| Id Trinity | FTRINITY_DN55033_c3_g1_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_68828 |
| Sequence | GTGCTGTGGTTACAGGTCAGCATTTTACTTTTGTCTTATAGCCTTCCAAAAGCATCTCTGGTTGTTGAAGTAATAATGAGTGACATAAAAAAACATTTAT ATTGTATGCTACATATGCTAATTCAGTTTCCGAATCCTATAGATCGGTTACCAGATGTCAATATTCACTATATGAAGTTGAAAGAGGTGCTAGTTTCAGT AAGTGATTAGCCGGAACCATCATAAATTTTAACAGTTTATTATTTTGAAAAATGTTCTTCTGTAGATGCCGGAGCTCTTCTTACTTTTGGCTGGGGTCTC TATGGCCAGGTGAGTTTCCTGTTGACAAATTCTTTTTTTATATTTTTCATCTTCTGTTAGGGGAAAGACATTTATTTTTATTGCTATGGTTAAGTTGGAA ATTGATCTTGCTGAAAACTCCAGTAGTGAAAATGGAATTTGTGATGCCTATTATTTATCATAAGTATTGTCTAAAGATGAAGAAGTCCCCTTAAAGATTT TAGCATTCCTTTTCCAACCAAAGGCACCAGAATGCAGCAGATGCAGCATACTGCCAAAAAATTAGCTCCTTCTCAAAAGCCCTAACCTCTAAGTTTAATA TGGAGAAGCTGATGCAATTCCTTAGGGCAAACTCAATCATGTCCATAGATTCTAAAAAGCTTAATCTAAAGAAAATTCCAAGAACAAGAATGCAAAAGAA GGTAGTTTCATTTTCTGAACTTGAACAACACATTACACACATTAGGAGATAAAGCAGTGAAAGCTCTACTGTTTTGTAGCATGTCTTTAGTGTTAATGTT AAGAATAAAAGTCCAGACAAAATGTTTTGATCTAAATAGAAGCTTTGGACATTTAGATCCAAGTCTTTTTGAGGAAATAGTAGAACTACCAAGTACCAAC CAAGTCTTATTCTCACTAGTTGGGGTTAGTTGCATGGATCAAGCAATGCTATTAATATAAGCTTTATTCCCACTAGACGGGGTCGGCTACACATTATAAA TATAATGCTTTATTATAAATTATTTTCATTTACAAAGTTTATCTCTAAATCTTAATTGTTCCGCATATGGTTTTTCTTGTTTTTCCTATTTGAGATGTTA CACCACACATGTCTATAAAGATTTTGCTAAGTGCCAAATATTTTTTAAACCAAAAGGTTCCGATGAAGTTGGAGTTTCAGAAGTACCTTGGACTTCTCCT GACTTCAAGTGTTCCATTTCATTTTAAATGGCATATATGTTCTTATTAATGAATTTCTGAGGAGGAAGATTATCTCATTTAATGTTATGTATTGTTATGA AGCACATGTGTAGGAACCGTTTCTTTTAAACCTTTTTGCATGTAAATTTACTCCAGTGTGGGCAAGGGAATAATGCTGATCAGCTGAGACCAACTCTAGT TCCTTTGTTATTGGGAACTGATGTGGGAAAAATTGCTGCGGGACTTTGGCACACATTGTGTGTTACAGAAGATGGTCAAATCTATGCATTTGGTGGGAAT CAGTTTGGACAATTGGGTACTGGTAGTGACCAGACTGAGGTATGTTTTACCTTGCTCATTGGTCTACATATTTTGCTATCTCTAGAACAATGTTTAAATA ATAGTCATGTGTTGGACGGGACACATGTTGCATTGAATTTAAATTCTATTTTGTCTAGAAATTTGCAGTAATCAGTATCAGTCTTATTTAAGCTTGCTGC AGTTGACATTATTTTGAAGTTGCATCGTTTTGTAAATTGCTTCTTGGTAGTAAAAAATGCAGTATTGTTTAATTGAAATCAGCTTCGCAACAATGGTAAG TTGTTGCTTAATGATCATGAAAATTCTAGAAATGGCCTCTCGCTTGTGGTGTAAGGCTATATATATCTACCTTACCCATATACCGTGCCCATGGCATACA ATTATGATGTAGTTTTATTGATTATGATTCATTAAAAATTCCTGTACCTACTGCCTAATATGTAGGTTATGTTCAGTCAGTCAATCCAAGATATTTAGTA TTTAATGTGTTTTAAATCTTACAGATATTTTTGTTTTTAACCCCAAAATTTTCCTTATTTATCATTTTTGTATATCAGTGTTCCGGTGGATGATTTATTT TCCTCCCTTTTTGTAATCATCTGGTCTTTTAATGAATTTCTTTTTTCTATCAAAAAATATTTTAGACCCTGCAACATTTTCCAAATTACTTCATGGAAAT AGAAAAATAGGACTTTATGATGCTTCATGGGTCAGCTATGTCTCGTTTCTTAAATGAAAAATAAAGATATGTATCATTTTTGTATTGTTAACTTCATAGA TAATTGTATGTATATTGTGATTATCCATAGCTGTGCTCCAAATTAGTTGAAAATTAACTAATTAACTTTTTGTTGCTCAGACTTCACCTAGACAGTTGGA GGCTTCTCGTTTTGAGAATAAGCGTGCTAGTATAGTTTCTTGTGGAGCACGCCATAGTGCTTTGCTAACAGGTATGTTGCCATTAGAACTGAAGGGGAAA GTTTAAAGCCAATCTGACTGTGTATTTTGATGGTGCTATGACTTATTAAAATTGAATAGACCAAAGATATTTGTGCCAAGAACCATTCTATGGGCTATGC AAATTTCACGACAATTTCAACTATGATGGACTGTGCACACAACTTGAAAGGGTAATTCCTTACCCATAGGGTGAGGGGATGCAAAAAAAGAATCGCATAC TTTCAATGTGGGATTCAAGTCCAATACCTTGCAATTGGATCCTAGTATCCCACCATGCTCTGCAACCCTGGCACCCATGCAGGCTGGCTGTGCACTAGCC CTTTGACTAGTCCCGGGCAAAAACTGCAATGCTGGCGTTGCCACCGGTGATGCTCTTCTCAGCCGTGAGATATGGTGGGTAGCTCTGATACCAATTGATA AGAAAACCTTGTGAGAGCCACACCACGAAAGATAGCCATCGTAGTTGGAGAGCCCAAGGCCTTATAAATCCCACACTATGGATTCAGGTGCGGTACCTTG CAGTTGGATTGTGAGTCGTGACACTTAGCTCATCCTTTAATTAGTATCTTTCATGCTTGGAAATCTTGATCAGGACATATTTACTTAAAGTTTGATGAAA ACCCATCATAGTTTGTGGACAAGAAAAGTTTTACTTGCATTCTAAGAAAACAAAATACTAAATACAACACAAACTTTAACATTATTATAAAAAAAAACTA CACTATATCATGTTTCACTCATGATCTTATGATAACTCTTCACTTTTTTCCCCTTTTCATATTGAAGATGATGGTCACATATTTACTTGGGGATGGAACA AATACGGCCAGCTTGGTCTGGGAGATTCTATTGACAGAAACATCCCTTGTGAAGTTCCTATTGCTGGTTGTCGACCAAGAAATGTTGCCTGTGGTTGGTG GCATACACTGCTGATAGTGGACAAATCTGTTTGACAAAATTTGTTATTAGCATCAAGGTGGGTTGCACAGTTTTGATAGGTTACTGACTAGTCCTCATTT CATCAGTGGAATGCAGATATGTCCAAAATCACCAAACATGTTTCCTGGTTTGTTTTCTTCCCTTTCCATTTCTAGATTGTAGCTTAGCTGACATGTATTT ATGGCTTTCTTACAGACAATAAGGGTTGCAATAGTGTTTATTATATGGTTGTAATTTACAGCACTTGTTGCGCCCTTAAATTGAACCTTTGCGTGCAATG ATGTGACAAAATATTCTAAGTTTTAAATGTGTCACTATACTGATGTTCTAAACTCTTGAGAGTCTTAATTTGAGTCTTGGTGAGTGGAATACTAAAATGG TGTCAAAGAAACAAAAAAGTTTATAAGTTGGTACATTTGACCTTTTTTTATGATGTAACTGACATACCTAATGGAAATAAGACTTTGTTTTTGTTTAAAA A BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_47961; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_68828
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | RCC1 and BTB domain-containing protein 1 from Mus with 51.72% of identity |
| Eggnog | regulator of chromosome condensation(COG5184) |
| Kegg | Link to kegg annotations (71330) |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000795) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460943.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |