| Id Trinity | FTRINITY_DN55231_c0_g1_i22 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_139865 |
| Sequence | CATTATTGTAATAATTAACCTATGTTCCCATTATTCACTGCCAATTATTCCGCAGCCGCCGCCACGTTTTAAAAAGCCACACAATTCATTTTCGGACCAA TTCAATTCACACACCTTCTCATCCGCGAGATCTTATTATTTCTCATCTCTTCTATTTTCTTCAACAAAACCTATCATTCATTATTCCTCTTTCGCAATCG ATCCAATCTTATTCTATCGTTCACGATCCGTCGTTGTTTTGATTCTTCACCTGAACTCGTTGTTGCGTTGATCTGAATGGCGTTCTTCAAAAGTGTTGCT GCACTTTCTCGTCTTCGTTCTCGTGTGGGTCAGCAATCTACTCTAGCCAATTCAGTTAGATGGCTGCAAACTCAGACCTCCAATAACACTGATCTTTTTT CTGAGTTGAAGGAAATAGTTCCAGAACACCAGGAACGTGTCAAGAAGCTGAGGAAAGAACACGGGAATGTTGAATTGGGAAAAATCACAGCTGATATGGT ACTTGGTGGAATGAGAGGAATGACCGCATTACTTTGGCTAGGCTCAGCTGTTGACCCAGATGAGGGAATTCGCTTCCGGGGTATGACAATTCCCGACTGC CAGAAAGCACTTCCGGGTGCTTTTCCCGGTGGAGAGCCTTTGCCTGAGGCTGTACTGTGGTTGCTGTTGACAGGAAAGATACCAAGTAAAGAGCAAGTAG ATTCATTAGCCGCGGAATTGCGTAGTCGTGCAACTATCCCAGGTTCAGTTTCTTTTGAGGTCATAGCTTGGTTATATTTACCTTGAAGTATTCTTCTTTT GTAATATAATAGGCTGATTGCAAGTGGGCTGTCATGGTTTTGTGGTCAGCATTTATCAACCTAAAGTTCAGTAGGCTTAAGTGCCATACCATACATGTTT TCTTTAAATATGAAGTGAAATCATGGAATATAGGTCATGCATAATATGTTTATGTTCATAGAGATGAACTTAAGTTATCTTATTTTGGGTCACATGTTTC TTAAATCATAGTTGTGAAGGAACTTTATGAGGCTAGCCTCTCTGTTGTTATTATTATATGGTGGTCCTTGTTAGAGGAAATACGCACCCTTATGTAAATG CTTGAAAACTTAAAAGATATGGGCTTATTTTGATGCATTATGTCTGTGTTGCCACATTCACAACTTGCTTTTGCTAACATGTCACACGTGTCTTGATGTT TTTACATAACAAATTTTCTAGCTTGTTGCTGATGCTTCAGTCTGACTCCATTCTTGTTATGACTCAATATTATGCGTTCGTTATTTTTTATTGCAGATTA TGCTTACAAGGCAATTGATGCATTGCCTGTATCTGCTCATGCAATGACTCAGTTCACTACAGGTGTCATGGCCCTTCAGGTTCAGAGTGAGTTTCAGAAA GCATATGAGGGTGGGATAGCTAAAGCAAGGTATTGGGAGCCAACTTATGAGGATAGCTTGAATTTAATTGCTCGTTTGCCATCAATTGCTGCTTATATTT ATCGGAGGAAATACAAGGATGGAAAAATCATACCAATGGATGATTCTTTGGATTATGGTGCAAATTATGCTCATATGTTAGGATTTGATGATCCGGAAAT GCTGGAATTCATGAGGCTGTATATTTCCATCCATAGTGACCATGAAGGTGGTAATGTTAGTTCTCACACAGCTCACCTAGTTGCTAGTCCACTATCAGAT CCTTACCTTGCCTTTGCGGCTGCTTTGAATGGGTTAGCTGGGCCACTGCATGGTTTGGCCAATCAGGAGGTTCTGCGCTGGATCAGATCAATAGTTGCTG AGTTTGGAACTCCAGATATTAGTAAAGAACAGTTGTCTGACTACATTCATAAAACATTAAACAGTGGCCAGGTAACTTTGCACGACTAGGAAGCTGTTAT ACGGAATGAAGTATTTGAAGCGGTTTTTCCTTTAGCCCTTTTGGGGTTAATTAATTATATGGAAGATGCATGGTTTTAAGTAATTTTTTGTTAGGACAGA TCAGAGGATAAGAAATCTGAAGAGAGAGAGAGAGATCAATTGAGCAGATCATGAAAATATTATTTTTATGCATTTATACACAAATACTAATAATTCTTGC TTAGTGTATCTCAGTCTGCTTATTCCTATTGATACCTCTTCTAGACTCTTCTATACAAGCTTCTCTTGGTAACATGCTGATAGAATTTGGCTATTTCCCT TTTTGAACTTTCAGGTTGTGCCTGGATATGGTCATGGAGTTTTGCGCAAGACAGATCCAAGATACACATGCCAGAGGGAGTTTGCTTTGAAGCATTTGCC TAATGATCCACTTTTCCAGCTGGTGTCTAAAATTAAAGAGGTTGTGCCTCCAATTCTGACCAAGTTAGGCAAGGTTAAAAATCCATGGCCTAATGTTGAT GCTCACAGTGGAGTGCTACTGAACTACTATGGTCTGACTGAGGAAAAGTATGGTGTTACTTCTCTTGTTTATTTCGACTTCACAGTTTTCATTTTGCAAT TATTTAAGGGTGAATCTCATGATATGTTAATGTTTTGGACAGCTATTATACTGTTCTCTTTGGAGTATCAAGGAGTATTGGGGTTGGACCTCAGGTTTGT TATGCTCCATTGTTTCTTTTTTGGGGCTTTTAAGTTTTTTCTCCAGAAACTCCTTATGATATTGACATGTTTTCTTGGTTAGAGTTCCTGACTAAAAAAC AGAAGTTTAAAAGATGCTGAAAATCAGCTTTTAAGAAGCTATATTTTTCAACTAAAAAAGTGTTAGAAAGAAGAGAGAATGCAGTCATGTACATAAACAA TTTTTTATGATTGAATTCAAACAACTAATACTAATGAGCTCAGGCCTGATAGGTAGCAGCCTCGTGCCGTCGTGCACTAGGTTGTCCTTTAAACGTCTCA GTGCACCGATAAGATTGTTACCTAGTGACATGTTCAAATCTTAGAAATAATCTCTGTTTGTAAGGTACCATTCCTAGATCCCACTAGGTGGGAGTATTGT GTATTAGGCCACCCTTTTTGTACCATCAAGATTATCTTTTGTTAATAACTAGAATCACTTTTTAAAAGCTTAAATAATAGAGTGTTGACTACTCATTTGT TACATTGATTTAACTTGAACCCTTCTTTTTGGTGGATTTCAGTTGATATGGGACAGAGCTCTTGGATTAGCACTTGAAAGGCCCAAAAGTGTGACGCTTG AGAAACTCGAGGCATTGTGCGGCATATCATCCTGAAGCTTATACCACCATTTATTTGTTAATAATTAATTGAATACACTGTTTAGTGTATTTCTATGTTA AATTGAATATTTCATCCATTGCTGTGAGGAGTTCCTCTCCAAATCATTCAGGTGCATTTCCTCTTCGAGTTGTCTTTAGAAGATTTTGTTATTTAGGTAA CGCTGATTTGTCAATTTCATAATTGTCAAACTACTTTTTTGAGAACGTCAAAAAATAGTTTGAGTGATCATCACAATAAATTCATTATCATTGGTTTCTA AACAAGATTTACTCTTTCAGTGTTATCTATGTATTGTTAATGTAAAGATTCATATATATTTGATGTGTCTATCATTATTTGTATTATTTTTATCTAAGAA CCAATGATGATAAAATGAATAGTAAGATGATATAGTAAAAAATATTATAACTTAAATGTACACATCTTTTCTCTGTCCTTTTACAAATGATCAATATTGT ATTTGCTTGAAGTTGTTAGACGTGAATCATCATGACACTATGTAATTATGTGCCTTTTTTACCTCCTTTAGTAATTAGTATGCTCTGTATTACTGCACCT GTTCTATGTTTCTGGCATCCATTCAATTCATTGCTTTAAAATTAAAAGGATACAATTTATGTAATTATCTTAATTTACACCTGTTTCGTGATAATTAACA CGTTTTAAATAACGTTATATTATTCATTTGATTTTAGGGATTAATAATATTTAGAGTAAATATATATTCTAGTCCTCTTATTTTTTGATCATA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_49675; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_139865
| Blastp | Citrate synthase, mitochondrial from Citrus with 73.76% of identity |
|---|---|
| Blastx | Citrate synthase, mitochondrial from Citrus with 73.76% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019443636.1) |
| Pfam | Citrate synthase, C-terminal domain (PF00285.20) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |