| Id Trinity | FTRINITY_DN55479_c1_g3_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_111684 |
| Sequence | ACAAATTTGACAGAAAAGGTGAGACCTATAATTAAACATAATTCCTCTACTTTTTGTGATTGTGCTCCACCTGGTAATATTGTTATGCACAAAAATTCCT CTATCTGTATGCAGGGAGATTTGATTTCAGGTGTAGAGATCTTGCCTCCAACAAATAATGGAGTTTGTATCCAACTTGATGATAATGCTACTAATTTTTC TACACCGGTTGAACCTATAGAAGCAGAAACAAGGTCTAAATTTTCTCTGAAGGAGAGGGAGACTATCATTCAAAAAAAGGGAGACAACAAAAATGTATTA AAAAGACTTCATTGTCCTATGTGCATGAGGCTGTTGGCCAACCGGTGTCAAAGTTTTCCAATCCGGCTCTTTCTGCTGTTGTCCCCTTGGTCGTGCAACA TGGTCCTTTAGTTGCTGCTCCGAGTGCTGCGAGTGTCAGTTGTGTGGCAGCCTTAGAGGTGTGGAAGTTAGGCGAAAAAATTGGTTTGTTAGGGAATGAT AATGAAGATGAAATTATTCAGAAATTGATTGCTGTGGAGGATAGAGACAATGCGAAATTCGAAGATGCTAGAAGGAGGTCAAATGGTTTTGATGATATTA ATCTCCATTAATATTCGTGGTCTTGGAGGGCGGTTGAAGAAGAAGGAGATTCGCGACCTTATTCGTAAACATAAGCCTGATATGATTTGTATTCATGAAA CTAAAATCCCTGATGTAGACTACTCTTTATGTTTGTCTCTGTGGGGCAGCGATAATTTTGGGTGGGCGTGCTTACCTGTAGTGGGTGCCTCGAGTGGTAT TTTGACTCTCTGGAATAAATCCCTTTTTGTTTCCTACACAGTGAGGTGCAGAACTAATTTTGTGACGGTCAACAGGAAATGGACTCTTCATGATGAGCCT GCTAATGTTATGAAAGTTTATTGTCCTTATGACCTGGCTGGTAAGCGATTTTTCTGGGTGGAGGCTATTTTAGATTATCGTGGTCATGCTGATGAGATGT GGTGTGTGGTAGGAGATTTCAACTCTGTACTTAATCAGGAAGAAAGGGTTGGCACTAGTTCTCGGGCGAATAATTCAGAGAGTGGTGAATTTGCTCAATG TGTGGATGATATGGAATTATTCGATCTTCCTCTTGCAGGTTCGAAATTCACTTGGTTCTTATCAAATGGTTTGGCTATGAGAAGGTTAGATCGTTTTCTT GTGAATAATAACTGGTTAATTAATTGGGGACAGATGGTTCAACAATGTCTTAATAGAACTTTTTCTGATCATTGCCTTATCCTGCTTAAAAGTGACGTGC CTGATTGGGGTCCGACTCCTTTTAGAACAAATAACTGCTGGTTTTCTGATGATGTCTTTTATCAGTTTGTGGAAGATGAGTGGAAGTCTTTGAGTGTGGT TGGAAGGGGTTCTTTTGTTGTTAAAGAGAAGTTGAAGATTCTTAAGGGGTTTTTGAAGCGGTGGAATAGGGAGCATTTTGGTGTGCTGGATAGAAAAATT TATGATCAAGTGGCTATTATCAACCTCATTGATGGTAAAGGCAGTTCTGGTGCTCTTTCTAATGAATATATCTCTACTAGGAATATGGCCACTGCTTATC TTTGGAGGTTCGCGAGTCAAAATGGTAATTTATTACTTCAGAAATCGAGACAGAGATGGCTTCAGGATGGGGATTCAGATTCTAAATTCTTCCATGCAAC AATTAACAGGAGGAGAAAGTCTAATGCTTTACTTGGTATGTATATTGATGGTGTATGGGTGGATAATCCTTCCTTGGTTAAAGACTATATCCGCTCTTTT TTTCAGGATCTTTTCTCTGAGTCTAACTGGAATAGACCGACTCTTGATGGTATTGATTTCAAGAGTATCTCTAATGCTGATAATAGTTTCCTCACGTTGA AGTTTGAGGAGGAGGATATCAGAGAAGCTGTTTGGAGTTGCGATGGCGATAAAAGTCCATGGCATGATGGGTATAATTTCTGTTTTATTAAAAAGTTATG GAATTGCGTGAAATCAAATATTCTTGCTTTGGTGGATGATTTCTACACTTATGGTAATCTTGTTAGAGGTTGCAATGCATCTTTTATTGTGCTGATTCCG AAGAACGACTGTCCACAAGGCCTTGATGAGTATAGGCCGATATCTCTTATTGGTTGTCTTCGGAAAATTATTTCTAAACTTCTTGCTGGCAGAATAAAGA AGGTTATCCACACGGTCATTTCTGATTGTCAGATTGCCTTCATTAAGGGTCGTTACATTATGGATGGAATTGTAATTGCTAACGAGATCATTGATCAGGC AAGGAAAAAGAAGGATCAGAACTGTTTTATTTTTAAGGTGGATTTTGAAAAGGCGTACGATTCGATGAACTGGAGTTTTCTGCTCTACATGATGGAAAGA ATGGGTTTCAGGGCCACTTGGAGAAATTGGATAAAGAACTGCCTTCAATCAAACTCTATTTCGGTTTTGATTAATGGGAGTCCTTTTATGGAATTTAATA TGTCTCGTGGTTTGAGGCAAGGTGACCCAGTGGCTCCTTTTCTTTTCCTTATAGTTGGTGAGGGCCTTGATGGTATTATGAGATCTGTTGTGTCTAAACA GATTTTCAAGGGTTATTCAGTTGGTAAAGATAAAGTTGTTATCTCTCATCTCCAGTATGCAGATGATACTCTCCTTATTGGGGAGGAATCGGTTGATAAT GTTTTGGCTCTTAAATATATTCTTAAGTGCTTTGAGTTGGCTTCTGGTTTGCGCATTAACTTTCACAAGAGTAGCTTCATTGATGTTAAACGAAGAGGTG GGTTTGTTCAGATGGCGGTGAATAAGTTGTTTTGTTATGTTGGTGCAATTCCGTTTAAGTTCTTGGGTATCCCAGTTGGTGCTAATCCAAGGAGGATTTC TACTTGATCCCCCTGTTATTGAGTCTTTCAAAAAAAAGCTTTCCTTGTGGCAACAAAAGTTGCTTTCCTTTGGTGGTCAAGTAACCCTCATTAAGTCAGT TTTGTGCTCTCTCCCTATCTACTTTTTCTCCTTTTTCAAGGCTCCTTCTTCAGTTATCCATGCTCTTAATAAAATTCAAAGAAGGTTTCTCTGGGGTAGG GGTGAGGTAAGTAGAGGTATTAGTTGGGTTAATTCGAAGAGGGTGTGTCAGTCAAAGGAGGTTGGGGGTCTTGTGATTAAAAACTTGAGGGTTTTTAATT TATCTTTATTGGGTAAGTGGCGTTGACAGTTGCTTTTGGAGAGTGAGTCTTTATGGGTGAGGGTGTTTCGTTCTAAGTATGGTGCAGGAAGGGTTGGGGT AGAGGGTGGTTTGTTGGGTTTGGAGGGTTTCCGGAAGGGGTCTGTGTGGTGGCGAGATTTAGGTGGTCTTAGTGATAGTGAGTCTGGGGTTCACATTGGG TGGTTTAATGATGGTGTTCGTAGGAAAGTGGGAAATGATAACTAAGTTGTGTTTTAAAGGGACCCTTGGGTTGGAGAGGTTTGTCTTAAAAACAGATTCC CGATATTATTTCAGGTTGCGCTGGACAGAGATGCTAGTATCAACTCCATGGGCGAATGGAGGTGCGGAATATGGTGTTGGTCACTCCAATGGCGGAGGAA CCTGTTTGACTGGGAACAAAAGGATGATGATGATCTGATGATTTGTTTAGAGGAGGTGAACCTGGTCTTAGATTCTGATGATGGCTGGCTTTGGGTTCAT GATAAAGGTGGGGCATACTCCGTAAAAAATGTCTATAAAGTAATCCTTAATGAGGTCCCAGATTTAGATATTGTGTTTTATAGAAAGCTTTGGTCTTGTA ATGTTCCATCCAAATTAAGATGTCTTATGTGGAGATTGTCCTTGGATTGGGTGGCAACTTTATCCAATCTTGCTAGACGTGGTGTGCTGGGTGGTAACGA GCAAACAAGTTGTGTTTTTTTGCGGTTGGATGGATGAATCAGTGGATCACCTCTTTTGTTCTTGCCCTTGGATTTATAGTATTTGGCAACAATTGTATTC CTGGTTCGGCTTGTGTTCAGTTCTCCCTTTCGGTGTCAAGAATAGCTTCTATTATCATTGGAGTCTGAGGCCTTTAGATAAAAAGATTCACCAACAGTGG ATATCTCTCTAGTTTGTGTGCATCTGGTCTATTTGGTTGACGAGAAATAACGTGATTTTTGAGCAGTGTCTTTTGACTAGAGAAGATGTAATGTTCTCGA TTAAGCTCCATTCTTGGAACCTTCTTAAGGCTCGCTTCTCTTCTTTTTCTTACTCTTTTATGGATT BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_51762; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_111684
| Blastp | LINE-1 reverse transcriptase homolog from Nycticebus with 24.04% of identity |
|---|---|
| Blastx | LINE-1 reverse transcriptase homolog from Nycticebus with 24.04% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019429814.1) |
| Pfam | Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family (PF03372.22) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |