| Id Trinity | FTRINITY_DN55609_c0_g1_i9 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_125214 |
| Sequence | GAAAAATGATTTTTTTTTTTTTTTTGAAGAAACATAAGGTAAGGCTTTGCTCATGGAAGTAAAACTGCAACCGCCTTTAGCTGCATAATTGATAACATCG ATCAACTTCATCTCTCTCTCTCTGATTCTTCTGCAATGGATTTCATTCCCTTTCACGATGGCAACATACATAGTTTTCTTCACTCCCGTTACCTTCACAC TCGCTATGATGTTAATCACAGTTTGCAGACACACTCTTCGTTGATTCGGAGGCTTTCTCAAGAGCGAGAGTTAGAGGTTGGGGCATCTTGGTTGTGTTAA TGCGGTGGCTTGGAATTCCAAAGGTTCATTGTTGATATCTGGATCAGATGACACACGTATCAATATTTGGAACTATTCTGACCGAAAACTCTTGCATTCA ATTGACACCGGACATTCTGCTAACATATTCTGTACTAAGTTTGTACCAGAAACTTCTGATGAGCTTGTGGTCTCTGGAGCTGGAGATGCTGAAGTCCGCT TATTTAATTTGTCTTGCTTAAATGGGAGAGGACCAGGCAATAATGCCATTGTTCCATCAGCTCTTTACCAATGCCATACTAGAAGAGTAAAGAAATTGGC TGTTGAAAATGGAAACCCCAATGTGGTATGGAGTGCTAGTGAAGATGGGACCCTGAGACAGCATGATTTTCGAGAAGGTACATCTTGTCCTCCAGCGGGA TCTTCACACCAAGAGTGTCGAAATGTTCTAGTAAGTGGTTTAATTCAGTTTTAGTCATTCTTACTTATCAGTTTTAATTCAAATGAAACTTCTCTGCCAT GTGGACAAGTCCTAACCTGTGCATGTGTATAAAGATGAAAAAAACTTTAGTTGGTTTTGATGTAGATTGGTTTATTTTCTATATTAAAGCTGCAGCGGCA TCTTGTAGATTAGTTAACCCTTCTCTATTCTATTGAAGAATAAATTTGCCTTGATTGATGATTTCTTGTCATATGTCAATTATAATCCTTTCTGAAGTTA GTATGAAAGGCTGGAGGAATATACTGGAACCTGCTCTAATATAGCGTTGGATGCAATCTTGTGATAAAATATTATACCCTTTATAAAAATGTTTTCTTTT TCTTATCTATTATGCATTTTCTTAATTTTTATCTGCTTATTCATCTAGCGATGATCAGTATCCAATGTGTTTTTGCTCTACTGATATTTTCTCCTAATAT TTTGCACATGAGAAACCAATATGACTAAGGCATGTCAAGGGAAATCAACATCGAGAACTTCGTAAGCAACTTTATGCTTGAGATTATAGGTTGTGTTTTA GATCTCATGATGCTATACTGTTGCCTGGTCTTGATATTGTGGAAAGTAAATGCCTTTGATACAGAAGATAGTTAGGATGTTAACAATCTTTCAATAATGT AGTTCTTGTGGTTTTTCACTGAAAGTTAGTCAGGAAAACTATGAAGTATGAACTATGTCAGGAATCAACTTCCTAAAAGCTTAAAGCTACTGGGTGAAGA AGGCACATGAATGATTTTATATATCTAACAGACTGTGACATTGTTTTCAAAAGCTGAAATCCTTGGTATTTTAAATTATTGATTTTCATGCTTAATGCTT GATATCAGCTTGACCTACGGAGTGGAGCTAAGAGGTCACTTGCTGATCCTCCTAAACAAGTCCTTGCTCTAAAATCCTGTGATATTAGTACAACTAGACC ACATTTGCTCCTTGTTGGTGGGAGTGATGCCTTTGCACGTTTATATGATAGGAGGATGCTACCGCCTCTAAGCTCCTGTCGGAAAAGAATGTCACCACCC CCTTGTGTTAATTATTTCTGTCCGATGCATCTTTCTGATCGTGTCAGTCCTCTGCTTTACTGATCTTCCATTATCTGTTTTTCCAGTGTTTATATTCCAT CATTTGCGTCATCTGTTTAATGTTGGGAATATTACAAGTCTTCTCTCTTTTTTCGGTAAAAATAATTCTTTGATAGGGGAAAGGGACACAAATCACAATT CAATAGGATAAGGAAACCTTGCAAAACAGAAAGAAAAATTGGATATGTTGGCAGCTATAATAAACTTTACTCTGGTATTATATGTATTTTATTTGGAGGG GTGTTAGGGTATATAGTCCTTTTCTCTTAACTCCTTTCTTTCCCGTCTCTGATAAAAGCTTTTTATTTTTTATGTATGCAAAAATTCATATCTTTCTGTT ATTTTTTGTTTAGAGATGTTGCCATTGTGACTGTGGAAGTGGCAGCCATGGACAGAGTAGTGATTTTGTTGTTGAATTCCTATCAGTAGTTTTAGTTAAA TGATTTAAACCTGAATGGCCTATTATAAGATTTGGTTTCTGCAGCCAACTCCACCTACTGGGAAAAGGCTTCGATTGTTGTTGGTTTTTGAAAAAGAACT CTAGCAGCATAGAATCTCAATATTACATGATGCCGTGTAAAGAGACTGCACAATGCTGGACATAAGAGAAGAGAGAGAATCAAGTGAGAAAAGGAGAAAA ATCTGCAACTGAATTGTGCATTGAATAATCTGAGTTTGTTCTCAGTCTGTTTTATATTTATACAACACTGTTAAGAAGTTATAACAGCTGGCAGTGCTTA CTGTCAGTAACCACCTGCTAACAACTTTCTGGGGTTAAACTTGATGGTGGGGTGCAGGGAATGCACAATAGGCGCAGAGAGTTAATTATTCAAACCTAAT GCTTACTCTAATATGCTGCAATCAGACATCTCATTGGTAATAAATGCATACCTCTGATGAATGCCTAAACCAAACCCAAGTGGTTGGTGATAAAAATCTT TCATTCTTCATATTGATGTCGTGTAGGTTACCATGTTCTCTCTTCCACTATCCTCATAGGCATATTATGTGCGTTTAAGGCTTTCTGGTACTTTAAGCCA AATACTGTTGCACTCAAATTGTGTATTGTTTCTTCCAGGGACATCCAAACGTGCACTTAACTCATGTTGCATTCAGTCCTGATGGATATGAGGTTCTCCT TAGCTATAGTGGGGAGCATGTTTACTTGATGGATGTAAATCATGCTGGAGTGAATGAGATGCAATATACTTCAGGAGATGTTTCAAAGCTAATGACTTAC TCTCCAACAACTGATAGGATCAAATTGCAGCCTTTTGTCTCTAATGCCTTCCCAAATGGTTTTCCTATTAAAAAGAACATTGCTGAAAAGCTTGACATGT GCAAGAAGCTATTAAAATTTGCTAAGAAGTCATTGAACAAGGGGACGACATCCCATTATGGAATAGAGGCTTGTAATGAAGTTTTGAATGGCCAGAGTCA TGTTGTCGGGCCTGCGCTAAAATATGAATGCCTGTGTATTCGTGCTGCATTATTACTTCAGAGGAAGTGGAAAAATGATGCTTATATGGCCATAAGAGAC TGTTATGCTGCTAGGAAAATTGATAATTCCTCATATAAACCACTTTACTACATGTCAGAAGCATTGTCACAGTTGCATAGACACAAAGAAGCTTTAGATT TTGCTGTTGCTTCCCATATATTGGCACCATCCATATCTGAAGTTTCAGAAAGAGTAGAGAATGTGAAGAAGGATATAGCTTCAGCTGAATTTGAGAAGAG TATTAAGGCAAACCATGGATCATCAATGTTTCATACTCGAGGTGGAAGAATATTATCATTGAATGACATGCTGTATCGTTCAGAAGCTAATAGTGATGCT TCACAAGATGGTCCAATATCAGAGAGGGATGATTCTGATTACGATGAAGAATTGGAGTTGGACTTCGAAACATCCATATCTGGTGATGAGGGACATGATG ATGAATCCAATATTCTTCATGGGAGTTTAAATCTTAGAATTCATCAGAGAGATGACTCCGGAGAAAATGCTAGTGCAAATGGCTTGTGTGAATCACCCTC ATCTTCCTCACAGAACAATGGAGCTTGTTATCAGGCTGAAGCAGTTGTTGATATGAGGCAGAGATTTGTTGGCCACTGCAATGTTGGAACTGATATAAAG CAAGCCAGTTTTCTTGGTCAAAGAGGTATGCTAGTTCATTAGTCACTTAATAAATCTGAGAATCAACTGAAGGAAGTTAGAATTTTTATCAGATGAATAC CAGGTGAATATGTTGCCAGTGGAAGTGATGACGGTAGATGGTTTATTTGGGAAAAGAAGACTGGTAGGCTCATAAAAATGCTGAATGGTGATGAATCCG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_52915; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_125214
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | WD and tetratricopeptide repeats protein 1 from Mus with 41.79% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019438517.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |