Id Trinity | FTRINITY_DN55088_c6_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_67598 |
Sequence | AGATGATTCTCCTTTCTTTTCACGTTGTTTCGTATTCAGATATCAGAGGAATGAGAGGATGTCACTTTGTTTGCACTGTCAACTTTTTCAAAGGAAACAA CAAATGATTGTGCTTGATCTAACGTAAGACCCCTTATCCCACATTTATACGTGAAGATGCTCTCGCCCTCTGAAATTGTCCCCCCTCAATATATAATACT AAAAAGTTTTAGGTATTATTGGGCTATATAAAGCCCCAACATACTCCCATATAGCACACACCGAGTCAAGTTTAATACTCAACTTCTCCTCCATTGGCCA AACCCAGAAATATTTGAACCTCACCAGACAAATAAAAAAATGTTTAGCGTTAAAGGGTTAGTTGAATCAAATGACCTTAGGTCTGTTCCCTCAAAATACA TTTGGCCCACAAATCCAGAGGATCATATATTGCATAAAACTGAGAATGTTCCAATAATTGACTTTGCCCAACTCATCTCTTCTAATCCCTCTGAGCAATC CATGGCAGTTCAAAAACTTGGGGATGCATGCCGCGACTGGGGTTTCTTTATGCTAATTAATCACGGAATGCCTGAAACACTGAGGAGCGAGTTTCTTAGA GCTAGCCAAAGCTTCTTTGATCTGAGTGAGGAAGAAAAAAAAGAGTACGCAGAAGGGAATATATTAGATCCAATAAATTGTGGGACAAGCTTCAATGTGA CGGTGGACAAGAAACTTTTCTGGAGAGATTATCTCAAATGCCTTGTTCATCCTCAATTTCAGGCTCCTTCTAAGCCCCTTGGTTTTAGGTATGGTCTTCA TCCAAAATTATTATATGGTCTAATATTCATGTTACAATATATGTTTCTTAGAGATAGAGTTCTTCAAATATTGTCTTTCTTTTCATGTCAAATCAGTTTT AATTTCTTCTTCTAAATAAAAGTTGCATCTACTCACTTACTCGTTTTGATATTGTTGTCTTCAATTTTTATTAAAGTAAACCTATGGTTTAGAACTTTAT ATATATTACTTTCATATTTGTTTTATACACTGGCCATATTTTTGTTATTTCTTAAAGTAGAATATTTTGTTTTAGAAATTTCGATTGCGCCCACTTCTAC ATTAACTTAGGACTATATGTTGATGAGTTATAATTCAGTTTGTTAGTTTTAGTATTTTGGTAAATAATTAGTTGGCATATGCTATAAATATAAATAGAAA GGTGTTAGTTTGTATTGTATAACACTTCAATTTTCATTCATTCATTAGATAATACAATACATTCTTATCTACCTTTTACTTACTTCATTCACTCTCTTCC ACCTCTCTTCTTCGATGAATTTCATTCACTCTTTTGATTGATATATATTTTGGACTTTAGACTTTGAATTTGTTAAAGACTTAAGGTTGTGTGTTTATGT GAATTTGGAGTAGATTATGAATATGAATTATAAATTTGAATATCTACATATTTCAATTTTTTTTGTTTAGGTTTATATATATATAAATATAAGCAGTATG TCCGATTTAATCGGCATACGGTTTAATTACTGAACCACCAGTTGAACCACTAAACCACTAAACCACTATATCAGTACCCTGACCGGTTTGATAATCGATA CGGTTTTAATAACATTTAGAGTTTAACTAACATGCTTAGAAATTTAAAAAACTTATAAAAAAGGACCGAAATCAATCCTCTAAAAGGTTTTATATCCCCG TTTTTCACGTTACTGAATATTTTATAAGAAGTTATAAATGGAATGAAACAGAAACTATAATTTCAATAACTGTACGGTTATTTAAATGAATAATTGTTTA TTACATAGAAAAAACAATGTGAATATGGGAAATAAAATAATATTAAAATTAAGTGTACGGTTATGATCTTACTATAGCATATATTTGATTTTTCAAAACA TTATTGTATGTAAGTTAAAAATGCTCATTCTATAAAATTTGTATACTGATTAACAAATCTGGTATACTAACAATATCTTTTATTATCTATACTACTAATT TATACTTTATATTTCTATATACTATTAATAAAGTCAAAACAAATAGTAACCACCCGTATAATTTTAATATTTCATTTTTATCCTTTTTAACCTCTCTTTT TAATGCTTCCACATAATGTTTTTATTTTATTATGAATACATCATTATTTTTCATATTTTCTCTTATTTTTATCTTCTATCTCTCTCAAGCTAAAAATAAT ACACAATAACACATGAAAAAACATTTAACAACTCTATAATGATTTTTATCTTCTTAAATATACATTTTTCATTGAGTTTATATATTGCATTTCTTAAATA AGGGTATGAGTCTACATACAAGAAGTGCTTTCTCAACAAACTAGTAAGCAAAGTATGTAATAATGACTCTTATTCCCAACAAGGCTTTCTCTACTCTTGA TTGAATATCCTCATTGTTTAAGTTTTTTCTCCAAATATAACTCTTCTAATAATATTTCATTGATAACACAAGTATAATAAAAAAAAATCCCACCTTAACT TTTACAAAAAAAAACAATATTCTTATGCGTCCAAAATGCTCTTAAGTTTTTTAAGAGAAATTAAAACACTTCTTATAATTGTAATCAATCATGTAAAATA ATTTGTGAAATCTCTACACCAATTTTTTTTTCAAAACATTATTTTACCATAAATTTTTAAGTATATAATTTTGAGGAAGTATGATGATTGCTTTTCACAA TTTTTATGCACAAAAAACAAAATTATGTATCACTTTCATATATTGTCCTGTCCTGGTTACCTAACATGGCACTATTAGTGGAGGAAATCACATATCTAGT AGGTAGAGCAGGAATGGTGTTGGGTCCAATAAAATGGATGGGGATCACTTGTCCCAAAAGATGTCCTCAACTATGTATCAAGCCAAATAGAATGAAGAAA AAATAAATGAAAATATGAATTTTAATTTTTTTTGACTGATGTGACATGTTGTTATTTGTTTGGTACAGGGTTTGGGACAGGGTTTGAACCAGCAGATCCT GGTCCCCAACAAATATGTGGTACTTATCTCATCATGGATTTCAAACATACTAATCTAGTGACTAGTGACCTATGGTGATAGTTAATCAAAAGCTTATGTC TATTTCTCTTGCAACAAAATCATCATGTGATAATTGAAAGAGGATATATAAATACAGTGGTTTTTTGTTTGGACCATATTCAGTTATGAATAGTCAATAC TTAAAAATGTTTTGTCCGAGTGATTGTACATTCTCTTCTGGTAATTATATATTCAGAAAATTGTTAAATTAAAAGAACTCCTATTTTCCATAAGGTACAA GTATAATAACATAGAGATGTTGTCTCTGTTTCACTCAATGATAAGGAAACAACAAAGACAAAAAAATTTAATTAGCATAACATATTATATTGACACGATA TAATTTGAGACAACATATCTATACTATGAGTATATATAATCTTTCACCTACAATTTGTCCCTACCCGTTACCAATATTAACCAAACCACCCAAATATGTA GTGAATTATAAATCGTCCATCTTTGAATGATTGCAGTGAAACTTCAGAGGAATACGTGACAAAGTGCAGGGAATTAATGCGGGAGTTGCTAAAAGGGATA TCAAAAAGCTTGGGCCTAGAAGAAAACTTCATACATGAAAGGATGAATGTAGAGTCGGGCTCCCAATTACTGGTTATCAACTTTTACCCAGCTTGTCCAA ATCCTGAACTTGTAATGGGCCTACCAGCCCACACAGATCATGGGCTTTTGACTCTCCTCACTCAAAATGAACTTGGTGGGCTTCAGATTCAACATAATGG CCACTGGATTCCTGTGAACCCATTACCCAACTCCTTCCTCATTAACACTGGGGATCACTTGGAGATATTGACGAATGGGAAAATCAAGAGCGTTATTCAC CGTGTGTTAGTAAACAATAAAGGAGCTAGAATTTCAGTTGCTACAGCACAAGGACCACCACTTGAGGCCGTGGTGAGCCCCGCACCGGAGTTGGTTGACG ATGATAATCCGGCTGCATATGGCGCCATTACATATAGAGATTACTTGAAGATTCAAAAAAGCAATGAACTAGATGGGAAGTCATGCTTGGATCGCATTCG TATTTGAATAAAAATTGCAATCCTCCTTTCATTAGTATCGTTACATTGTTTATTCCTTGGAGCTAGAGGTGCTTTCTTCATTGCTTTCCCTCCTCATTAA TATGTTTATCACTAAATTTGCTTTCCCTCCTCATTAATAAAAATTGTAACCCTCTCACTAATATGTTTATCACCACCACCCCATTACTC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_48448; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_67598
Blastp | Protein DMR6-LIKE OXYGENASE 2 from Arabidopsis with 43.1% of identity |
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Blastx | Protein DMR6-LIKE OXYGENASE 2 from Arabidopsis with 43.24% of identity |
Eggnog | 2OGFe(II) oxygenase(COG3491) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G10490) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019459248.1) |
Pfam | 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily (PF03171.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |