| Id Trinity | FTRINITY_DN55053_c2_g1_i9 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_66902 |
| Sequence | TTGGCGCAGGTCTTGTAATTCTGAGAGTTCTATACATGAGGCAGTTCTCCATTGCAAAAGATCCATTGGCCCAATACAATTGCTAGATGATTGGACTCCT TAAGCATGGTGATGGTGTCAAGGATTTGATTCAAGTCATGCATATGAAAAAGGCTTTGTTGGTAGAAATTTTCCAAAAGGGGTCAGTATTAATAACTTGA TATAGACGCATAGTCACTGGAAAAGCTAGAACTCCTTCCTCACTTGTCCAACTAATGAAGGTTACTTCTGCTCATAATTTTCTCACTCATTTGAAGGAGG GTGTAATAGTTACAATAGCTTCTAAATTATGTTTATCGGAGTTAGCAAACTTCAAGTAATTTTTGATCTCTTTGGCATGTCCATGTCTTAGATGAAACCA CTTCTTATTTGGTTTTTGCTTTCTATTACTTATGGCAATGGCGAGGTCATTGGGGAAGAGGTCTTGGAGGACAAAGGCATGCATTATAGTTGAGAAAAGG AGTGCTGTCACTATGAGTGAGGAAATGAGGCTTAACATTGTAGACAAAGCCTTTGTCATAACATTTGTGACTTGATTTGAGTAGTTTATGGTTGCAATTG CTGCACCAGTCATTGGAAAAGTGTAGGCCCACCATGAAAGTGAGAATCTGCATAATCACATTCACATCATATATGTGTCAGAAAAATCAAAGTAACCAAA CTAATAGATATGTGGGTGAGGAAGTAACATACTTGAATCCTCTGAAAAAATTGACCCGGACAGCCTGCAAAAGCATATATGAAACTAATAAATAACTTGC ATAATAAAGATAAATTACTGATATATGCATTTGAGATATAGTTAGTTACAAGTTGTTTATTTCTCAATGTACACAAGCAACATAAATGGCTTGATGTAAT ACTTTCTCATTGAACTGATTTCAGATTTAAGTTTTCTTCTTCTCAATTGCTATACCATGTTTGAGAAAATTGTGGAAAATGAAAGGTTTGGAACCACAGT GGTTATGCATATTTGTAGTACTAGTGTGACAGTTTAACATACCAGTGAGAAATAAAGGAACATGGCAATAAAATAGGCAATCCGTGATCTATAATCAAAA GAACCCTGAATTCTAGCCCATGCCACAGAAGCAACACTAGGTGCTGCCACAAACAGAAAGAATACTGGATGGAGATCTTTTGGTAGGGTCTCATTTGTTG GAAGTCTCTGATAGAGAGTTACAAACAAGACTATGTAGTGAGCCAAACCAACAGCAAAGAAGAACATAGGCCCTTCTTTAAGACCCATAGATGCACCTAG TAATGCTCCTACAAAGTTTCCAACAATTGAAAGATGATTTGATGGATTTGCCACCTTTGAAAGCCTCCTTTCTCCCCCAGACATCCACTGTCCGTAAATT TTGAGCTCAAGACAGACTAGTGGAGCCATTAGAATGTACCAAAGTGCAGGAGGCAAGTTTTTGGCAATTGATGGGGGAACACCAAGAGCTAAGAACAAGA GTGCTATCCAAGGGGAAAAGAAGAAGTTAACACGGATTGGATGATAGTACTCGCGACGAACAGCTTCGAAGTAGAGAATGATTTTGAGAAGATATATGGT GAAAATAGTAGCGGTAAGAGCGATGGAGATGAACCATAAGATGAAATTTATTTTCAAGCTTATGTGAAGAAATGCAGTGGAAGGAGACATGGCCAGTGCT TTCCAAAGAATTGCTTGACTGCTAACTCCAAGACAAATACCAAAAGTTGATACTGGAAACCGAAGAGGAAAGGGCCACTGGTTGTCCGAAGGAAGCACTA TCTCTTCTGAAGCCTGTTGATGGAGGAAATCAAAATAAAATGTGTTACAATCTTCAATAAGAGTTTTTAATAAAATGTGTTGTATTGTTTATAATCTAGG ATGTTGATTCTTTTTAATATAAAATTAGTATAACTGTACTTAAATTGGTAGAAGGTAATTACATACCCTAAGAGTTTCTAACTCAGGACCTTCCAATGCA TCGAAGTAGCGACTAACAGGTAAAGGCCTATCGGTGTTCCTTATGCCGCTGTCCTCTTCTACAGTTAGTGCAGGTGACCTTCCACTTAGAATTGAAAACT GTTTCTCAAGTTTGCCTGACCATGTTTTGAAATAGTCAAATCTGCTATCCTTCAAGCTTTTGATGCTTTGATGATTGGCAAAGTTAACACCACTAATTGC CTCTAGTTGCTCACTGCTTTTTGATGGCAATGGATGCTTGGAGTCTTCAGTATTTATTTGAGAAGAGGATATGGGAATACCATCTCTCAAATCAGTTTCA CCACTACAGAGAACTTTAATGCTGTTCTGTGGCTGAACCTCTTCACAACAGAGTGGCATGTTGATAGATACCAAATGCTTCTTTTGATGATTGATGGTCA CAGGTTCATCCACTTGTCCTTCTGCTGAGACTGTTTCACTTTTCTGTTACAAGCATTAAAAGAGTTTGATTTTACATATCTCCTAAATTATAATCATCAA AATGGATGATCAATGGCATGTTATTGAAATTTAAAAAGAGACTTACTATTGAAGATAGGCTGGGATATTGAAGGTCACTAGCATAAAAGGCAGCTACTTC ATTTGATGATATATACTCAATTAGTGATGGAACTTCAGACAAGCCATATTCTTCTACTTGACAGTTTTCCATTATTGACCTGAAAGGATATGGTACACGT TGCAATCCAATATATATTATGCCCTAAAGATGGAGGGAGAGTGAAAAACCTAAAACCCACTTGTTGAAGTTGAAAAGATGTCATCAAAAATAGGTTTTTG TCTCCTAAGGTATTAGTCTTTTCTCAGCAAGTGATCCACATTTCTATTCCCAGGATTACTAAATTGTCCAATTCATAATCCCACTTTGAATATGCTGTTT GTGTATCACTATAGGGGAAAAAGTTTGATTTGAACTAATATTGATCAACGCATGAAAGGAATTTGTCTGTTTAATATATGTCACACTGGTGATCTTTTTT TGGTTCCAACAAGTATCCTCGTACTGGAGGCAATTATGTCCGAGTCGAGAACCTTATTTAAGGGGAATCAAACATGTACCACTTGAACCAACATTCGTTG GTTCAGATTGGGTATTCTACATAGACATATATATAACGTGTGCCTTATTTAGTGATTTAAGATGCACATATAATTAAGCATAATGTAGCAAGTGGAATAA TTATTTGGTCAGGAAAGGTGACTTTTGTGGTCAGTAGCATCAGTTCCACTTTCAAGTATGGAGTTTTAGTCCTTTCATTCAATACATCAAAATATATTAT AAATATACATTCGCCATGCCAAGTAACTAGGGATAACGATGTCAATATGGGCTTGGCCCAACGTGTGAGCCCGTTTTGGTTGGTATTTTTAGCGAGGACC AAAGATTTGAGCCCTTTTAGCGATAAGAGTCAGGTCCGGCTGAACTAACCCATATTGTCACCACTAACCTTGGGTCTCTATGCTTATCTAAGAATTTCTA TAAAATAGAATTACATGTATATGGTTAGTAAATAAAGTATATACATTTGTTCAACTACACTAGTTGCTACGAAGAGTCGAGATGTATTATCATCACTTTT GTTATAGATATTTTTTAATATTAGATTTACCACATGTTTAATACCTTATAAGTTTTAAACTAACAAGATATGTTATTATGAGATTATAGACTTTGGTTTG CAATTTTTTTGTTTTAAAAAAACATTTATGAAGTGTAATGGTTATTTATTTTTTAGAATGTGATTAAGTTAATTATAAATGTGTATTTTGAAAGAAAAAT AAGCCAGTCTGTTGGCCTGCTAGGCCTTGCCAAATATGGGACGAGCTGACATTTTGAGTCCTTTTAGTAATGAGGATCAGGTCAGATCAGCCCATATTTT GATGGGACAAAGGTGAGTTGGGCCGGACAGACCCATGTAACACCGTTGAGTTTTTTCTACCTTGTTTTGATTCTTTTGAAGGATTAATCATAAGTTTTTT TTGGTCAAACATGGTATATCCCAAAGAATTATACATTTTGAAATGTGGGGTGTTGTCCCTTTTATCAAATATGGTTCCTACCTATCAAATTTTAGTTTTT GATTCTCTATTATATTTAAAAACTCAAGCACCTTACACCCAACACTATATCAGTAATTAATGATGTTTGTTGCCAAAAGAATATGATTTATAACAATATA TGATGATGTGAGTATAAAAATTTATACATAATTACTTTATTATCTATCATTTATTTAAATTAATTTTTTGAAGAATCAATAATATTTAAATTTGAGTAAT AGACATTGATTGTGATGACATGAACTCAATTTGTCATGCTGACACTGTGCTGCTCAGTAATTATATTGAAGAAGTTGTGGTATCTGCAATTTCTTACCAT TTGATGAATACGCTAGTTATATCATCCAATAGGTAAATAAATATATGTGCTCAAGTAGAATATTCAAAATGGGTTGGAGAAGATGAAAAGAATATTCAAG CTTTGTTCACATTAGCAGCAAAGCAAGGAGCTTGCAACCATGACTAAAGGATTTACTGGAAGTGATCTTAAGGTTCATTTTGTTATTAATTTAAATCTTC ACTTCTATTTTGTGATAATGGACTTCATGTTTAATCTTTTAACAATGTCACACTAATATGGAAGAATGAAACCTTGCTCTCTTGCAATTTGCAAATGAAT ATTTATTTCCATGCATAGAAGTTGATTGATGAATGTGTAAATGCAGGTTGGTGCAAGTTTCACAGCAGTGGAATGATTTGTATGGAGAAGGAGGTTCAAG GAAGAAACAACAACTCACTTATTTCCTTTAGATAGTGAGGA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_48114; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_66902
| Blastp | S-type anion channel SLAH3 from Arabidopsis with 50.62% of identity |
|---|---|
| Blastx | S-type anion channel SLAH3 from Arabidopsis with 61.79% of identity |
| Eggnog | C4-dicarboxylate transporter malic acid transport protein(ENOG4111I0D) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT5G24030) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019427718.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |