTTGACTAGAGAT TGTACGATTATGGACTCAAGTCCTCAGTGGGAGAACTCTGACAATCAAGTTGTTATAGGAGATTATAATGCAGGATTGCAGGGTATAGCTCTCTTAACTG GTTTGCTTGCCAGGGTTGTCTTCATCGTGGGGGCGTCGTTGACCTTAAAGTGTTCCATTGTAATAATGGGATGATCCTATGATTTCTGCCTAACTTACGA AGCTAATGGCCATTACGGGTTGAGAATTATGGATTTGTTCATAATTGTCAAGATTGCAAAGGAGAATTGTTATTTCATTCCTAAGCATGAAGGGTAAAAA TTGGATTTCCACCTTTTTAGGTGGGAAAGTGATTCTCAGGCATCACATTCCCACTTAAGTCTTCCAGCTTTGTGAAACTTTTCCCATATATTGTGTGTGT ACTATTTCATTCCTTTTATGATAATTTAGTTTAACATGATGATATGGTTCTACTGGTATGTAGGTGAATATAGTTAAAAGATGCAGGGAGTTGGGGCTGG GTTGTGGAGGATTTTGCCATCCCGGCTATCGTGATGGCGCAAAGTTGCAATTGAAGATGATGTGCCTCGGCAAAAGCTGGGATCCACAGACCGGTCAATA CACAGATAACCGTCTATCAGATGGAGCAAAGGCACCTGATTTGCCAACTGAATTCAATCACCTGGTTGAGAAAGCTATTGAGGATTCCCATGCTCTCATC AAACAACATTCTAAAACAAATAATCCACAGAAGATACTTCCCTCCATGTCACCCAACATATGTGTTGTCAATTTTTACACACAAAGTGGCCGACTAGGTC TTCATCGGGTATGATCTATAGCATTTTGAAGAGTGCGGTTATATGAGAAATGCAAGAAAAACACTCCTTGACTTTATGTTATTGGGTTTATTTGATTTGG GACTCACTAAATTATGAGTTCACTTTCTATTTAAGAGTCCCACTAAATTTCAGATTTTCACTCTCTATTTAGTGGGCCCCTTGTGAACTCCATTCCATAA TAAAGAATTTTGGTGAGTGTTAAAATTATGTTGCTAGTGTTATTTATATAATTATATTGCTTCATGTCACCAATATCATGTTATGCAGGCATGAAAACAT AATTTGTTTAGCCTTTTGAGATTGTGTGCAGAAAAGAATGATCACTTCTACCATCCCAAAATTTAAATTGAGAACATGAGAGGAAAACAAAAATTGAACT GATTTAAATGTTATTTTGGATCAGGAAGAAGTAAACATATTTCTCTTAATATTTCTATTATGTATTCTTTAATTGTTTGTTATGACTGTGCTTGCTGCAG GACAAGGATGAGAGTGAAGAAAGTCTGCTTAAAGGTTTACCAATAGTGTCCTTTTCTATTGGAGATTCAGCAGATTTTTTGTACGGCGATGAGAGTGATG TTGTCAAAGCACAAAAAGTTGTACTGGAATCAGGAGATGTTTTGATCTTTGGTGGGAAGTCTAGACATGTATTTCATGGAGTTACTGCAATTAATAAAAC GACTGCTCCCAAACTTTTGCTGGAAGAAACGAATCTACGGGCTGGTCGATTGAATCTGACTTTCAGACAGTTTTAGAATGCAGGACTTTTCTAGGTTGTA AGCTATATGCCATTTGGTCAACCAATCTTTTTGTCGATAAAACGATTGCTAACCAACATATCAGACTCTTTAGCCAGAAAGTTGCATGTTACTATTGCTA TTTATAAAATCAAATATAATGAAATCATGCATATGATATATTTGTACTGCTTTCATTTCCTAGAAGCAAATATATGTTGCTTTCTATATAGCTGAGAATT AGGTGTTGACCAAATGTTATGCTGATCTTCCATCTATCAGAAAAGAATGGGGGAAGCTGAGCCATGCTGAAAGAGCAGGGTACCTGCTTCATTTAATTAA GTTCCTAGTCTTTCAAGTGCTGCCCTTGTATTGAGCATTATAGGATTCCCACTGGAACAAGTATTGTCTTAGGTAGAGTTTGGTTGTTGGCATAAGTTGA GCTCTTTTCCATTTGTCTCCCTTCTATATCCCCTTACTCTCCCTTCCCATCTCTTGGAAGGGTCTTCAAAATCCTTGATATTGTTCCATTCAAAAACACT TCTCTAAGCTCAATTCTACTTTTATGTGCTTTTAATTTTGGCAAGCACGAAACCTGCTTTTTTACCACATTTTTTCTCTGCTGAAGTGGTTTATCTTTGG ACTGTACCAATTTCATGTTTCATGTGATCAATAGCAAACTTTTAACTTTTAATTCATATACAGGGGAACACATATGTTAATGCACGTTTTGTATCATTCC GTGGATCATCAATTTTGATTAGTTATTTTTTTACTTAAATTATAAATGTGAGGATCAACTTAC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_47608; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_102582
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase abh1 from Schizosaccharomyces with 39.78% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019423484.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |