Id Trinity | FTRINITY_DN55511_c1_g2_i2 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_74929 |
Sequence | CATAGCGTGAGGTTTGAGTTTAGTTTACTTCACTTTCCCCCATTCTCTCTTCGAGATTGAATGCAGAGAGAGCGAGAGAGCGTGTGTGTGTGTTGATTTT CTCATCGCGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGCTGCTGCGTCGGCGCGTATTGAAGGGTGCGGTGGTTGCCGGCGGCGAATTGGATCC CGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGGCCGCTGTGGTTTTTCCGGCGACATATGTTTTCTCCGACTTTCTACAACCAGTAAATATTTGAGCCTTTTTTATTC CTGTTAATTAGATCCGATATAATATTTTTTAAGATTTACCAGTTTAATGGCTATATGTAGAAACTGCAATTAATGGTTATAGATCCTACTGCATAAATAG TATCTGAATCTAACAAAAAATAGAATAAAAGCGTTACAAAATAATAATAAAACATTTATGGTTAACTTTATAACAGGCTTTCCTTATTCAGATTTGGTTT TGTTATACTTGCTTTTTTTTCATGGATTTGAATTTTGAACTGAAAAATGTATTCAAGCCAAAGTATTCATGGATTGCCATGAAATTAATATTTATTATTG ATGAAGATCCCTCAAAAAATAAATTCTAGTCAAAAGAAGAGATATTCGGAACTTTTATGATGATTGGGTAAAATTAGACAGCATTCTACGGTCTAAGTCT TTAATGGGTTGCTTGTGCTTAATCTAGTTTGTGATACTTTCAGATTGTTTGACTTTGTTTTTAGAACAGAAGGCTTATTTGTGAAGCAATTACAGATGAG TTGTACAGGGTATTTAGCAGTGTAATTTAACTCTGTCAGTGTAATTAGCATTCAAAACTAGAATACCCAAGTTGAGGATGATTTCTTACTAGCTGAGTTG AATCAAATCCAATTGATCTTGATTGTTTCTGTTTACTTTGGGATTTATTTCAAACTTTGATGCATAAAGCACTGAGAAGTAATGCTTATTATTATTTTCT TTCTAAATTCAAATGAAGTCACGTGACATTTGAATACTCAGTGGAATTGGATCCTCATGTTTTTTTCTTATCGAAGAGAAAAGAATAATTAACTATAGCA AGACCTATTATTATTTCTGTGAAGTGAATAAAATTTGATTGTCTCTTAAGAAACGTGAGAGAATCCAAATTCTGCTCTAGCTTAAGAAGAATATACAGTT ACAGTGTTAAATGTCAGTTATTTGCTTCACATTATGGGTTTATGATATGTATTCCATGCTGATGGTATACTCTATTGAACTTGGTTCTATCATTGTATAA GAATGATCTGTTCTCCAGTTTTTAATGTGTGGTCAAATTAGATTCTGTGTTATTGTTAATATAATATGGACTCTGAGGAACCCTTGCTCATAACTGGAAA ATGCTTATCATTTTCTATGATGGGAGGGGTTTCTACTTTCAAGGACACCCTTTAACTGCTTATTATTTTACTGCTCAAGGATGTGAACTGAAAGTCTTTG AGTTCCTTTTTTGTCTGTCTTGCCATTTATGCTGCATTAATGATTGTTTGTATTTTCATGATCATAATTTTTTTCCTAAACACACTGCAAATTTGTACAT GTATTTTATAAAGGTATGCACTTTGTGCCTAGTAAGTTCGCAGTAAGTAACTAATTATAGATGCCAAGTTATCAAATCTGAAAAATGATGGTTTGTAATT CACATTATTAGAGCTCTGACCAATCTTAGAATGACTGATTTTCTTATTTGGTATCATTAGCATTCTAGTACTTTGTGTTTTAAATATGTTTCTGATTGAA ACTCAAAAACTCAATTGCTTGGACACATCAATTTCTGAACAATGGCTTGTTTCCTTTTGTATATTAGGTGCTTATTCTCTGTAAGTGTACTTTTCTGTGT TTTTCATATTACTCAGAGAACGAGTTCATGGTCTTGAGCAGGCCTGACTATTTATATGCAAGAATGATGTTTCCCTGGTCGTAGAGATAAGCTGATTGTG AAAATACTAAATTGCCTTTTCTACTTCTACATAATAATATAGGTTTTATCCTTCCAAAAATTTCCACTCTCTTGTTACTGGCATGCATTCTAGAGCAAAC TGGTCCCTCCTGGTGTTCAGAGGGAAAATAATATGATTTATTCATTAGGAATAATCCTTAGTTACTTAATTAATCCAGGCTTGGTGCTACTCTGAGTTTT TTTTTGGTATTGGCAAATTTGAGAAATTGATGAAGTCTCTGTACTAAGGACTCAACCGGCAAAAGTTGTCTTGAGAACATTTATCGTCTCAAATGTAAAT TGTAGAGCTAGTTTTGTGGAATAATGGTATTTCTTTCTGACTCTGTTCCCTCTTCTGGTGATTCTGGCTATCACTTTTGATACTCAGGCAGAGGTTACTT AAATTTTAACCATATACTATTTGAAATATCTTCTATAAACCCATATTTCCTTGTCTTGAGGTTCCCAGTTCCCACCCATCCCGAGGGTTTGGTTTTTATG ATGAATTTTTGTATCCTGTTTTGTTTTCTTGGGTTTATTCAAACCTTTTTGATGGGGCCTGAGTGCATCATTGAACTCTGATATCTTGGGTTGCTATGCA TCTATTTTATAAGAATGCTAATTAATTTATCAGGGTTTGGATTAATAATGTTTACTTTGCTTATGAAGAGGAAAACTTGCATCTAATAAAGTTGGACTCA GACATGCAGCAAAACGATTTTGTAATTTTGTTCCATCTTTTGAATACAAGACATATACAGTAAGCATATCCTTAATTGTTTGAGAAATTAGTAATCTCAT GGAATTCATTGGGTACAATACACGAAGACACGCATTGAAAGGAGGATTGGAGAGGAAGGGAATCTTACATTTTGAAGGGTGGACATTTTCATATGGTATG TCTTTGTCAAACCTTCTCATCGCAGTGGTCTAGTCAGGGTATATATTCTTTGTTGCTAAGTTCTGCTATTGTTGTTTTTAGCTTTGGTTTTGTATATAAT GTGTACGTATGTAAACAAATGTAATTCGGAGACTTGTAATTAATTTTCTAGCCTTATTATATACACAAATTCTTTT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_52077; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_74929
Blastp | - |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | vun-MIR168 (MI0019571) |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_004507276.2) |
Pfam | - |
Rfam | MIR168 (RF00677) |
GO | - |