| Id Trinity | FTRINITY_DN55293_c2_g1_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_139345 |
| Sequence | CTAGTTATCTACCATCACCACTTTAACTGCCTTACCCACTTTCCTTCTCTACACATCTCCCCTCAAACTCAATCAAAGTATTTGATATGCAAGTGTCAGA AATCCAACAACTTCAACTCCAACTTCAAGTGAAACACCACAAACAACATAATCCTAATAACCAAGACATACCCATGTGCCAGAAGAAGATCCAAATTCAA GATGAGAAGAAGGTGATTGTGGAAGGAGATGATTTTCTCGTACCACCCCTCAATTTTGCAATGGTGGATAGTGGCATTTTTCGTTCTGGATTTCCTAAAC CAGACAATTTCTCCTTCCTCCAAACACTTCGCCTCCGCTCTATCATATATCTGTGTCCTGAACCATACCCAGAGACCAACTTGGAGTTCCTCAAGTCTAA TGGGATCAAGCTTTATCAATTTGGGATTGAGGGTCATAAGGTTAATATTTTTTTGACCAATCAAATACGGCGGCGGCGAAACCGCTGAAGTGTTCTGAGA AGAACATATGCAGTGGTTCTGGATGACAGATGAAACATAGTCACACATGAAGGTTATTTTTTAAGGTGAAAATTCAGTAATTTAAAAGTTCTCATCTATT CAAACCTTGTTTTTTTAATAGATGAAGATAACCTAACTGGTTTTCCCATCAAAACTCCTCCTCACTCCCATAAATTAAGATCTCCATTTATTTTATTAAA TCACACTAATTAGTGAATGCCCTCACTCTATTACAGACATTGAACTAATGAGCTTAAGGATATTCAAATAGATCAAGCTTTAATTTTTTTATACTAAAAA CCACAATTGATTATGCCCACAAGAATCATGGGATTGTAACTTATTTGGGCTTGACTTTTTTCCATTTTGGGTGGTCTATGTTGGGTGATTGGGTCTAGTA ATTTTGTGTTGACGATGCTTGTTCCATGTCTTGATAGTTTGTACAAAAATCAATGGATATCTAATCCACTTGACATCTCCCTTTCATCCTTTGTACTCTA TGCTATTTTTTTCTTCAAGTAGGCGTGGATAATAATTAGTGACTTGGTGAGATGGGGCCATTACGTGAATGCTGTGAAGTAAAGTACTGTTTAATCAAAG AGGATTTTATAAGGTGTAGCAGGGCCATGGGAGGGGGTAATGGGGTTGTAAGGATGCATGGTTGTTTATATTATTATTGCTTGATTCTTTGGATCTAACT CTTTAGAGTGTCCAAACTTTATATACTGGTTTTGAATGATATATGTACTTGTTTCCAAACTTTCGCTTGCTAAATTTATCATCACAGCTTTTCAGATATC ATCACAATATTATCATGTCATTTGTGTTCTGGTTACTATTGTCGATTAGATCCATTATTATGATTTTAGCATATTCTTTGGGTCTAAGAGCCCTCTCTTC AAAACTCAAATATCCTCATTTTTATTAACTTTCAAAAGTATACCAACTTTGGACTACGGAATTCTTGGTCAATGGAATCCAAGCTGGCATTTCAAGTTTT TCCTTGTGAATAATTAATGTATTGGACTATCGGAGATCGTTGATTATATACTTGTTGTCTGTATATGGGACCATTATTGTGTGTATATGTCAAAAATCTA TTCTGTTCAAGCAGAAATTTGCCCTCTAATAATGCAAGTATACGGTAAAGAAACGGAACAGAATAAAATCATGATCAACTCAAGAAAGACAAGGAGTTAT TATTAGAAAAAAACATGGTTAAATTACTCTAGGCCATGAACTTTGTTTTGGATAGTAAATTACTCTTCAAGGAAAACTAGTACTTTAATTGAAGCCACCC TAGATTATGTTATCTCTAGTTTACCTTCCATTCCTTAATAAATGAGACTTCTATCTTATGTTGTTGGCATCGCATGTTTTAATTGAGAATGTCAAATTGT ATTTAACCTTATGAAATTTGTGCATACAGGAGCCTTTTGTAAACATCCCAGAGGACACAATCCGTGAAGCACTAAAAGTTCTCCTTGGTATGCTAAAACT CTTCACTTTTATCTTTACCAAAGTTTGAACTACTTCTTTTGCTAGGAGTAGTAACTTTTGGTGATTTAATAATGTAGATGTCAGGAACCACCCTCTCATT ATTCACTGTAAACGGGGAAAGGTTAGCAGCTTCTTATTTTTTTGTCATTTTCTAACAATTTTGTTTACAACAGACAACTTAGGACAATTTTTTAGGGTAT TGTACTGTGTTATAAAGCCCAAAGTTGTCCATTGTGTTGTACATATAACATAAACTTAGATGTTTCTTGTTAAAATAAGTTACATTCTTTGCTTTTTTTT ATCATATGCATGCAGCACCGAACGGGTTGTTTAGTAGGGTGCTATAGAAAATTGCAAAAATGGTGCTTGTCATCAGTGTTTGATGAGTACCAGCGCTTTG CAGCTGCCAAAGCAAGAGTTTCAGATCAGAGGTTTGTAGAGTTGTTTGATATTTCCAGCATCAAGCATTTGCCTATAGCATTTTCATGTTTGAAGAGATA ATTAACATGCCAAGTTGGGTTTCCTTCATAAAGCTTGTAAAAGGGGATCAAAGGTTCTGTTTGGCCATGGAATAATAATAAATAAGAAAAGGTGCATTGC AGCTGCAAAGGAATAATAATTCTTCTTCTCCCACATATACATATAATCATATATACTATATATATATAATATATCCCTACTAGGATATTATAGTGTGCCT CACCTTTTTGTAGTTCTATTTTTGTTTCTTTGCTGCTACCCATTCATCAGAAATGAGTGTAGATATGTCTTGATTTTTTTCTTCAGAAATTCAAGAAAGG TACTAAAGCATTATTTGTCTACCCAAAAATTTTGGTGGTAGTTAATCAGAGAAACTATATTACAAATTTTATTTGCTAGAATGGTGTTGCTTTTATTTAT TTATAAGTAATTGTGTGTTGTTATTGAACATGGGAGTGTTTTGGAGGGACGTGTATAATAATGCATTTAGGGCTTGTCTCAATCTGACGCCAGTTTTCAT GAAGATTTGAAACATCACACTTTTAAATCTTAGTCATCAATTCATTAGAAATCTAATGGTTTAGATTTATCACTAATTGAAGTCATTGAATTTTCAATAA ATTGATGACTAAGATGGGAAATAAGTCTTTTAAACTTACTGCTGTCATCCACTCTGAAAATATGTGAATAATGTTATAAACTATTGAGATCAGTTTTTTT CTTTTTTCATGCATGTTTTAACTTTTAATATAAGTTTTTTTACCAACAAACTTTAAATTGAAGTTAATTTAGATATTTAAAAATATACAGAAGTAAATAT GTGAATAATGTCATAAACTATCAAGAAGTAAATGTTTGATTATTATTGTATGTGTTTTGGTTACCAATAAAAGTGTTAAAGTCAATCTTAAAATTTTAAA ATGTTGACTCTTAATGCATACCCTTATGTCCCACATATAAGTCTCTATTAAGAAGTACTCAAACATCTTTAATGAGAAAATTTTCTATTTGCCCATGCAA TTAATATCTTATATGCGTCCACTTGGAAAGACAAGGTTTCTAAACATCTAATTCGAGCCAAAATAAGATGAGCTCATAAATGTCAAGGGTTGATGATGGA GTTATGTACATAAAAGGGATATTATATAATTAATCACAAGGATAGCAAATTATCAATATAATCACAAGGATACACATTATATCAAAATAATATCTTTTAG TGAATGACAATCAGGAAGAAGTTAAACTGTGGTTCTAGCTCTGATATCATATATTAAAGTTTCATTTCAAAACTAATTGATAATGGAAAAAGTAGCCTAT CAAATATTTAAGCTATTTCTCAGACATGCAATATAAAACTTACTTTCAGAGAAACATCAATGATTACTTGCACCGATATCTTTATTTCATATATGTTTAT CTTTCTTTCTAGTATATAATATCAAATAAGGAACTCTTATATTCATCACACA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_50196; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_139345
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Probable tyrosine-protein phosphatase At1g05000 from Arabidopsis with 76.32% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019455867.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |