| Id Trinity | FTRINITY_DN55532_c1_g1_i9 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_76601 |
| Sequence | GTATGATTCCAGAAAAGAGTTTATTGTTCAAATTTGTTATCTTTTTTCATTTGGGGTTTTGGATTTATATGAATCAGGATGATGAGTGATTACAAGGTGG AGATGATTGATGATGGAATGCAAGAATTCTTTGTTGAATTTCATGGCCCAAAAGACAGTAATATATTATTTTACTTCTTTTCAGCTATTAGAACATAATT TATGGTATTGTATTATGACGTCGTTCGCTCCATGTAGCCGACTCATCTGCCTTGATTGTTGTTTTTAGTTATTTGACAAGTTATATTGTACTTTTTTTTC CTTTGTTTGTATTGAATGTTCTTCTGTATTTGTGTGAGTTCAATGTGTTGTGTTGTGCTTGGATTAGCTGATAACAGCTGTTGCTGACCTTGGATTATGC TAGTCCAATGTGGTCATGTACTTCTGGTTTGACGTCGTTCGCTCCATTCGCTCCATTTAAGGCTTGATTGTTGTTTTTAGTTATTTGACAAGTTATATTG TTCTTTTTTTCCTTTGTTTGTATTGAATGTTCTTCTGGATTTGTGTGAATTCAATGTGTTGTTGTGCCTGGATCAGCTGATAACAGTTGTTGCTGACCTT CGATTATGCTAGTCTGGTGTGGTCATGTACTTGTGGTTTGATGTTGCAGCTTAATTGTTTGCCTTTTTTCCTCATTGAAGATTAATTGCATTAGGATCTA TGCCTGGTTAACTTTAAAGGTGGAAAATGAACTGCTTTTTCCGTATCTTATTTTTTTAGTTTCGTCTTGCTTTTCTTGGAATCATGTGCAGGCCTTTATG AAGATGGTGTGTGGAAGATAAGAGTGGAGTTACCTGATGGTTATCCTTATAAGTCTCCATCTATTGGTTTTGTCAACAAAATTTACCACCCTAATGTTGA TGAAGTCTCTGGATCAGTTTGCTTGGATGTTATTAACCAGACCTGGAGTCCCATGTTTGACCTTGTTAATGTGTTCGAAGTGTTTCTTCCTCAACTTCTT CTGTACCCGAACGCATCAGATCCATTAAATGACGATGCTGCTGCCTTGATGATGCAAGATTCTGCTGCGTATGAACAAAGAGTCAAAGGTAGTGATCCTT CTCTAGTTTCTTCTGTACCTTTGACTAGAATGCTTCTAGTCAAAGGTAGAGGGTTTCTTCTTTGCTGTTGATTGTTAACTATGGTTGTTTCCATCAAATA TAAATTGGAGTGTGATATCAATAGGTTTGTATAAAGCTTTAAAGGTTCTAGGTTGTGCAGCTGCAAAATGATTTGTGTTACATACCATGTGCATCTTCCA AATAATGAACAAAATTTTTGTTAGATAAAGATTCTTTTTTCTTCTTCGATGGACCCTAGCTGAAGCCACTCCTGAAACCAACACAAAATCAAATGTCTAA TGTCCTCACTTCCATGTTAGCCGCCATACCCTTGTCCAAGTTTAATGTGCTAGTTAGGTTAGGATTCATGTTTGGAGCTTTAACATTATTCTTTCTTTTT GGGCCTTAACATATAAAATAAAAAAGTTAGAGTTTCTTAGTTCGGGGTTAATGCAAGTCATATTCAATTTACTGTGAAATAAAGATACTCTGCTAATCCT TCCTTTGAGTCTTATAATCCACATCACAATGATTTCAATTTGCCTAGAAAATGGACAGCTTATTTTTTTTGGATCCTGGCATGGTTCAGAGGCAATGCAC CCAAGATACCAACAGCACAATTTAATTGGTCATGTTTTTGCCATTCATGAAATTTTGTAGCTTCTAATTTTTCTGGTACGCAGTGTTGGTAAACGGGTGC TAATCATCTCCTTATTTCCCGCTTGTTCTCAGTCATTGTTGTCATCCTACTTTCAAGGCTTGTTGTTTCCTCTTAATATTGTCAGAAATATGCAAAGGCA GAAGATATTGGAGCTACAAAGGAGGAAAGTTCTAGTGAGGAAGAGGTGAGTGAAGAAGATTACTCCTCTAGTGATGATGATGCCATTGCAGGAAAACCTG ATCCTTAGATTTTTACATAAAATGCATGCATGCATTGTTTACTATCTTGCTTGTACATGCTATAATATGATATCCATTATTGGAATATGAAGTGACACAA ATTCTGAAGGATCAAAACAATAGTTTTCACCTTTCTATATTCCATGGTATTGGTAATTGGTATGGCTGTGTACATTCAATTTTTTATGTATCTCTCAGAT ATTTTTCCTTGTGACCTTAAACTAGGATATCCATATCCTTATCAGACATATCACATGTCTCTTGATGTACGAAGATAAGTTATCTCTTCCGATTACTAAA ATCATG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_52238; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_76601
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Ubiquitin-conjugating enzyme E2 4 from Arabidopsis with 85.71% of identity |
| Eggnog | ubiquitin-conjugating enzyme(ENOG410XRC5) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT5G41340) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019422661.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |