Ll_transcript_139730

Id TrinityFTRINITY_DN55247_c0_g1_i7
Name TranscriptLl_transcript_139730
SequenceCTTCTGAACGTTTCTTCTCTCTTTTCTGAAACCCGTTGGTTGAAAGTTGTTAGTGAATAATGGATTTTGATGCAGATGATTTTTTCAGAGACGATGACGA TGATCTTCATAATCAATTCTCTCTCGAAAAAGAAACAAGCAAAGAATTCGTGGTTTACCTAGTTGATGCTTCACCCAAAATGTTCACCACTACTTCTCCT TCGGAAGAAGAAGGAAAAGATGAAACTCATTTCCACATTGCTACCAGTTGTATTTCTCACTCATTGAAGTCTCAGATCATTAACAGATCCTATGATGAAA TTGCCATTTGCTTCTATAACACAAGGGAGAAGAAGAATATACAAGACTTAAATGGTGTTGTTGTATTTAATGTTGCCGAAAGAGAGTTTTTGGACAGGCC AAATGCCAGGCTCATTAAAGAATTTGACTCTATTGAGGAAACTTTTTCTAAAAACATTGGAAGCAAGCAAGGCATCGTGTCTGCGACTCGAGAAAATTCC CTCTATAATGCTATCTGGGTAGCACAAGCACTTCTTCGTAAAGGGTAATGCACTTAGTATACACATATTACAGTCTTATCTACATGGTTATCGATAAGTG ATAATGGGGAAACATTTATACTAGGTCAGCAAAGACAGTAGATAAGCGCATGCTTTTGTTCACAAATGAAGATGATCCTTTTGGGAGTATGAATGGGGCT ATAAAATCAGACATGACAAGAACGACACTGCAGAGAGCTAAAGATGCACAGGATCTTGGCATCTCTATTGAACTTCTTCCCTTGAGTTGCCCTGACGAAG TATTCAATGTTTCTCAATTCTATGCTGATTTGATTGGGCTGGAAGGAGATCATCTTGTTGACTTTATGCCATCAGCAGGAAACAAATTGGAGGATATGAA AGATCAGCTAAGAAAACGCATGTTTACAAAGCGCATAGTCAAAAGGATTAAATTTATGATAGCGAATGGGATATCTATAGATCTGAATTCATATGCCTTA ATTCGTCCCACTGTGCCGGGAGCAATCACATGGCTTGATTCTGTTACGAATCGTCCTTTGAAGAGTGAAAGAACTTTCATTTGTGCTGATACTGGTGCCC TGGTGGAAGAATCTTCTAGACGATTTCATCCATATAAAAAGTATGCAGTTGATTTGATGCTTATATCTTTATCTTATTTACCATTTTGAGTGTTTTGCAC TATTTTCTCAGGTATTCGTTTTTCTAAGAAGATTGGACTTCGCTAATTATAGCAACCCTACTAAGTAGGCCATCACTTTGCTCTGACAATAGGAGTTTCT TGGATGTTGATTACATTGGGTTCTATGTTGTGGGAAAATGTTCTCTATAAAAAGCAGGAAGTGAAATGACTTTATTAATTAGGAAATTCCTTTGAGTGAT AATTCTTAGTCCGTTTCATTTTGGCATTATGTTCTTGATAAGGTCTCTAAGAATTTGGATAATTGGAAGGGTGTTTTTTCTGGTTGGTCTACGGTCATAT TATTATATTCTGTCCTGCTTGTTTAGTGACACCTTTTATTTCTTTTCCTCAGATAGTACTTGGAGAGAATCATAGGTTGGACAATTATTCTGGGTTTTCT GTGGTCATGGGTGAGGGTAACAATAGTGTCTTGTTATGGATAGATCTAGTTAGAATTTAGAAAATGTTTTTTTTTATTCTTACAAAAAGAAGCTAATGCT CTTTGGAATGGTTTGTTTGCATTTGTTGATGAAGTAGACTGACTACTCATAGGCAAGATTGGGGTATCAGGCTACAAATCAAACTTATGAGTTTGTTGAA GCCGAGTGCTTTATTGGACACTCACATAAATTTGCTTGCTAACTACATCTGCCTGGGGGAATACCTCGAATGCCCTTATTCTAATTTTTGAAGTTGTGTT GTTTCCTTTTGTTTTTAGTTATGATGTAACATTTATTTGTGTATATTTTTCAGCCAGAATATTACATTTTCAATGAAGGAACTGATTGAAATTAAAAGAG TTTCTACTGGACATCTACATCTTTTAGGGTTCAAGCCACTAAATTGTTTGAGAGATTATCACAACCTGAGGCCATCAACTTTCCTTTACCCAAGTGATGA GGTTATTGTTCTTCTAGTCATCAATCAAACCATTGATTGCATTTTTAGTCATCAACAATTTTTGGTTTTAATTGCAGTTTGCCTACCTGGCACTGCTTTC TTATCCCATTCTTTTAATAGTTTAATTTTGGTAACAAATCATAATTATACCACTTTAAGCTTCCTTCAAGTTATCGTTCCATGTTAAAGCATATGATATA TCCAAATCATCAAATGAGTGCTTATACTGTCCTAGTGTCCTATTGGACAATGAAAGTTACAAAGCTCATCAATAAAAATATCAGAAAATAATATGTCTTT TTAGGGTGAGACGCAACGCATCAGTAAGGTTGTTTCCTTGTAACTTGGAGGTTACAAGTTCAAATCCAGAAAGGCAGAGACACCTTTGCTAGTTTGCTTG CGAGGTGAGTTTGCATAAATTTCCCTGTCCAGACCTCACCATGTGAGAGCCTAATGCACTGGGCTTCCTTTGTCCATACTGTATCAGACATTCTAAACTG TGAGCACTTAATCCTTATGACAGTTTACTTCAATACAGTTTTCTGTTGGTCTCATTAGTACAAAGGATTTTATAGTGATAATTCTTTTGTGTTCTTACTC TGATATTCTTTCAACTTTTTGTCCTTTGCTCATGTTCTTCTTTCACCAGTTCCTCTGCCCTCAGTTTAAAACTAACATAGATCCTTTTAATTTAGACATT TTAGAAACTTGTCTTGATTTATGGTCGAACCAAAAAACTAGTTGAAGGTGTTGATCATGTCTATCTTCCAATTTATGGTAGACAACATGAAGTGATATTC TTATATACTGACCTGTCTGTATTATGCAAAAAAATTGTGCAGTTAGTAATTGTTCCCAAGTGTATCTTATATGCTTCTCTTTTTTGTATTATTCTCTATT TATTATGTCCTTGTAATGTCTCATTTTGTTTTGCAGGGTATGGATGGTAGCATGTGTATCTTCGTTGCCCTCCATAGGTCCATGATACAGCTCAATCGGT ATATTTGAAACTAAGGCTTTACATATCTGTTGAAATTGTATATGTCTAGGATCGTAAAACAGCATTTACGGACACTAGACACTTATTGGAAGTTAAACGA AAAGGACTCCCCCTAATAGGGAACCATAAGACAAACACATCTGAAAGAGATAACGGAAAAAATGAACCATCATATCTGTCCCAAAACCAACGAAGGAATT CCCCTCCCCAAAACCATATTTAACAAAACTTTCTGATCAAGCTTCCCAGATATCTGCATTCTCTTTTCTTTTCTCTATGAGGGGGATTTGTATAAAGCTG TAATCCATATCAAGTTAGGCAGTGTATATTTACCAGACATAAAAAGATATCAAGGTCTTCTTACTAATTTAAATAACACATGTAGTATTGTAGGTTTTTT AATTTTAACATTGCTTATTGTTAAATAGCTTTCTGATCAAAGTAATGCATGGTGTGTCTCAGTTTTGCGCTTGCATTTTATGGTAGTTCCTCTAGACCTC AAGTGGTTGCCCTTATTGCACAGGTATGATATATTTACTGCTCGAATTTTTTCGTGTGATGATTAATAGTTGTTTTCTTGAATTCAAGAGCTTGCATGTA ATGTTTTAATTCAGCAGACGTGTTTTTAAAGTTTGCTATGCTGCCAATGGTTGCTTATATCAATGTATTTGGATAATTTGTCTGTATGGCAGAGTTGGGT TAGGCTTTTTTGGGTTCTTATTTTATAAAAGGGATTTGGTTGTTATGAATTAAATTTATGCTTTGAGCTTTCACAAACTTAAAATTTCAGTAGTAGTATA TCAGTACTCTAATCAGGCATTGTGGTTTTGTCAGCTTGTTTTCATTAGTAAGTTTTAGTTAAATTGCAAGTCTATCAAGTAAATTGGAAATTTTGGATCT CTGTTGTGCTTTCATTTTATTTGAGTTTTTAACATTCTTAACTTGTGTCCATGATTGTAGGATGAGGTTATCCAATCAGGTGGTCAGATTGAGCCGCCTG GAATTCACATGATTTATCTTCCATATTCTGATGACATCAGACTTATTGAAGAGCGTTTTTCAGATTCTAGTGGGATGGTGCCTAAAGCAAGTGATGATCA AATAAAAAAGGCAGCTGATTTAATTAAGCGTATTGACTTGAAAGATTTTTCTGTATGCCAATTTGCCAACCCTGCCTTGCAGAGACACTATGCAGTATTG CAGGCTTTAGCTCTGGAAGAGGACGAGATTCCAGAAATGAAAGATGAAACATTACCTGATGAGGAAGGCCTGGCCAGGCCAGGAGTAGTGAGGGCGATAG AAGAATTCAAGACCTCTATATATGGGGAGAATTATGATGAGGAAAGCGAACAACCCGCAGGGAAGCCATCTGAAACCTCCAGGAAACGAAAAGCCATTGC CGAGTTTGCAACAAAAGAGTGTGGAAACTATGAGTGGGGCGATCTTGCTGATACCGGAAAGGTAAACCTTCAAAATTGTGTCGTGCAGTGTTCTTTTATG AAATGTTTGGTCAAATATGGACAGACATGTGTGCAGCATTAAACCAATTTAGCAAGAATAAATCTACTATACAAGAATGATCGATTGGCTGTAGCTCATT ATTTTTGATGAATTGGAGAGAATGTGTTATCCATTCAAAGAAATACATACAAAACTATAGCGGACAAACTAACATCATACCTAACTAGCTGTTGATACTT ACAGAACTAGATGCCATTTAACTTTCAAGATCACATCCCTCATGTAACCTTGAGACTGTTGTTACTGATTCATTTGATTTTATTTTGCAGTTAAAGGATT TGACTGTGGTG BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_49787; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_139730

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_139730
BlastpATP-dependent DNA helicase 2 subunit KU70 from Oryza sativa with 57.23% of identity
BlastxATP-dependent DNA helicase 2 subunit KU70 from Arabidopsis with 64.32% of identity
EggnogX-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6(ENOG410XNXU)
KeggLink to kegg annotations (4342584)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019441578.1)
PfamKu70/Ku80 C-terminal arm (PF03730.13)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;