Id Trinity | FTRINITY_DN55444_c3_g6_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_112153 |
Sequence | GGTAAGTCTATATTTAGTGGGAAGGGGGAGGTTGGGTTTAGGGTGCAACCACAACCCCACATCTTCTTTCTTTCCCTCACACTTTTATTAGTTAGACCCT TAATTCCCCAACTTGGTTTTGCTTGTTTTAGGCCAATTCAGTAGGGTTTTTTTGTGGGGCTTGAGCACCTTTTTTATTATGACCTAGTTCCCCCCATGTT CTATAGATCTCCCTGTGTTCCCACTCTCAATCCTCAATATATACCTCCTTCTCAACATCCCCTTTACTCTTACTCTCTTCTACTTTCTCCTTTTCTTACT CTTTATATCTCTCCTTCCCCACTCTATTGGGCAATTCTACTTTCATCTTACTAGGGATGAAGGAAAACAAGTATTTATATCTATGTTTCATCACCATCAT CTCTTTATCAAATTATTCATAGGTATATGAAGTGCACACTTCATGTCCTTGCATTCATTGTGTACATACATGATAGGATATATATATATATATATCTCAC TATATACCCCAAACAAACTGTCATATAGTTTCTTATGGATATTATATATGTATCTCTCTTGTTTACAGACATACACACAAATTCTATAACCTAAGGATAG GAATCAATTAGGGCCATTAAATTGTTGATCCTAATTAAATTAGTTTAGAGAAAAAACTTCACACATATGCATATATTTGGTATCATGTATCTAATAGTTA CTTACTTACATGACACATATCATTGCATACATATTTTATAAGTAAGACAGTATATTTAAGATTAAGAATAGTAAGGTTACTAAGAAATATACATCATAGT TCAAAACTGAAACATCATTACATACATAAGTTTATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGTGGAGCTCATTGAAACATCAATTGTCTCTGTATATGGCG TATGAGGAGCCAAGCATATTCCATGTATATAAATGGAGATTATAGAATTATTATATATTTATTTACATTTATATACAATTGAATATATGTCTTGTTTATT TTAAATTTCTTCTATTATACTAATTAATCATGGTTGTATGGAGAACACATATAAAGGCTATAAATATAGGGCAATTATTCATGAAAGTAATAGTACATGT CTACATTGTCATTTTCAAAGTCACAGGATGTGCTTCTGACAAAGGTACATATGTTTATCTTCCTTTTCATCATCATAAAGAAACTAACATTTTCTAGGGT TTTGTATTGAGTGATGAATAATTCAATATATGTGATTTGCAGAACATGATTAACTGGAGGAACATATTCTCTCATTTACCAGCTAGGGGCTCACATCACA TGTGTGGTTCAGTGTTCTTCATTTATTTTTCTTTCTCTTTTTCACTTTATGTTAGGCATATAATCATTACATTTCACAACACTTGAAACGAGGGAGGGCA TGGGAAAACAGCAAGAAGCCCAAGTTACGGTAAATTAGAAACTGTTGGTGCTGACAATTAACATGGAAGTTATAAAATTACTCGCTCGCCTTCTTCTTAG TCTGTCTCATGGACATTTCATAAGACCTGTGACTATAGATACCAACAATGGCCTTAAAAGAAGGAATAATGTGTCATGTACACTGTTTCAACCATTGTTT TACTCAACCACTAACAGATTTATTCCCACATACCTGTTAATGTTCCCGGCTCGAACATGATTGTCTCCAATGCGAAGATACCTAGGAGAAACCAAAAAAC CATTTATTTACTCAAGGCTGGTTATTATGTATTTTATGTTTATTACATTATAACATAGATGTAATTAGCCACATAATTATTGTCATTTCCATATTTTTCT TTCATAGTATCATTTATTAAATTCATTATATAAATAGATGTGAAATAAGATTTAGGGAAAGTTATCATTGTCATGCGGAAGTTTTTATTTATCTTATAAT TTTGGTAGAAGATTTTCTATAATTTTTGGTTTGTTTGTGAGTGTATATATTTGACTGGTATGCAATTAGTCCTATGAGATCAATGGTTTTCTTATTGGTC CAATGGAGTGTGCTATTTAATTCCTTATTTCTCATTGGAATCTCATTGATCATATGATCTACGATAATTAACACGAGCCTAAAATAAAACAACATTATGT CAAAACGGAGTTTTATAAACGTGCGAAATGACTACATTGGCCACGATTTTTTTTTGTTACAAATAGGTTTTATAATTTTTTAAACATTCCTCGAAGGATT CGGGATTATATCTTCTATAATAAAATATGTTTGTGCGATGAGAAATAAAGAGAAAAAGTGGATGAAAAAATGTGAGAAAGAGAGCAAAATGATAGAAATA GATAAGAAATAAAGTGATTATTTTATGATGTTTGATTGTATAGAAAATAGAAGAGAAGTAAATATTTTTCCCTAACTTTTCCTAGCCAATTTCTTATTAT ATGAGAGGAGGGGGGAAATTGAGTTCCAGTACATTTTTTTCACGGATTTAATATCTATACTAGAGTGATTTTTATACTACCAATGAAAGTTATACAAATT AATACTAGATAATGTGTAGTTATTATTAAAAACTTTATATTGTATAGGCTTTTTTCTATGGATATATATTAAAAGAGAAAACAAAAATTCTTCAATCTCT CTTCTCTAATTCTGTTTTTACTCTATTAAAGGAAGACTTAGTTTTTTATTAAGAAATAATTCTAAATCCTTCCAATATTTTATGACCCATCAATTCTCGT TTTTCTAGTCGACAGAAAGATAATTTAGGGAAATGTACAATGGGTCAATGACCATCGATTCTCTGACTTAAAAAACATTGAAGGTGTTATATATATTTAA AACAATGAATACATTTAAGGGATATTTTGTTAAAATATTATAATGATTAGTATTTAATGCATGAGAGGTTTAAGAGTTTAACTCATAAATTACATCGTTA AAATTTCATGATTGAAAATTGTATTTTTAAATCATTTCTTGTAAATTTAAACGTCTTATGTATCAACTGCATGAATAATGGACATAACATTAAATAGGAG TAAAATTGTTGATTCACAATGATGTTGAATATTTATTGGAAAATGATATATTTTCCTACTAAATCTTCCTACCCATAAAAATGTTACATGTGTCATAAAA TGATACTTTAGTTATTAAGAATTAATTTATAAGTGACATTTGTCACTTTTTTGTGGGTATGAGGATTAGTAGAGGATATAACATTACTCTAAACAAATAT CACTCGTCTCGAACAGTGTCCCATTTCCCGTCTCATATCAATATCAATGAGAGTGTTATATTTTATAACTTTTTATTTTTAAAATTTTTCTTTTATCCAC ATGTAAATATCTGATTGACTTGAGATATAGTACAGG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_51481; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_112153
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | gma-MIR160a (MI0001774) |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_003625624.1) |
Pfam | - |
Rfam | mir-160 (RF00247) |
GO | - |