Ll_transcript_192025

• Id Trinity: FTRINITY_DN55704_c1_g5_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_192025
• Sequence: ACAAAGATATCCATCCCCACTCCATTACAATTCCCTCTTTGACTTCTCTTCCCTCATTCTATTTAATGCACTATTGTTTTTTCTCACATACTATCATGCT TTATTGCCTTTATCTATAGTTGAATATCTTTGCTGGCATAATTGCTACCTCTATAACTAGAAGTGCTAGCAAGCCAAACCATACTCACTAAAAACCAAAG TACACAAAGTAGTGAAACACAAAACAACCCTTTCTTTCTCTTTATCCTTTTCCTTTTCTTTTAGTTAATAGGGCACTTGCATACCCAAAACACAATAAGA ACTGAGAGAGATGAACACTGAACAGTTTCAGAGGAACAACATGTACATAGAAACCCCTGAAGCTTATGGTGATGATGGCAAAAACTTTGATGATGATGGA CGAGCCAAAAGAACTGGAACATGGGTAACTGCAAGTGCTCATATAATAACAGCAGTGATAGGGTCAGGAGTGCTATCTCTTGCATGGGCAATAGCACAAA TGGGATGGGTGGCTGGACCTGTTGTTCTCTTTGCATTCTCATTCATAACATATTTCACTTCCACTCTTCTAGCTGACTGTTATAGGTCACCTGACCCTGT TAATGGCAAAAGAAACTATACCTATTCTCAGGTTGTCAGATCTATATTAGGAGGGAGAAAATTTCAGCTTTGTGGATTGGCTCAGTATATAAATCTTGTA GGTGTAACAATCGGTTACACCATAACAGCTTCAATTAGTATGGTGGCTGTGAAAAGGTCAAATTGTTTTCACAAACATGGCCATCAAGACAAATGCTATA CATCAAATAACCCTTTCATGATCCTCTTTGCATGCATACAAATTATACTTAGCCAAATACCAAACTTCCATAAGCTCTCTTGGCTCTCCATTGTTGCAGC CATTATGTCTTTTGCTTATTCCTCCATTGGTCTTGGCCTCTCAATAGCTAAAGTAGCAACAGGTGGGGAACATGTAAGGACATCTTTAACAGGGGTTCAA GTTGGAGTGGATGTTACAGGATCAGAGAAGGTTTGGAGAACATTTCAAGCTATTGGTGACATAGCTTTTGCTTATGCTTATTCTAATGTGCTTATTGAGA TACAGGCAAGTCATGTTATATTAATATATTGTTATTCATGGATACTTATATATCACCTATGATTTGCATAAAGGGTCATAATATGCATGCCTAAATACAT ATGGAAGAAGTGAAGTTTATTAAGTCCTCAAAATAATATCAATCTGAAATCTAGAATCAATCTTCTATAAAACGTGTGTTATTTCTTCCATTTGCAATGA TATAAGCCCTACCAATAATACAGGCACATATATAAGGGTGAGTTTATTGAATGGAGATCACTTATCCCAAGATTTGGTATCTCATTCTGCACTAATCCAA TCAAAAAGTCCCAACTAATTCATAAAAACAGAAAATAATTTTTTTGCTCACATGTCAAAACATGGTTGGATTGGGGCAGGGGACAAGAATTTGTGTATTG TTTTATTATGACATGTGTATTGTTTTATTATTTTATATAAAAATATTTCTAAAATTAAACAAAATAGTACATACGTCATACTTTTACTTACTATAAAAGA TAAGTTATCTCATTATATGACAAGAAGATACGTTATTCCTTTTTCAATATTGGCATAGCTATATTTTTACACTTCTAAAAGGGTGATGATTGCATGCATT GTTAATCGGTGAGTGCCGTGTAAGAATAGCCATGCGACCTCGTGTGTGGACCAAGTAGCACACTGGGAGTGATGTATTGTTTCTCTTTGCGGTTTTCAAT GAATGCGACTCCTTAAAGTAGCAGAATCTATTCCATAGTCCAAACTAAATATTCTTATCGTCTTTTACTTTTACCTTTTAGTTGAAAAGCTAAAAAGATA AATGATACTTTTTATCAAAAAGTCCTTATTCCTTAATCTAGCTTTGAAAATATGCTAAAGCAAATCATATTCCCCTCCGATTTATCACTAACTTTTTATT ACCTACCTATAAAGATAGGTATAATCAAAGTCTCCCTATACACAATATTAACCATTAAATGCAAGGACCGCTATCTGGCACAGAAAAATGATAATACATT GATTTAGTACATTTTTTGCCCAAAAATGTTTGGTTGGTTAGAATCTACATTAAAAGTTGAACAATTAAGTATTTTTTTATAATTATAAATAGTAACATAT GAAGTGACACATTTTGAAGACAGAAAATGTACACATATCTTATCCTTTTTTTCTACTATTTAGTTGTCATTTTCTTTCCTTTAACCATCTCATGTGGTCA TTGATAATATATTGTTTTAGAAAAGTGTAACTACCATGAGCTCGCACATCAAAGATATTGTTTCAAGGAAGTCAATATAGGTTAGCTGCATCACATGCTC CAACTATTAAATCCTTTAATATAATAAGAAAAGGCTTCGCATCCATTTATGGGAATCAATTAAGAAATTAGTCTTCAACAACAAGCCTAATGTTGGAAAA TATTAGGTTTCTAAAACATAATTTCAGAAGTTCAATTCTCAACATGAAAAAACTTTGTTAGGATATTCAGTTATAATAATCCACGTACAGTAAATTAAAA TATCTATTCCACATCTTAACTATTCATTCTATGAAAATCTAATAGTTTAGATTTAGTAACTAATTCCAATCATTTAATTTTCTTAGAATAGATGGTTAAA ACTAGAATGTTTTTTTAACTTAATCCAGAACTAGAGTAAGGAGATTCCCTCCCATATCTTCAAAAGAATATTTCAAATATTTGACAAACATCTAAAATGA CCACTTCCATTAGAATATTCTAATGATAATGATTATTATTAATGGCATGTAATAATAATTAGCTTACATGCCCACTATAATGTGAAATTTCAACCATATG ATTGCAGGATACCCTGAAATCAAGTCCTGCTGAGAACAAAGTGATGAAAAGAGCAAGTTTGATTGGTATATTGACTACAACCCTATTTTATGTGCTATGT GGGACCTTAGGCTATGCAGCATTTGGAAACGATGCACCCGGAAATTTCCTCACCGGGTTTGGCTTCTATGAGCCATTTTGGCTAATAGACTTTGCCAATG TCTGCATTGCCATTCACTTAGTTGGGGCATACCAGGTTTTCTGCCAACCCATATTTGGGTTCGTGGAGGGTTGGAGCAAGGAAAAATGGTCTGAGAGCAA ATTTGTAAACGTAGACTATGTTGTGAAGCTTCCACTATGTGGAACATACAACCTAAACTTCTTCAGGATAGTGTGGAGAACAACATATGTTATCATTACT GCAATAATAGCTATGTTGTTTCCATTCTTCAATGACTTCCTTGGCCTGATTGGTTCACTATCCA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_53721;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_192025

FPKM

• FPAB: 1.3
• FPNAB: 0.3
• LF1: 0.1
• LF2: 0.1
• LF3: 0.1
• LF4: 0.3
• UF1: 0
• UF2: 0.1
• UF3: 0.1
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_192025

• Blastp: Amino acid permease 6 from Arabidopsis with 80.15% of identity
• Blastx: Amino acid permease 6 from Arabidopsis with 80.15% of identity
• Eggnog: amino acid transport(COG0814)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G49630)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019438454.1)
• Pfam: Transmembrane amino acid transporter protein (PF01490.17)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;