Ll_transcript_20382

Id TrinityFTRINITY_DN55199_c1_g1_i15
Name TranscriptLl_transcript_20382
SequenceGTCATTTCACATTTCACTTCTTTTTTTTTCATTTATTTTAATTCAAATTTCTTCTTTCTCTTTTCAATTCAATTCTCTTCATTTTCAATTCTTTCTCTCT TCTCTTTCGGTATGCAACGTTTCTCTCAAAACGACTTCGTTTCATTCCATCATTCTCACATTACAATCCAAACCCTAGCTCTATATTCCATTCCATTGCT TCATTATAACTAAATTAAAGCAATTTTTCCTTCAATTGAAAGCAGAATCATAATTGGGTTTCATTTTTTTGTATTGGTTTAATTTGAGTATCTAAAAGTA TGTTTTTTTGGGTTTCATAATTTTGGGATTTTTTTTCCCATCTTATAATCCATATAATGTGTTATAGATCCTTTGTTTCTGAATAGTATAACTGTTTTTA TTCTCATCTGTTTGATATTACTATATTTGAAGAATGGAATGTTTTTTTATGAGTGTGATTATTTTGGGGATTTATTTTGCTATCTTATCATTCACACCAC AAATCAGACTATGTGTGCTTGATGCTATACATAACTCGGATAAAGTGTGAAGGTTGTGTTAGACAATCAACATCGACATAAAATTTGCCGAATCTATATG ATATGGATCACTCATACCATGTGTTATATATGTTTTGTTTCTGTATAATATAATTGCTATTGTTCTCATTGGTTGTGAATTACAAATTTTAGTTGTTGTA TATTGAATTGGTTTATTTGCTTCCTTATTTAGATTCTAAGGTCAATAATCTATGGATATCGATAAAATTTTGGGTACTACCAAACCTGCAAGTTTTCCAA GGAAGAGTGCTATTTATGTGTGGGGATACAATCAATCTGGTCAGACAGGGAGAAAGGGGAAACAGGATCAGCTGAGGATTCCGAAGCAGCTGCCTCCTGA GCTGTTTGGATGTCCAGCTGGTTTTAATGCACGGTGGTTGGATGTTGCTTGTGGTCGTGAGCATACCGCAGCAATTGCTTCCGATGGCTCACTTTTTACA TGGGGTTTGGACCTATTTTTTTGACTCATGTCTGTTTTTCGTATTATTGTCTCGTTCTTTCGAATACTATGTATTTTATAGTGTTAGGACTTTTTTTCCG GATGATTCTTATGCTGTACTTGTGTTATTTAGGTGGTAAAAAGGAATACCTATTAAATAAATTTAGAGTGAAATAGAATTACTTACACATTGTCTCCCAA ATCTAAAATAAAATTTTAGTCCTATTTTTAGAAGTCTCAAGCACTTCCTTTTTTGTTGGATATTATAAAAAACTGGTCGACAATTGACATGTATTTGTTA ATTAGAATAGAAACAGTTCTGTTATTCCAAGTCATTTCTACAGCAAGGATAATTGCGGTTTTATGTCTCTACTCTCTAGTGCAAATTATTACCGTATGGG GCCATTTGTTATGTGTGAACTAAAACCAGGTGTGTTTGGGAAGGTTGAAAGTAGAACGACTACAAGCATAGGTTTAGTTTTTGAGTGTAATATATATGCA CTGACAATATAAATATTTATACACCTTAGGTGCATCATCCATCGTTTATTTGTATTACTTTTATTTAAGAGTCAATGATGATTGGAAATGAATAATGGAT GATGCAGTGACAGTGTAAAAAACTCTTACATTGTCAGTGCATACATATTTTTCTCTTAGCTTTTTGGAGGGCTGTACTATTCTGACAGAGGAGCTCTAGC AGGAAGTGATTAGGAAACAAAAGTTCTAACAGTCTAACACTCATGTATATATTCCATATCCCAGGGGCTAATGACTATGGTCAATTGGGTGATGGAACTG AGGAGCGAAGGAAACATCCGAAGAAAGTAAAACAACTAGGGTCGGAGTTTGTAAAATCTGTGTCCTGTGGAGCACATTGTTCTGCTTGCATTGCAGAACC TCGTGACAATGATGGTACTGTATCTACTGGGAGGCTCTGGGTTTGGGGACAAAATCAGGGATCAAATTTTCCTAGATTGTTCTGGGGGGCCTTCGAACCT AACACGGTTATTCATCAAGTGTCATGTGGAGCTGCCCATGTGGTTGCTTTGTCTGAGGCGGGCCTTCTACAAGCTTGGGGCGAGTCACTAATTGCTTCTC TTTATTTTCTTTCCAATGTTTTGTAACATCAATGATTCATGATTGCCTTTTACGGAGTTGACATGGTTAAAGACCTTTAAATTTACAGAGCATTGAATGC AGTGAAGTAAACTTGAGCATTCACAAAGTAGGTTTCTTGCCACCTACTAATCGGACTTTTCTCACTGTTTCCATAAACCAGGATACAATGAGTGTGGCCA ACTTGGCCGAGGTGTTACTTGTGAAGGACTTCAGGGGGCTCGTATTTTAAGTTCTTATGCTAAGTTCCTTGATGAAGCCCCCGAGCTTGTGAAGATTACC AAAGTGTCATGTGGGGAATACCACACAGCAGCCATTTCTGATAAGGGCGAGGTGTAAGTAATTTGAAGGACATTCTAGTTGGAGATAATCAGATAATTAT AATTTTAAGCTTGAGAATTGTGGTTTTCCGCATGACATTAGGGAATCTGACACCAGGAGACAATATGCAATGGAAATCCTGCATCTATTATGCAAGTTTC TATTCCCTTGGCTTGGTTATACAATAAAAAAACTATAGTTGACTGTAGTTATATATTCCTAGAGCCAACAGGGTTATCTTCTAAGTTAAGTAACCGTAAT ATTATCTAGATTTTGTTTGAAAAAGTTTGCAACAAGATTTTTTATTCTGTTGATAATTTGACATCCACATATGATTTATTGGTAAGTATTTATTTATTAT TTTTCATTATAGAATGTTTGTTATGGTGTAAGATAGTAGTTGCTGAAAACTGGGAGCTTAAAATATGTATGGTAACATTGCATCAGAAATAGGCATATGT TGTTTACGGTGGTTTCCACTCACCAAATTTGCTATTTTGTGTTTGTGATTTTTAATGAAAAAAGAATATGCACATATTATAGAGTGGATGACATCTTTTA TTCTTATTGTTGAGACATGTAGACCTCAAGTTACTTCTTTTCGTTTACCGAGGAATTATTTATTCCAGTTATATGTTAGGGATCCATAAGAATTAATAAA TCATGACTACTTATGGTATTTAGCTTGTTGTGATAATATTTCCTCACTTATTATATTTTCCGTTGGACCAGTTACACATGGGGGCTCGGAAATATGGGTC AACTTGGCCATTCTTCACTCCAGTATGGGGATAAGGAGCTTCTCCCGAGGAGGGTGGTTTCCCTTGATGGTATTGTCATAAAAGATGTGGCATGTGGTGG TGTACATACTTGTGCTCTGAGTAAAGAAGGAGCACTTTATGCTTGTGGCGGTGGTCAATCTGGTCAGTTAGGCCTTGGCCCCCAAACTGGATTGTTCTCT TGTGTAGCTAATGATTCTCAGACATTTTTCCGAAACATTCCCATTTTAATTGTTCCAAAAGATGTGCAATTTGTTGCATGTGGACATTCCCATACTCTTA TTTCTACGAAGGAAGGTCGAATTCATGGGTGGGGTTATAATAATTACGGCCAAGCAGCCAATGAGAAATGTACATATGCCTGGTATCCATCACCTGTTGA CTGGTGCGTTGGGGAGATCCGAAAACTAGCTGCTGGTGGGGGCCATTCGGCTGTGTTGACCGATGCTTGTTCATTAAAGGAGCTGTGTGAGTTTGTTCTC GCAGATTGTATGACCTTATCAAATGCTGCTAAGGTCGAGGATATTGCTTCTAGAACTGGATCGGATGCTTTAGCACGCCTTTGCGGAAGACTCAGAGAGT ATTTGCTTATTAATGGTGGTGATGATGAAGAGAACGTGGTCAGTAAAATCTGACAATATATGAAGTTAGTATTAATCACAATTTATTGTTGTAATGTAAA TCTGTGTATTCAGAAGTTGTAACTATGTTATTATTCTGTAACTAGTATCAATTGAATAAGGATTTGTACTTGACTATGTATAGACCATGAATATGCCAAT ATTGAATTTCAAACTTCC BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_49399; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_20382

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_20382
BlastpProbable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 from Mus with 38.61% of identity
BlastxProbable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 from Mus with 38.32% of identity
Eggnogubiquitin protein ligase(COG5021)
KeggLink to kegg annotations (67345)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019456541.1)
PfamRegulator of chromosome condensation (RCC1) repeat (PF00415.17)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;