Ll_transcript_111680

• Id Trinity: FTRINITY_DN55479_c1_g3_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_111680
• Sequence: ACAAATTTGACAGAAAAGGTGAGACCTATAATTAAACATAATTCCTCTACTTTTTGTGATTGTGCTCCACCTGGTAATATTGTTATGCACAAAAATTCCT CTATCTGTATGCAGGGAGATTTGATTTCAGGTGTAGAGATCTTGCCTCCAACAAATAATGGAGTTTGTATCCAACTTGATGATAATGCTACTAATTTTTC TACACCGGTTGAACCTATAGAAGCAGAAACAAGGTCTAAATTTTCTCTGAAGGAGAGGGAGACTATCATTCAAAAAAAGGGAGACAACAAAAATGTATTA AAAAGGTAAAACAAAAATAAGCTAGGACTGATTGGGATAATTTTTGTGTTGATCTTACAAATGTTCCTTTAATCTCTAATATGGATCAGACTTCATTGTC CTATGTGCATGAGGCTGTTGGCCAACCGGTGTCAAAGTTTTCCAATCCGGCTCTTTCTGCTGTTGTCCCCTTGGTCGTGCAACATGGTCCTTTAGTTGCT GCTCCGAGTGCTGCGAGTGTCAGTTGTGTGGCAGCCTTAGAGGTGTGGAAGTTAGGCGAAAAAATTGGTTTGTTAGGGAATGATAATGAAGATGAAATTA TTCAGAAATTGATTGCTGTGGAGGATAGAGACAATGCGAAATTCGAAGATGCTAGAAGGAGGTCAAATGGTTTTGATGATATTAATCTCCATTAATATTC GTGGTCTTGGAGGGCGGTTGAAGAAGAAGGAGATTCGCGACCTTATTCGTAAACATAAGCCTGATATGATTTGTATTCATGAAACTAAAATCCCTGATGT AGACTACTCTTTATGTTTGTCTCTGTGGGGCAGCGATAATTTTGGGTGGGCGTGCTTACCTGTAGTGGGTGCCTCGAGTGGTATTTTGACTCTCTGGAAT AAATCCCTTTTTGTTTCCTACACAGTGAGGTGCAGAACTAATTTTGTGACGGTCAACAGGAAATGGACTCTTCATGATGAGCCTGCTAATGTTATGAAAG TTTATTGTCCTTATGACCTGGCTGGTAAGCGATTTTTCTGGGTGGAGGCTATTTTAGATTATCGTGGTCATGCTGATGAGATGTGGTGTGTGGTAGGAGA TTTCAACTCTGTACTTAATCAGGAAGAAAGGGTTGGCACTAGTTCTCGGGCGAATAATTCAGAGAGTGGTGAATTTGCTCAATGTGTGGATGATATGGAA TTATTCGATCTTCCTCTTGCAGGTTCGAAATTCACTTGGTTCTTATCAAATGGTTTGGCTATGAGAAGGTTAGATCGTTTTCTTGTGAATAATAACTGGT TAATTAATTGGGGACAGATGGTTCAACAATGTCTTAATAGAACTTTTTCTGATCATTGCCTTATCCTGCTTAAAAGTGACGTGCCTGATTGGGGTCCGAC TCCTTTTAGAACAAATAACTGCTGGTTTTCTGATGATGTCTTTTATCAGTTTGTGGAAGATGAGTGGAAGTCTTTGAGTGTGGTTGGAAGGGGTTCTTTT GTTGTTAAAGAGAAGTTGAAGATTCTTAAGGGGTTTTTGAAGCGGTGGAATAGGGAGCATTTTGGTGTGCTGGATAGAAAAATTTATGATCAAGTGGCTA TTATCAACCTCATTGATGGTAAAGGCAGTTCTGGTGCTCTTTCTAATGAATATATCTCTACTAGGAATATGGCCACTGCTTATCTTTGGAGGTTCGCGAG TCAAAATGGTAATTTATTACTTCAGAAATCGAGACAGAGATGGCTTCAGGATGGGGATTCAGATTCTAAATTCTTCCATGCAACAATTAACAGGAGGAGA AAGTCTAATGCTTTACTTGGTATGTATATTGATGGTGTATGGGTGGATAATCCTTCCTTGGTTAAAGACTATATCCGCTCTTTTTTTCAGGATCTTTTCT CTGAGTCTAACTGGAATAGACCGACTCTTGATGGTATTGATTTCAAGAGTATCTCTAATGCTGATAATAGTTTCCTCACGTTGAAGTTTGAGGAGGAGGA TATCAGAGAAGCTGTTTGGAGTTGCGATGGCGATAAAAGTCCATGGCATGATGGGTATAATTTCTGTTTTATTAAAAAGTTATGGAATTGCGTGAAATCA AATATTCTTGCTTTGGTGGATGATTTCTACACTTATGGTAATCTTGTTAGAGGTTGCAATGCATCTTTTATTGTGCTGATTCCGAAGAACGACTGTCCAC AAGGCCTTGATGAGTATAGGCCGATATCTCTTATTGGTTGTCTTCGGAAAATTATTTCTAAACTTCTTGCTGGCAGAATAAAGAAGGTTATCCACACGGT CATTTCTGATTGTCAGATTGCCTTCATTAAGGGTCGTTACATTATGGATGGAATTGTAATTGCTAACGAGATCATTGATCAGGCAAGGAAAAAGAAGGAT CAGAACTGTTTTATTTTTAAGGTGGATTTTGAAAAGGCGTACGATTCGATGAACTGGAGTTTTCTGCTCTACATGATGGAAAGAATGGGTTTCAGGGCCA CTTGGAGAAATTGGATAAAGAACTGCCTTCAATCAAACTCTATTTCGGTTTTGATTAATGGGAGTCCTTTTATGGAATTTAATATGTCTCGTGGTTTGAG GCAAGGTGACCCAGTGGCTCCTTTTCTTTTCCTTATAGTTGGTGAGGGCCTTGATGGTATTATGAGATCTGTTGTGTCTAAACAGATTTTCAAGGGTTAT TCAGTTGGTAAAGATAAAGTTGTTATCTCTCATCTCCAGTATGCAGATGATACTCTCCTTATTGGGGAGGAATCGGTTGATAATGTTTTGGCTCTTAAAT ATATTCTTAAGTGCTTTGAGTTGGCTTCTGGTTTGCGCATTAACTTTCACAAGAGTAGCTTCATTGATGTTAAACGAAGAGGTGGGTTTGTTCAGATGGC GGTGAATAAGTTGTTTTGTTATGTTGGTGCAATTCCGTTTAAGTTCTTGGGTATCCCAGTTGGTGCTAATCCAAGGAGGATTTCTACTTGATCCCCCTGT TATTGAGTCTTTCAAAAAAAAGCTTTCCTTGTGGCAACAAAAGTTGCTTTCCTTTGGTGGTCAAGTAACCCTCATTAAGTCAGTTTTGTGCTCTCTCCCT ATCTACTTTTTCTCCTTTTTCAAGGCTCCTTCTTCAGTTATCCATGCTCTTAATAAAATTCAAAGAAGGTTTCTCTGGGGTAGGGGTGAGGTAAGTAGAG GTATTAGTTGGGTTAATTCGAAGAGGGTGTGTCAGTCAAAGGAGGTTGGGGGTCTTGTGATTAAAAACTTGAGGGTTTTTAATTTATCTTTATTGGGTAA GTGGCGTTGACAGTTGCTTTTGGAGAGTGAGTCTTTATGGGTGAGGGTGTTTCGTTCTAAGTATGGTGCAGGAAGGGTTGGGGTAGAGGGTGGTTTGTTG GGTTTGGAGGGTTTCCGGAAGGGGTCTGTGTGGTGGCGAGATTTAGGTGGTCTTAGTGATAGTGAGTCTGGGGTTCACATTGGGTGGTTTAATGATGGTG TTCGTAGGAAAGTGGGAAATGATAACTAAGTTGTGTTTTAAAGGGACCCTTGGGTTGGAGAGGTTTGTCTTAAAAACAGATTCCCGATATTATTTCAGGT TGCGCTGGACAGAGATGCTAGTATCAACTCCATGGGCGAATGGAGGTGCGGAATATGGTGTTGGTCACTCCAATGGCGGAGGAACCTGTTTGACTGGGAA CAAAAGGATGATGATGATCTGATGATTTGTTTAGAGGAGGTGAACCTGGTCTTAGATTCTGATGATGGCTGGCTTTGGGTTCATGATAAAGGTGGGGCAT ACTCCGTAAAAAATGTCTATAAAGTAATCCTTAATGAGGTCCCAGATTTAGATATTGTGTTTTATAGAAAGCTTTGGTCTTGTAATGTTCCATCCAAATT AAGATGTCTTATGTGGAGATTGTCCTTGGATTGGGTGGCAACTTTATCCAATCTTGCTAGACGTGGTGTGCTGGGTGGTAACGAGCAAACAAGTTGTGTT TTTTTGCGGTTGGATGGATGAATCAGTGGATCACCTCTTTTGTTCTTGCCCTTGGATTTATAGTATTTGGCAACAATTGTATTCCTGGTTCGGCTTGTGT TCAGTTCTCCCTTTCGGTGTCAAGAATAGCTTCTATTATCATTGGAGTCTGAGGCCTTTAGATAAAAAGATTCACCAACAGTGGATATCTCTCTAGTTTG TGTGCATCTGGTCTATTTGGTTGACGAGAAATAACGTGATTTTTGAGCAGTGTCTTTTGACTAGAGAAGATGTAATGTTCTCGATTAAGCTCCATTCTTG GAACCTTCTTAAGGCTCGCTTCTCTTCTTTTTCTTACTCTTTTATGGATT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_51762;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_111680

FPKM

• FPAB: 1.6
• FPNAB: 0.7
• LF1: 1.9
• LF2: 1.8
• LF3: 1.3
• LF4: 0.3
• UF1: 2
• UF2: 2.2
• UF3: 0.6
• UF4: 0.6

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_111680

• Blastp: LINE-1 reverse transcriptase homolog from Nycticebus with 24.04% of identity
• Blastx: LINE-1 reverse transcriptase homolog from Nycticebus with 24.04% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019429814.1)
• Pfam: Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family (PF03372.22)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;