Id Trinity | FTRINITY_DN55126_c0_g5_i8 |
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Name Transcript | Ll_transcript_22418 |
Sequence | CAATAGTCTCCACTAACTTTGCAAAAGTTAAATGCATGATTGCATGAAGCTACTGAACACTTCTTTCTCTTATCTCAACAACTATTTTGCCTACATTTTC AGCTTCATATTGCAAAGTAAGAACTGACACACACAAAAAGAACAGAACTTGGAACTACCCATAATTTGGTTATGGTAATATCTTCAAGTTCACATGTACT TTGTTTTGGTCAAGGAAGTTAGTTAAAGTGTTTTTGAGCTTAAAGGGTATCATAAAAATCAATTTTTTCTAACAGTGTTTGTGGATAAGGGAATCAACTG GCCATGCATGAGTGTGGAAACATGGAGAGAGTGAATTCATCTTTAATGGGCTTGTTTCATCTTTCTGCAATTTTGGTGTTTGATTTGGTGCTTAAGGTTT CTGGAAATGCAGAAGGTGATGCCCTGAGTGCATTCAAGGACAATTTGATTGATCCTAAAGATGTTCTTCAAAGCTGGGATTCTACCGTTGTCAATCCTTG CACATGGTTTCACGTCACTTGCATTGACGATAGTGTGACTCGTGTTGATCTCGGAAATGCAGAACTTTCGGGTCAACTAGTTCCAGATCTTGGCCAGCTT CCTAATTTGAAATACTTGGAACTTTATGGTAATAATTTAACTGGGAAAATCCCTAACGAGCTTGGAGATTTGACAAAGTTGGAGACCTTGGATCTTTACA CGAACAAGTTAACCGGTCCCTTACCAGACACATTGGGCAACCTTAAAAATTTACGTTCCCTGTATGACATGCTTTCCGTTATCTCATATCTTTAATCTGC AAAACTTATTCAAATCTGTTCCAATTTTCTTTCTTCATTTACCTTTTTAGCTTTCATACTCTTGCTTTCCCACACAAAATGGTGGTACATTGGTACATGG TGCATTCTAAAACACAACTATTTTCAGTTTCAAAAGAGCCACCTATGCCTAAGAAAAGTTTGATTCTAACATAATCAAATGAAGTAGATTATGATTGATG ATAGTGCTCAGATTGGTTGGTCTAGTAAAATAAAAGTTAAAGATTCAAACTATTTAACTTGTTGGCCGAGTAGGGCCTTAAGTTTTGTGACAAATTTATG TTGTCCAACTAATATCCGAGTTGTTTCTCATTTCTCCTCTAATCTTTATGTACTAAAAGTTCCCTATATTTATGTGTGTATTTTTGAATTTATTCTCTAT GTATTAAACATAGAATAAAGTCCGAGTTATAATTGTCCGCGTTCGTCCACACTAATGGAGTGAAGGGGTGATAGTAGTAAACATTAACAGAGTTGTTAAA TGACTCTAAACAAAGGAGCCTAAACAGTTACCAACTAGTAGCGACCTATTTTAAGTTCTATGAAGTATAGGGACCCTATTAAAAAGACATAAGCTATGTA GACCTCTTCGAGAATTCAGTGAAACTACGGTAACCTACAGTTACATGTCATACTTATTTCAATTTAAGGGAGTTTTAATGTGTATATTATGGTTAGAGTT TAATGGAGGGACATTTTCATGAACTTATGCAGAAATTTCCAAAAGTGAATGCACCAGTTGTGCCTTGATTCAGACATATTTTCATTTTTCCTAGTAGAAT TCATTGAATCATTGCTATCCACCTTGATCTATTAGTTTAAGGCTTTATCGATGGTTTATATCGGCAAACCAATATGTTTTGCTCTCTGAACTAGGCGTGT CAACAATAACACCTTGTCAGGAAACATTCCTCTGTCTCTGACCACTATTGCTTCCCTTCAAGTCCTTGATTTATCATACAACAATTTAAGTGGAGATATC CCAGTGAGCGGTTCATTTTCGTTATTTACTCCCGTCAGTTTTAAAAATAATACTTTTTTGATTCAAAAATCCACTCCAGCTGCACCACTTCTTCCACCGC AACAGAGTACTTCAGGTAACAAAAATACTGGAGTTTTTGCTGGGGGAGTAGCTGCAGGTGCTGCTGTGTTGATTGCAGTCCCTGCAATTTTACTTGCATA TTGGCGAAGAAAGAGACCACATTATGATTTCTTTGATGTTCCTGCTGAGGAAGATCCAGAAGTTCACCTTGGTCAGCTTAAAAAGTTCTCGCTACATGAA CTGCAAGTTGCAACAGATCGATTTAGTAACAAAAATATTCTCGGTAGAGGTGGGTTTGGAAAGGTTTATAAAGGGCGCTTAACTGATGGCTCTGTTGTAG CCGTAAAAAGACTTAAAGAGGAGCGCACCCAGGGTGGTGAGCTGCAATTTCAAACTGAAGTGGAAATGATCAGCTTGGCTGTGCATCGTAATTTGCTTCG GTTGGAAGGTTTTTGCATGACACCTACTGAGCGGTTGCTTGTGTTTCCTTTCATGGCTAATGGAAGTGTAGCATCCTGTTTAAGAGAGAGTAAGGAATCA CAACCACCACTTGACTGGAGAAAACGGAAACATATCGCATTGGGAGCTGCTAGGGGGCTTGCTTATTTGCATGACCATTGTAACCCCAAGATTGTTCATC GTGACGTCAAAGCTGATAATATATTGTTGGATGATGAATTCGAAGCAGTTGTTGGAGATTTTGGATTAGCAAAACTTATGGACTACAAAGATACTCATGT TACCACCGCCGTACGTGGGACAATTGGGCATATAGCACCAGAATACCTCTCAACCGGGAAGACTTCAGAGAAGACTGATGTTTTCGGATATGGTGTGATG CTTCTTGAGCTAATTACTGGACAGAGGGCCTTTGATCTAGCACGACTTGCCAAAGATGACGATATCATGTTGCTTGACTGGGTTAAAGGACTTCTAGAAC ACAAGAATTTTGAGACACTGGTGGATGCGAATTTACAAGGTGATTATGATGAAGTAGGGGTAGAGCAGCTAATCCAAGTGGCCTTACTATGCACACAAGG CTCCGCTACGGAAAGACCAAAGATGTCTGAGGTGGTTCGGATGCTCGACGGCGATGGTTTGGCTGAAAAATGGGATGAATGGCAGAAATGCGAGATAATC CGGCATGATTTCAACCACACTCATTACCAGAGTGCTAATTGGATGATGTTAGACTCAACTTCAAATATTGAACCAGAAGTACTATCAGGTCCTAGATGAT GTTAGACTGCATAATTCTTCTGCCTGCTATATACTACTGATATTTGTATATGATCCTCATATTTCAGATCACATGCCCTGGATCATGTTGTGATTTTTAA GAAATTCAATAAATTTGTAAATTGTGTTGGGTTGTTAAATGACACAAAATTTTGTTGGTACTAGCAAGGGTATTCCTCACCCTTTTGGGCAAGGAACCAA TCTCTTTCGGGTTGTGTGACTGTCCTTCCCAACAAGTGTCGCTCACAGTTTGAATCCTTGACCATTTGATCATCTTGGTGATCTAGCGGAGCCTAACTCC TTGTTGGTAGTTAAGCGACACAAATGACCTATTGTCATTGTATTGTATGCATGTTAGGAATGACTATAGATTAGAAATAACTGCAATTATATTACCTTAA TGTGTTAGAATATTTAGAAATTCCTCATAATATTTCATTATATTTTGAATTGATTAAAAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_48787; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_22418
Blastp | BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 from Arabidopsis with 80.65% of identity |
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Blastx | BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 from Arabidopsis with 77.45% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G33430) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000466) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019429292.1) |
Pfam | Protein tyrosine kinase (PF07714.16) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |