Ll_transcript_110524

• Id Trinity: FTRINITY_DN55428_c0_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_110524
• Sequence: ATAACCGGTAGCTTAATAATCGATTTTGACTGATATGATATAATAGCTAACTTAATAATCAATCTTGACCGGATTTTGACTGATATGATATAATGGTTAA ATTAATAATCGATTTTGATCGGTATGATACGATATGTTTTGATCAGTATGATATGTATATTATATGCATATGGGGCTAATGTTCCTGTATATCAATTGAA CCGACGATTACATAATAACATGTTCTATAAACACATTACTCATACTTTTTCCAACATATTCTTAGAATCTTCTCTCTCTCTCTTTGTAGCATAAGGCACA AAGTTGCATAAAGTGTCTTACTTTGTTTAAGTCACAGAGCCAAAGAGTCAAAACTAACCCAAGATTGAAGTCATCATGCGTGTGCAAGAAGCAGAGCAAG TTGCTCAAGAAATTGAGAACCTGGATAATAGAAGAAGGTCAACATGGCCTTTACATTGTGAGCTTTTACATACCCAGATGGAGAATTTGGATAAAACATC TTCTTTGAGAACTTCAAGTGTTGAAAACTCATGTCCTGTAAGTATTACTATTGTTTTCCTTGATCTTCTAAGTTCTATCTTTATGTTGTTTTTTTCTCAA TTTTCCATCATGTTATTCTTTTACTTTTATGAGCTACCATTATAGAAACTCTTTAAATCAAACTCAATTGTGTTGTGGATGGCATGGCAAGTGTTTTACT GTTCTCGAATGTTTTAAATTGCGGTTACGATTCTTATTGCGGTCATGGTTGTCATGGTTAAGGTAATTGTGACTGTCCTTTTGTCAAGGGGTTTGAAATT GAGTTGTGTAGCAGCTGTGAGCTAATTGTGGCCATTGCAGTTTAAATGCTTCTAATGCGATCCGCAAGCATGTTTCTGGCAGCCACCACAACCGAGATAT TGCGGCCACATCATGTGGTGACAGAGTTCCCAATTTAAAACATTGAAATTCTTTTATAATTACCTTGTTAATTTGGCATTCATTTGTTTCCTTTCTTATG TTTGCTTAGCATCTTTTATTTCTAATTCTTGATGCTTACTGCTTCTTCCATCTTAACTCGATTCCGTTTTTCGTCCGTGGCAAGTATAGCTTGAAAGCAT AAGTGAGGATACAATGATCACAGACAAGAAGCAGATCCTGGTGAGCTTTGTTCCAGCTCTTCGGTCAGGAGAGTGGTCCGATATCGGAGAACGCCCTTAC ATGGAGGATACTCACATATGCATTGGAGATTTGGCAAACAAGTTTAACAATAACATGCACTCTGAGGAAGCTGTTTCCTTTTATGGTGTAAGCCATCTAA CTGAGATGCTTAATTTCTTCTTGTATGAGTTTTGTTTAATTCTTTTGTAGCCATTTAATTTTGTACTACTGAATAGTGAGTACCAAACAAGTCTTCAAGG TTTTCTTGCATCTATTGGTGAATTACTTAAAGAAGGGCAAGAGTATTTTTGAATCACTTCAGAGTTTTCTTAAATGAATTTGGATATAGTTTTTGGTATT CACTTATTAAATGCATAAAATAGATCACAAGATTCAGTATTCAGAATGTATCCTTGTTTGAATTTTACGGTCGATATCCTGATCTATTGTCTTCTTTGTT TCCGTCCTATGTGCCCCTTTCCAAGTTGTAGTTGCATAACCATTTTAAAGTCTTACTTAACAAAATATAGGTAAAAGTAATGTCTTTTAGTTCATCCAGA ATAAAGGTGGAGAAACATGTCTTGAACATTTTGCATAGGAGGATATATACACTCTTTGATCAAGGTTTGGCATGTAAAAGTAAAAGGAAAATGGTTCAAT GTGCAGGTATTTGATGGACATGGAGGGAAGAGTGCAGCTCAATTTGTCCGTGATCATTTGCCAACGGTGATTGTTGAGGATGCAAACTTTCCTCTTGAGC TTGAAAAGGCGGTCACAAGGTCATTTTTGGTGACTGATGCAGCATTCGCAAAAAGATCATCTCTTGAGTCTTCCCTTTCTTCTGGTACAACTGCATTAAC TGCAATTATATTTGGAAGGTTAGCACTTGTCTCCAATGTTCTTTGGCCTTTATAACTTTGGGATGAACTTTCAAGCTCAAATTTATGGAGTGGCCTTCAA AATGTTCAGCTGCAAGAGTAACACACTACATTAGTACATTTAAGTGAACACAATGCCTCAAATTATCACTTTCCTTTTGTCACGCCCCAATTTTCAGTCG AACATTGGCTATGCGACTAAGGAAGAGGTTGAACTAAATTTCGACCTCTCCTAAAAGATTTGGAGTCACAATTGTAGCTAAAACATAGAAAACTCTCCAA ATCTTTTGGGAGAGGTTGAAAATGAATTTAACCTCTTCCCTAGCTGGTGTTTGACCGAAAATCGGGGTGCGACAACTTTTATGATTTATTCTTGTATCTA TCACTCTGTATCCCTTTTTTAACTGTTTTGAATGCCAATTATTTGACAGGTCCTTACTGGTAGCCAATGCTGGAGACTGTCGGGCTGTCCTGTCCCGTCG TGGAAGGGCTATAGAAATGTCCAAAGATCATAGGCCAACTTGCAGCAAAGAAAGGATGCGGATCGAGTCGCTAGGTGGGTTTGTTGATGATGGTTACCTG AATGGCCAATTAGGTGTTAGTCGCGCTATAGGTGACTGGCACCTTGATGGAATGAAGGAAACAAGTGAAAAAGGTGGACCACTGAGTGCTGAACCTGAAC TTAAATTAACTACATTGACCAAAGAAGATGAATTCTTGATAATCGGCAGCGACGGAATCTGGGATGTTTTCAGTAGCCAAAATGCTGTAGATTTTGCAAG AAGGAGGCTTCAAGAGCATAATAATGAGAAACTATGCTGCAAGGAAATAGTACATGAAGCAAAGAAGAGAGGATCAATAGATAACTTAACTGTTGTGATG GTATGTTTTAACTCAGATCCACCACCACATGTGATTGTAGAAAGAACAAGAGTCAGAAGAAGCATATCTGTTGAAGGACTTCAGAATCTTAGATGCTTGC TTGAAGAATAGAACATTTTTGTATGAAAATAAATGGTGTAGTTGATGTGTTAAAGCTGAAATTATGTACATATATTCATGTTCTTCAAGAATCAAGTGAT TATTGGCCTAGCCCAACCATGTTTAAGGTGCTAAAGATCTAAAATAATTTATATTCTTGTGATTATTTTCCCCATTGGAAGCTGATTAGAGGAGGAAAAT ATTATATTTGGGACAAAGTGATTTGTACACTGATTATTATAACATTCTACTCTTGTTTTTAATGGGTTTAAAGACCAATGTAAATGTGTTGTTTATTTGT TATGCTTTCATTTAGGTGTCTTTCAACACAGATATTTCATCTCAAAGCTATAGAAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_51319;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_110524

FPKM

• FPAB: 14.1
• FPNAB: 8.5
• LF1: 5.6
• LF2: 2.9
• LF3: 0.7
• LF4: 2.1
• UF1: 6.5
• UF2: 4
• UF3: 0.2
• UF4: 0.9

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_110524

• Blastp: Probable protein phosphatase 2C 27 from Oryza sativa with 72.56% of identity
• Blastx: Probable protein phosphatase 2C 27 from Oryza sativa with 74.74% of identity
• Eggnog: Phosphatase(COG0631)
• Kegg: Link to kegg annotations (4331028)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019417448.1)
• Pfam: Protein phosphatase 2C (PF00481.20)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;