Ll_transcript_125946

• Id Trinity: FTRINITY_DN55673_c0_g3_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_125946
• Sequence: AGTAATTGCACATTTCCAAACCAAAACCATCAAATCCTAATTCCTTCTCCTAGACGGCGCGAGAAGGATAAGCAGAGAACCACAATGAGAAGCGAGAAGC ACAACCAACCCATGACTACTCACAGGACGATGCATGCAATGATTGAAGTGAAAGCACGATTGCACAAGAGCTAGCCATGGCAACCACAATTAACGACCAT TGAAGATGACGATGGCGATTTCCTCATCGACAAGACAACGACTATGCCCGCCGCGACAATTAGATCCATGGTCAATTTTCCCCATTTAAATTTTCTCTAT TTTCAGTTTACCTAATTTTCCTCATTCTAATTTGCCTAATTTTATTTCCTTAGTTATTTTATCTGAAATTTTCAATAAAGAAGCATGATTTTCCCAAATT TTATTGCCCAATTTGATTTCCCAAATCATACTTTATTTGATTGTCATTACTATATTATAATCTTGTTGCTCTATTTATACTACATCTCCGATTGTATATA TTATATCTATGTTGTTGCTTTCTTTAGATATTGTTGTAGCCCAAACAATTTAGCTTAACAATGTGAATATTATTGATCATGATGTGTTTGTTTCTAATGC TAACACTAGTATAAAATGGAAAGAGTATCAAGAGTTAAATGTCGGAATTTCTTCACAATATTAGAAGACTTGTTTGATGGGGTTAAAAGAGATGAGTGCA ATACTTGCAATGCATAATGCAAAGTTGATGGTAAAAAGATGGAACATGTTCTATGTCTCACCTCTTAGATGATTGCTCAAAAACTATGGGTTTAATGATG ATAGATGAATAATTAAGATTGGAGTCTCACATGATAGATCAATTGATATCTTATGACATGTGGGCTTTTGCAATAATTGAACAAGATATGTCATTTAAAT AAGTTGAGTATATAAATATTAGAGTTTGGTTGAAATACTTAAATCGAGATTGTGCTCCTAATACTAGCAATGTTGCAAAGGTTTATGTAATAAAAACTTA CATGTGTGAGTAAGAGAAGCTTCGTGAAGCATTGGCTAGCATTTCTAATAGGCTATACTTAACTTCTTATATGCGGCCAACTTACACTATTGAAGGCTAT TTATATTTGAGTGCTGATTATATTGAGACAAACTATAAATTAAATAGCCAAACTCTCAACTTTTGTCATATGTCTCTTCCTCATATTGGGCCTAAAATGT GTGCAACGGTATTAGAGTTTTTGAAGGGGGGAGAAATTGACAAGAAGATTTGTTGTCTAACTTTGGATACTATAAGTGAAAATGACACCATGGTGAGAAT ATTAAAGATTAAACTTACTCATGAGGATAATGGGTTGGTTGGAAAGTATTTTCTCGTGCGTTGTTATGCACGTCCACTAGAATATATTGTTCAAGATATT ATGAAAGTTTCTAGGGACACCTTGCAGAAAATTGAAGAAAATATCAAATATGTGAAAGATTCGGAAATAAGAAAGATTGCCTTTATGAAATGTATTGCAA AGTGTGGTAGTCTTATTGACTCTTAAACATGGTTGAAACTCGATATGTCTATAAGATTGAATTCAACTTATGTATTGCTTGAAAGTGCTCTCAAATACAA ATATCATTTTAGTAATATTTTAATGCATGATTCTAATTATTGATATTGTCTTTCACAAGAAAATGGACAAGAGTACAATAAACTTGTGATTTCTTGTGAA CATTTTTTTATATTACTGAAATGATCTCTGGTACATAATATTTCACGTCTAACTTATATTTCATGAAAGTTTGGAAAATTGAATGTGTTTTATTTCAAAC TTTAAAAGATGATGAATTCATAAGGGAAATGAGTGAGAAAATGATTGTGAAGTTTGAAAAAGATTAGATGATTATAATGTCGCACTTGCTATAAGAGCAG TTTTAGACCCACAACTGAAATAGGACATGTTGAGATGTTGTTAAATGAAAATTGATTATGTTGTTGTTAATGAAAAGATAGCTTGTGTGAAGTCAAATTT GTACATGTTTTTTTTTATAAGTATATAAGTAATACAAGTAACAATCAATCAAACTACAGTTTGCAAAGCAACATTACAAATGGTCCAATTCCAAGTAGGT GGGGTCCAAGTTCAATCAGAAGAAGCATATTTGATGAAAAAGTACAAGGTTGATTTTACTCACAATTGGTTGCATATTGTATGACTTTGCTCACACTATA TTGGTAGAAAAAATGGTGATAATAGTGATGACAATGAAACTCCTCAACGATGATGGATTGAAGAATCTGAGCTAACCTTATTTTTAGTTGTATTATTTTA GTGCTTGTTAATTATGTCATTTACATTTGGATGATTGGAATTAGAGTATTAGAATTTGTGATTTGTAGGTTGCTAACTATGTGAGCAAGGATTCTCTCTA ATAATTGAGAGGTGAGTGCTTAACTACTTATTTCTCCTTGTATTTTTAATGATAAAAATGTGATTTCATGATAAATAAAAATATAAAAGTGTTATTACAT GCTTGTCTTTTATTTATTCTTGTGTGATACTTGCTTCTTTAGTAATTGAAGATAATTTTTTATTTAAATATGTTATATCTTAGGCTATTGACTTGTAACC TATTGTTAACTTGTTAATTATGGGGTACTTTATGATTGATTGCACAAACAACTAACATGTTCATCACACCAGCACTTTATGCGTTACTTGGAATTTGTTT TTTAATTGTTTGTACTTGTTATCCTACCCATCTTCGTTATCCCATTTTAAAATTTAGAGATTTACCAACGGGCGTTAGTTCAAGTGGTACATGTTTGATT CCCCTTAAGTAGGGACACGAGTTCGATCCTTGTGGATGGAAAAAATGCTCGCTGAGAGAGTTAGCCTCACATACCTGTGGATGTTCCCGACTCGGAC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_53472;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_125946

FPKM

• FPAB: 2.5
• FPNAB: 2.7
• LF1: 1.9
• LF2: 1.7
• LF3: 2.1
• LF4: 2
• UF1: 2.2
• UF2: 2.3
• UF3: 1.7
• UF4: 2.3

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_125946

• Blastp: Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 from Oryza sativa with 29.55% of identity
• Blastx: Putative AC transposase from Zea with 28.14% of identity
• Eggnog: transposon protein(ENOG410Y37V)
• Kegg: Link to kegg annotations (4334009)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019414580.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;