| Id Trinity | FTRINITY_DN55669_c6_g1_i15 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_126658 |
| Sequence | CCAATCCTTGAACCCTAGACCAGACCGGGACCTCATACCCGAGGTTTATCCCGACTCGTCACCCTTACCCAATAGACGATTGGGAGAGAAAATTAAGAGA GAGAAAATCAAGAGAGAGAAACTGCAAAATAGTTCTGTTTGTTTTTTTCCTGTCAACTTTTTGAATTTCCATAGTGAACAAATTAGGGTTTTCAATCCAT TCTCAATTTTTTTCTCATTCGCTTTGAGACGTTAAGATATTTAATTACACATCGTTATTTATTATCAACGCGATTGAATTTGCGGGTTGTAGTTTTGTAT GATATATAGAGTTTCCTATTTCATGGATGAGATCTGGGAGAGGGCTGTGGAAACGGCGCTTGACGGCGAGACGGACCACGCTTCGGTGCGTACACTAACA CTTGACGGCGCCGTTAAGTGCGTCCAGGGACGGTTACCTCCACCGAGCCTTCTAGAAAGGTTCCAGAACCTTGGACACCTTTCCGTCGCGAATATCGGTG TTTCGTCGCTAGAGCAGTTCCCACGGCTCTCGAATCTTCAGAAGCTTATCCTCTCTGATAACAGGATTGCCGGTGGACTTGAATTTCTCGTCGAAGCGGG CCTTGATTCACTTCGTGACCTTGATTTATCGAACAATCGGATTCAGTTTATTGAAGATCTTGTGCCGCTTGCACAGTTGAAGCTTGTTTCGCTGGATCTG TATGAGTGTCCTGTTACGCGTGTTAAGGACTACCGATCTAGGGTTTTTGGGTTGATTAATTCGCTTAAGTATCTGGATAAGATGGACGCGGAGGAGAATG AGAGGCCGGAGAGTGATGATGAAGATGAGGAGGACGAAGAGGAAGAGGATGATCCTGGTAGTGGAGAGATTGATGGAGAGGATCGGCCTCTTGCGATGAG CAACGGGCATGGGGAGGGAGTGGATGGTGTTGTTGATGTTGATGAGGAAGAGGAGAGTGAGGCTGATGAGGAAGAAGCTGAGACATCGAGGAGGGTTAAT GGGTTGAATCAGGAGAATGGGTTTCGGATGGAGAGTGTGGCATGGGATGAAGAGGATAAGGATGATGATGAAGAAGAGGAAGATGAGATTGATGAAGAGG ACGGGGATGATGATGAGGAAGATGATGATGATGATGATGTTGTTGAGGTTCATGAGATTGTTGACAGTGATGATGATGAGGATGGGGTTGAATTTGATGA GGACGATGATGATGAGGAGGAAGTGGACAATGATGATGTGGAGTTTGTTGGACCGGAGAGTACTGGGCTGTTGACGAGCGAGGAAGTGGACAATGATGAT GGGGTTGAATTTGATGAGGACGATGATGATGAGGAGGAAGTGGACAATGATGATGTGGAGTTTGTTGGACCGGAGAGTACTGGGCTGTTGACGAGCGTGG AAGGGGAGATTGATGGGCACGAGCAGGGGGAGGATGATGAGGACGAATATGACAATGGAGAGACAGGTGAAGATGAGATAGGTGTTGAATATGAAGGAGA GTCTGAAGATGACGAAGAGGATGATGATGAAGTGAGATGATCTTTCCATTGAAACCTTTTTGTCTTATGGTTCTTTTAATTCATGAATTGCATGGCTTTT TATGTGTGTGTGTTTAATTAATTATCTTATTATTTTGTATCTGGTTCTGTGAATTTTTCATTTGTGTATGTTCTTGATTTTGTCAGGTTGCAAAAGAGAA GTTGATATTTATATTTCTATTGAGTGATTGTTGCCATTTGGATAGTTTGCTTGATTAGTGTAATTTCATTTTATTTGTCCCCTCGCCTTTTTAAGCTTGA CTGTGGTGATGAGTTGCCTTGTATATGCTTTTATCAAGTCTATGTTTTATGTTTGTTCTTTTGGTGTGTTCCCTATTCTTAGTTTTATTGTTGTGTCAAT AGCCATCATCATCTGACTGTGTAAATTTTTTACTTGTTGTTTGTTTACCTTAACAATCAGCACCAGTGGCTTGGTTATGAATGACATCTCATCTTTATCC CAAATCTGAGTTTGAATCCCTCCCTTTTTAGCCGACCCCACCAGTGGAACAAAGGCTTATTATATACTGTAGGTAGGGTGCTTATAAAATCTAAAATCTA AAACATTTATACTCACTTAGTCAGGGTGCTTATTTACTGTAGGTTGTTTCCTTTCAACCCAGTGAACAACCAAGCCTTTATCCCATTAGGTTGTTTCCTT TCAATATTCTAAAACAAGATTAAGGCTTGATTATTGTTGTTTGAAGTGGTCAGATAAAAGTAAGTGTTTTTGCATAAAGGGGAAAGAGTGTTGCAGTTGT GTGTCAATTGTGTTCATGCTGTGTACTGGTTTAAGTTCATCATGGCTTTGCTCTCAACCTTTAAATTATTTACTAATTGTGCAGTTTGAAACTCTCATGT TATTTTGCTTCATTGACAATATTATTGAATATAGAAGGTGAACCTCAACACAATGGGAAGGTTGCCTCTTAGTGACCAAGAGGTCACAGATTAAAATCTT GGGTATAGTCTATCTGTTTGATGCATAAGACTGTATATATCTACTCTCCCAATACTCCACTAGGCATGAGATTTAAATGATGTTATTGGTCATGGCTCTA ACTTGCTTGAATTTCAATTTCTATAAGACTCTAATGTTCCTCCTTATTTTTTATCTATCGTTAAAACCTTTTTTCTGTTTATATATATGATATTACTGGA CGGCTTCATGAAACTTAGTGTCAACTGTGTATGCTTTATTTTCTGTCATTAACCCCTTTCGGCTTGCAGATTATATTAACAGTTTTTTAATCAAATTATG GAATTCTTTATTTTGAATTACAGGAAGAAGACTATGGTGCTGGATATCTTGTCCAGCCAGTTGGACAGTCTGAAACAGTCGGTGCTGGTGCTGCTTCCAT GAATGGTGGAGATGATCAGGATGAAGATCTTGATGATGAGGAGGAGGAAGAAGTTGATGATGATGATGCTGAGGTTTTGCCTCCCGCTTCTCCAAACCTT AAGAGAAAGCGTGATGACGATGGTGATGAAGATGACGACAGCGATGAACAATGATGTGGTAACATACACTGAGTCAACTAAGAAGCATGATTGAGACTCC ATTGATATATATCATGTTTCTTCGTTTGTGTTTTTTATGTTGTTTTCTGAGTATTGGCAGCATGGAACCTCACTTTTTTCAGATAGAATTATGTTTAGTC TGTTAGGAATTTAGCACTCTGGAACAGGACATATTAGGTAAAAGAATTGTATGTTATGTGGGAATGTGTTTAGTTCAAAAAGTCGTTTGTGTTTTCTCCC GCTTTTGTTTCACATATAGCCGTTGTTCTCATATTCAAATGGCTGTTAACAGAGGTGATGTTGTGGAACTTGGAGGGAACAAAAGAGTGGGAAAAAAACC CTTTTTTTATTTTACTTTTCGAAACCTTTGTTTATCAAAGTACTTTTGGAGGGAGAACAAGCAAGCTTGTAAAACCTTTTGTAGATAGTTTTAAAAAATT AATGAAAATGATCGAATCAATCAATGTGGATGATTGTTGTAATGACGTGGCTAGTTAATGAATTATTGGCATTGTTACGTGGAGATATTCTCGTATTTAT TATGGTTTGATGACAACAATGGGTGAATGATGCATCATGCATGGTCCTTCGTTAGTAGACAAGTGCAAAGCATGTGACAATGGGGCCCTTGATCTAGGTA TGCCATATTTTTATTATCCATCCAACTCCAACTCTTGATGCTTTTTTCTATTTAATTTTTACAAGTACTAATGAATAAAGTAACTGAGCAATGTCATTCT CCATCAACATAATACAGGTGCTACGTGTTCATGAATTGAGCCTAGGATCTTCAATTGGACGGCGAGATCCGCATCGAAGTTTGCTTGTTATAACGAAACT AATTAAAATTGTTGATCTTAGAAGCGAATCTAAGAAGTCGCGTAAGCCACACGCATGTTCCAAGCTTCAAGTGGCGTGTTCCAAGCCCAAATATGCTATT GGGCCACTCATTCATATGTAGACACCAGAGGAAATGAAAATTTGTACATTGCACCGGTCGTTTACTGAATGAGTATAAATCAAGAGCGGAAACTTAATAT CTAATTGTCTATTATAGTATTAGAAATATTCTAGATATATTTTCAGATGCTAATTTTTCACTTCTTAATTTCATAAACAATGCATGCAGGGTACTTGCCA AGTTAAAAGATTTTGCCATTTTTTTTTTGATGGACTTCAATTTATGGAATGTTTATTATTTTAAAATTTTATCTGTATATATATGTACAATATTCTTACC GATTTATAAATTGTGTATATATATTATAATTTATTTGTTTTGGTTTTGGTCCTTATAAATTCAAAACCTTTTGTTTTAGTCTATACTCAACATTCACACC CTCCAAAAATAAATGTGTATATTTGCTTGGAC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_53433; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_126658
| Blastp | Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32-related protein from Arabidopsis with 69.13% of identity |
|---|---|
| Blastx | Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32-related protein from Arabidopsis with 86.54% of identity |
| Eggnog | Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member(ENOG4111HZT) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT3G50690) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421754.1) |
| Pfam | Leucine-rich repeat (PF14580.5) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |