| Id Trinity | FTRINITY_DN55107_c2_g1_i31 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_20908 |
| Sequence | CGTTGGGTTGAGAAATGAGAAATTAATTTTATTTTTGTCTCCTTTTCTCTCCTTTCTCTGTTTATAGCCGTCGTTCCTCATCGTTTTCAATTTTAATTCA TCATCTTCTTCTTCTTCATCATCACCATCTACCATCTCTTCTCTTTCATCCTTCCACCCTGTCATCACAACTACCATAATTCTCTTTCATCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTTCCAGGGTTTTTCTCTTCATTTTCTCTTCTCTTTCTCTTGAATTCAACATTATTCCTTTCAAATTGTGTTCGTGAATGGCATATCA GGGACCTGCTTCGGGATCGAGTTCAACTTCTGGGTTTCAACAAATGAACTCCCCTTTCGGTGACACCACCTACACCAAACTATTCGTTGGAGGATTGGCT TGGGAGACTCAGACCGAAACCATGCGCCGCTACTTTCACCAATTCGGGCATATTCTAGAAGCTGTCGTTATCACTGATAAGAATACTGGCCGATCCAAAG GATATGGTTTTGTGACTTTCCGGGATCCCGAGGCTGCTAGGAGGGCGTGTGCTGATTCAGCTCCAACCATAGATGGTCGAAGGGCTAATTGTAATCTGGC TTCCCTTGGTCGACCACACCCTCCTCTGCCTTATGGTATTAGATACCAACTTCATCACAATTTTTTCATCCAATTTTGTTCTTATCCAATTCTACTCTAT GCTAAAATTTAACTTACATTCCTTTATCATTGCTGCTGTCATCAATTTTGTTCTTGTTATTATTATATCTATTATTATCATGGAGCTGGTTGGAACATGA CATTGACATGCCTATTTTTTTAAAGATAAAGTCAAGTCATTGGCAGTGTTGGATAGAGCTAGAGTACTTATTCATTTCAGTGTATCTTTACTGATTTTTT AATTTATAAAATACTAATATACACTCCTCTCAAAGACACTTCATGTAATGGATAAAGTTCCTACATTTACAGCGTTTCCTGTCTCATTTCCTTAAATTTG CTTTTGTATGTCTGCGACTCAGTATCTGGTCATGTGACATCTGTGTTTACTCTTTACCAATTTTATTTTGCCTCATCAAGTGACATATGTGCTTGCTCTT TCTGATTGACCGTTCTACCAGTTGTGATTTTTTGCTACATACATTTCTGTTAAGCCCATGCAACATTTTTTCTTTCTTTCTTTGATATGGGTAGTATGTG GTAACAGAACCATTCTAGGTTGTTCTTCCTGCATAGGTTACTTCAATTTTGTTCTTACCTCTGTTGTCTTTTATAGAACGGATAAGAGTAGCCTCCCCTT ATATTGGAAGTTTGCAACCAGCTCGCGGTGCTTATGTTGGAGGTTATGGCTACCAGCAACCAGTTCCCTACAATTATCAGCAAGGATTGGTTTATCCTCC TTATGGGTGAGTGGGGGATGTTGTTATACATTGATATTGCAAACATTTTAAGACATTAGTTTTTATTGCTAATTGTTATGTTCTTGCGTTTTCTTTATAT TTGTACTTGTTACATTCATGATTATCTCTATTCTCTACAGTGCTTTATTACATTATCAGTCATTAACTCATGACATTGTTGTTGACTGGTAAATGAGGGT GGTGATTATTGTATCCAACTAGGTACATATTCTGCAACGAACTGAGTTAATCCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTGTGTGGCTATCTGCACATAACAACCT CTGGACGAAGCATACTTGTGCAGTGCTTAATCATTTGAAAACAAGTATACAGCATATGGATCCGAGTACATCTACCCACAGAGCGTGTACAACCCTTACA TGGGTCAGCAATACCTTCAGATATATGGAGTGCCTGGGGCAGTGAACACAACAGTTTATCCTTATGGACAGTTAAGCCGGGCTATTCCTAGCAGTCATGG TTATACAGCAATGCAGGGCTATACAGTACCTGGTCATCAGATTGTGCCCTACAGTGGCTCAAATGTTAATGCAATAACAACTTCACATGTGCCTGCGATT CAAGCACCATATACCAGTGGAATTGCTGCACCAGTTCCAGGCCAACCCCAATTTATTGTTCCTGCTCCTTCTCAGTTTATGCAAGGTAGCGGTCCTGACC AAACAGCCGGGTGAGGGAGCAAATAAGGTGGGCTGTTTATCTTACTACATATATTTATTTCCGGTGTAAGCTTGAGTTTTTTTATAAGCGTAAACTTATA TTTTGAAAGTATTGTATCACAAGTATCCTTAGTTTGCAGCAGGACTACGAGCAGTGGATCTGCTACTTGAGTGGCGGGCTTCTCCAATCTAGCCTTGCAA GTTACTTATTTTGCATTCTAGAGGTACTGAGCTTTGTTTTTATGCAATATTATTGCCCCTTAATGGTAAGGTTGTAATAAGTTTAGCCACCCATGAGTAG CTCATAACTCAACTTGTTTATGATTTGGTAAGTTGAGCTCGTGAGCAATTGAGTTGTGCGTAACTGGCTCATTTAAATGATCCAGACCTCGAGGGTGTGC TCAACTCATTTTCTCATGAGCTTTAGCATAACGGTAAGGTTCCTTGCCCCGTGACCTAGAGATCACGAGCTCAGATCTTGGAAACAACCTTTTCGTTTGC GAGGGTAATGATGGCTGCCTTGTAACATCTTCACACTATGATTATGATTATAATATATTATAAAGTGTTATTACTACTAAGCCTTTGTTAATTACTTAAT ATAATTATGTATTGGATTAACTATATTAATAAATACATGTTACTACAAGATTCTGTAATCTTCTTAGAAAATGTCAAATTGATCTCTGCATTTGGGGTTT TCATTGCACAAGAATGATTTCTGTATCGCCAAATGAGGTGACTTGAGAAATTGTAGCACAAACCTAAAGCACCCAAGTTGTGTGCGTACTACAACAATCA CATAAGTAGCTACAGTAGATTATGATAACTAATAATGGTGTGATTGGCCTATTGCACTCAACTCTCAATTTGAATGCTGTGGGTTTATTCAAGAATTTCT TGCAACTGTGAAAAGTGTTGTGTTTATTTGCAATTGAAAACTATGGCATTGGAATCTATATGTTGTTTTAGTATAGGTATAGCTCTTAACGAATCTTATT ATGTGCAGGTCATATGTAGTCATGCTCACCAAGTCGTGTCTGAGTCGCTCGTGAAGAAAACTGGACTGTGTGGACTGCTTTTCCATTTGGACATTTACAC TCATGTATTTATACCTAGTGCTACTAGTACTCAGGAAGAGTGGTGGTAGTATTGGATCGGATGCCGGAATAGGTCTCTGGCAGCCATGTAGAAATAAACT TGTGTAAAAAATGAAAATCATGTCTGAATCAAAATATGATTCTTTGTACTTTGTAGTCTTGTGCAGCATTGATTTTGTAGATAATCTCATCAGTGTTGGT GCATTGTGTGAAGATGGATGGTCCGTCACATTTTTTTGGTGATTTTTGTGCATAGTAGCTGTGTAGTTGTGACAGGTTCTACCAGAAACTCGGGTGTAAT TTTATGACTTGTTTTTATGCAAAAAGTAGAATCACCAGTATCTCCAATTAGAGAAGATAGCAGTGGTCCTTGGTGTGTTTTTTACTAGCGTTTAGCAGAA AGTCACATGCTCAACTTTTTCTTAAAACTAATGTTCATCTTTCATTCTTTCTTGTGAAGGACTCAATGTGTCCTTAATACATGTTCTATCTTTTCTAATT AATTCTTACATTCTTGTGTGTATAAGACATCTTTTAGTGTTTTATGTGTAAGTCGCATGCTAAAATTATTACATGTCACTATAAAGGTGCTTGCTTCATA CTGGCTTCTACCACTCG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_48624; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_20908
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Probable RNA-binding protein ARP1 from Arabidopsis with 65.93% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019414871.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |