Ll_transcript_138007

• Id Trinity: FTRINITY_DN55263_c0_g1_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_138007
• Sequence: CTCTTCCGTTTATCTCTCTTTATCTAAATACTTTTTCTATTTTCCCTCTTACAAATATTAGTATATTACCCATTACTCCGGGGTGTTGCTTTGGATTGGT TTTAAAAAAATAATAAAATGAGTGATCGTTTGGTGCTGTATGTGGACCGGTTGGTACGGCCGGTGCCGGTTGAGCCGTTGACTCAACACCCGGCTCAGCC CTCTCCTGAGCCTTCGCCGTCAGTGGATGCTGTCGCCGTGGACAGCGACGGCGAGGCTGAGGAGCATCCGCTGTTGCAGATGGCGGAGTGTCGCATTTGT CAGGAAGAGGACAGCGTTAACAATCTAGAGTCACCATGCGGATGCAGCGGCAGCCTTAAGTATGCTCACAGAAAGTGCGTCCAGCATTGGTGCAACGAGA AGGGTGACATAACTTGTGAGATATGTCATAAGGTATGCTTCTTCTATGCAAAACTTCCATATTTCATAGTTTTATTGTTAAGTTGTGGGGATTGGTTGAT AATGGTCATGCTTACCCTTACAAGTATACCTTTACAAAAAAATAATTTTGTACAATGATATCTTCAATTCCGAGGTATATGATGTAGCATTGGTATCACA CAACTGAATATGAGATTAGAGTCCTCGGCATGCATGATGAATGGCTAGGACTGAGATTCCCACAATGTCATAGTAGGGGCATTGCATGTCTGCCTTGTTG CTAGGATTGGGTCATTGGGATAGGATGGAATATGGGATGCTAGCTAAAATATCCTACATATTAAGGAGTTTTAGATGCCTTTTATAAGGATGAAATGTGT GTAACGAATCCTTAAATTACTGTGAATCTTAGAATTGGAGAAACTGAAGGTAACAGGCTAGTATAAGTCATATGCACAATAATATGTAAAACATGCTTTT AAGAAGTTTAATATTTTGCGTTGTTTGATGTGGTAGTCTATTCGATGTTGTTTGTGTCTTTTTGACCTCTTGGGTTGTAGAACATCTATTTAGTTAACTT GGTTGTCTTTGTATTGAGCCTCTCTCTTTGAGGTTATCTTTCTCTCTTTACTTCATCTCTTTCCAGATATATTAAATTGTTTTATCTTTTATGGTAATTC TTTTTTCTCAGCCCTATCAACCTGGTTATACTGCCCCACCACCTTGTCCACGTCCTGAAGAAACTACCATCGATATTGTTGGAGGCTGGACAATCTCTGG CACACCTTTGGACTTGCATGATCCTCGACTCTTGGCGATTGCAGAGGCAGAACGGCAATTCTTGGAAGCCGAATATGATGGATATGCTTCCTCTAATGCC AGTGGAGCTGCATTCTGCCGTTCAGCTGCTCTAATTTTAATGGCACTTTTACTCTTGAGGCATGCACTTTTTGTCACGGATGCTGATGTTGATGCTGAAG ATGATCCATCCACTTTTTTCTCTCTTTTCTTGCTTCGAGCTGCTGGGTTTCTTTTACCTTGCTATATCATGGCTTGGGCAATCAGTATCCTGCAACGTCG GCGTCAAAGACAAGAGGCTGCAGCTCTAGCAGCAACACAAGTTGCCTTTGTACTACAATCTGGGCAGCGTCGGGGTCTGCAGTTTGCAATAGCACCAGGA CCGACAGTACACCCGGAACAAGTGTAGATTTTATGTTGATGTATGAATTCCTTTACCCATGTGGGCTATGTAAAGAAGGCTTTTTGAAATGCCATGCATT ATTTTATTACTCTTGATTTTACAGCTCTAATGCATGTACGTAGTAGTGATGGTAAAACAATCCAGGTCTCCGTTAACGATTATAAATGTTATTCAGTCCA TCCTGTTATCGAAATGGGAGTATTTATATTTGAAAATGACTTTAATGTTTACTAGTTTTGTTCTTTGGAGGATTTGATGACACTTGAAGAAGGATATGAA TTCTTTAAAGTGACATGTTTTCTAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_49932;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_138007

FPKM

• FPAB: 9.1
• FPNAB: 2.5
• LF1: 1.8
• LF2: 0.7
• LF3: 2.1
• LF4: 2.8
• UF1: 1.6
• UF2: 1.9
• UF3: 2.6
• UF4: 3.4

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_138007

• Blastp: -
• Blastx: Probable E3 ubiquitin ligase SUD1 from Arabidopsis with 35.44% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019445941.1)
• Pfam: Protein of unknown function (DUF3675) (PF12428.7)
• Rfam: -
• GO: -